DNA雙鏈斷裂修復(fù)基因BRCA1 3’UTR SNP影響結(jié)直腸癌易感的相關(guān)性研究
發(fā)布時間:2021-07-05 13:53
目的:在我國近年來的結(jié)直腸癌(colorectal carcinoma,CRC)發(fā)病率及死亡率逐年升高,減少結(jié)直腸癌CRC發(fā)病率及病死率的有效手段是早發(fā)現(xiàn)并早治療。尋找意義確切的與結(jié)直腸癌易感性相關(guān)的易感性生物學(xué)標(biāo)志對其早期預(yù)防有著重要意義。結(jié)直腸癌的發(fā)生發(fā)展是遺傳因素和環(huán)境因素兩者共同作用的結(jié)果。CRC分子病因?qū)W揭示出這種惡性腫瘤是由遺傳損傷積累而發(fā)生發(fā)展的。DNA損傷如果沒有正確修復(fù),進而累積可導(dǎo)致基因組不穩(wěn)定、細(xì)胞衰老或凋亡,并最終可能使生物體易患包括惡性腫瘤在內(nèi)的多種疾病。雙鏈斷裂(double-strand breaks,DSBs)是最為嚴(yán)重的DNA損傷類型之一,對其有效的修復(fù)是保持基因組穩(wěn)定性的重要機制。采用生物信息學(xué)技術(shù)開展本次研究以DSBR(DNA雙鏈斷裂修復(fù))修復(fù)系統(tǒng)如HR(同源重組)修復(fù)中的RAD51和BRCA1等以及NHEJ(非同源末端鏈接)修復(fù)中的XRCC4、XRCC5等擇取為靶目標(biāo)基因,又以本次研究選取的CRC病例數(shù)以及MAF值(最小等位基因頻率)選擇靶目標(biāo)基因3’UTR區(qū)位置的SNP。并依據(jù)結(jié)直腸癌病例-對照研究求證已選的SNP和CRC發(fā)病風(fēng)險的聯(lián)系,選用生...
【文章來源】:中國醫(yī)科大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】:56 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
DNA雙鏈斷裂修復(fù)中HR及NHEJ機制圖
中國醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文113.2病例對照研究3.2.1結(jié)直腸癌病例與對照的匹配臨床收集CRC病例202例,依據(jù)性別年齡1:1匹配正常健康對照202例:性別一致;年齡差低于2歲。病例組診斷時的平均年齡為62.18歲,對照組平均年齡為61.59歲,差異不具有統(tǒng)計學(xué)意義。表3.7病例對照的人口學(xué)特征變量CRC病例(n=202)對照(n=202)P年齡62.18±12.63761.59±13.1530.717男62.35±12.93761.22±13.8210.666女61.97±13.32262.06±12.3300.984性別1男113(55.5)113(55.5)女89(44.5)89(44.5)3.2.2結(jié)直腸癌病例性別與年齡分布特征我們的研究中,202名CRC病例的年齡主要集中于40-79歲;最大年齡者為84歲,最小年齡者為25歲。病例組發(fā)病年齡的分布描述見圖3.1。圖3.1病例組發(fā)病年齡分布
3.3 生物信息學(xué)預(yù)測與 rs12516 相關(guān)的 miRNA 與 LncRNA3.3.1 SNP 多態(tài)性對 BRCA1 的 m RNA 二級結(jié)構(gòu)影響RNAfold 網(wǎng)站預(yù)測 rs12516 多態(tài)能否改變 BRCA1mRNA 二級結(jié)構(gòu)。通過應(yīng)用生物信息學(xué)方法對二級結(jié)構(gòu)的預(yù)測,我們觀察到了 G 等位基因與 A 等位基因相比結(jié)構(gòu)特征發(fā)生變化(圖 3.2)
【參考文獻】:
期刊論文
[1]中國結(jié)直腸癌篩查的研究歷史現(xiàn)狀與展望[J]. 張政,李鵬,張澍田. 中國實用內(nèi)科雜志. 2018(09)
碩士論文
[1]DNA修復(fù)基因XPD、XPC、XRCC4基因多態(tài)性與結(jié)直腸癌易感性的相關(guān)性研究[D]. 張莎.山東大學(xué) 2017
本文編號:3266193
【文章來源】:中國醫(yī)科大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】:56 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
DNA雙鏈斷裂修復(fù)中HR及NHEJ機制圖
中國醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文113.2病例對照研究3.2.1結(jié)直腸癌病例與對照的匹配臨床收集CRC病例202例,依據(jù)性別年齡1:1匹配正常健康對照202例:性別一致;年齡差低于2歲。病例組診斷時的平均年齡為62.18歲,對照組平均年齡為61.59歲,差異不具有統(tǒng)計學(xué)意義。表3.7病例對照的人口學(xué)特征變量CRC病例(n=202)對照(n=202)P年齡62.18±12.63761.59±13.1530.717男62.35±12.93761.22±13.8210.666女61.97±13.32262.06±12.3300.984性別1男113(55.5)113(55.5)女89(44.5)89(44.5)3.2.2結(jié)直腸癌病例性別與年齡分布特征我們的研究中,202名CRC病例的年齡主要集中于40-79歲;最大年齡者為84歲,最小年齡者為25歲。病例組發(fā)病年齡的分布描述見圖3.1。圖3.1病例組發(fā)病年齡分布
3.3 生物信息學(xué)預(yù)測與 rs12516 相關(guān)的 miRNA 與 LncRNA3.3.1 SNP 多態(tài)性對 BRCA1 的 m RNA 二級結(jié)構(gòu)影響RNAfold 網(wǎng)站預(yù)測 rs12516 多態(tài)能否改變 BRCA1mRNA 二級結(jié)構(gòu)。通過應(yīng)用生物信息學(xué)方法對二級結(jié)構(gòu)的預(yù)測,我們觀察到了 G 等位基因與 A 等位基因相比結(jié)構(gòu)特征發(fā)生變化(圖 3.2)
【參考文獻】:
期刊論文
[1]中國結(jié)直腸癌篩查的研究歷史現(xiàn)狀與展望[J]. 張政,李鵬,張澍田. 中國實用內(nèi)科雜志. 2018(09)
碩士論文
[1]DNA修復(fù)基因XPD、XPC、XRCC4基因多態(tài)性與結(jié)直腸癌易感性的相關(guān)性研究[D]. 張莎.山東大學(xué) 2017
本文編號:3266193
本文鏈接:http://sikaile.net/kejilunwen/jiyingongcheng/3266193.html
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