響應柑橘潰瘍病菌侵染的枸櫞C-05抗性基因PR4A的鑒定
發(fā)布時間：2021-07-04 00:54
柑橘潰瘍病是一種危害全球所有商業(yè)化柑橘品種的世界性檢疫性病害,感染柑橘潰瘍病后,將導致柑橘樹葉片提前脫落,使柑橘減產(chǎn),是對柑橘產(chǎn)業(yè)最具毀滅性危害的病害之一。目前還未發(fā)現(xiàn)完全治愈柑橘潰瘍病的方法,生產(chǎn)上通常采用銅制劑抑制柑橘潰瘍病菌生長來控制柑橘潰瘍病的傳播,因此,抗病育種成為輔助柑橘產(chǎn)業(yè)抵抗柑橘潰瘍病的關(guān)鍵方法。經(jīng)全球?qū)俜N柑橘種質(zhì)的篩選,發(fā)現(xiàn)了部分耐柑橘潰瘍病的種質(zhì),但未能得到抗病的資源,本課題組經(jīng)近十年篩選,獲得了對柑橘潰瘍病具有穩(wěn)定抗性的柑橘種質(zhì)——枸櫞C-05,為將其應用到柑橘的抗病育種中,需先探明其對柑橘潰瘍病的抗性機制。本研究以抗病種質(zhì)枸櫞C-05為試驗材料,不同的感病種質(zhì)作為對照,篩選與枸櫞C-05抗柑橘潰瘍病相關(guān)的PR4基因,并分析其在枸櫞C-05抗病反應中對柑橘潰瘍病菌的響應機制。主要研究結(jié)論如下:1.通過冰糖橙及枸櫞C-05的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)對比分析,發(fā)現(xiàn)PR1-1、PR2-1、PR2-3、PR3-1和PR8-2基因可能參與枸櫞C-05對Xcc的抗病反應,而PR4-5在枸櫞C-05受Xcc侵染后具有特異的上調(diào)表達,且在接種Xcc后6 d-12 d一直處于高表達狀態(tài),初步...
【文章來源】：湖南農(nóng)業(yè)大學湖南省
【文章頁數(shù)】：93 頁
【學位級別】：碩士
【部分圖文】：
枸櫞C-05轉(zhuǎn)錄組測序中PR基因的差異表達分析
湖南農(nóng)業(yè)大學碩士學位論文20圖2-3枸櫞C-05及冰糖橙中PR基因的比較分析JYC-05：枸櫞C-05轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中該基因受Xcc誘導表達量變化；BTC：冰糖橙轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中該基因受Xcc誘導表達量變化；JYC-05Xoo：枸櫞C-05轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中該基因受Xoo誘導表達量變化；BTCXoo：冰糖橙轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中該基因受Xoo誘導表達量變化Figure2-3TranscriptomicprofilingofPRgenesbetweenCitronC-05and‘Bingtang’sweetorange
第三章柑橘PR4基因?qū)Ω涕贊儾【憫磉_分析27表3-4甜橙基因組PR4基因Table3-4ThePR4genesofsweetorange基因Gene基因編號GeneID轉(zhuǎn)錄本數(shù)NumberofTranscripts內(nèi)含子數(shù)NumberofIntrons外顯子數(shù)NumberofExon蛋白大小ProteinSizePR4-1Cs8g13680112143aaPR4-2Cs8g13700112241aaPR4-3Cs8g13710112194aaPR4-4Cs8g13730112210aaPR4-5PR4ACs8g13740112200aa圖3-1CsPR4基因染色體定位及基因結(jié)構(gòu)Figure3-1LocalizationsofPR4genesonchromosomeandthestructureofPR4s5個不同的PR4基因均含有2個外顯子和1個內(nèi)含子（圖3-1B，表3-4），甜橙中PR4-1、PR4-2、PR4-3、PR4-4和PR4A基因的gDNA總大小分別為524bp、523bp、1194bp、1082bp和602bp，5個PR4基因編碼的PR4蛋白大小分別為143aa、141aa、194aa、194aa和144aa。其中PR4-3蛋白與PR4-4蛋白氨基酸序列間相似度有97.4%，PR4-1蛋白與PR4-2蛋白氨基酸序列間相似度有83.9%，而PR4A蛋白與PR4-1、PR4-2、PR4-3和PR4-4均有較大差異，相似度分別為71.5%、65.3%、49%和47.9%（圖3-2）。PR4蛋白家族有兩類蛋白，兩類蛋白均含有參與植物防御反應的Barwin結(jié)構(gòu)域。兩類蛋白的差異在于是否含有Hevein結(jié)構(gòu)域（幾丁質(zhì)結(jié)合域），第一類蛋白含有幾丁AB
【參考文獻】：
期刊論文
[1]根際促生解淀粉芽胞桿菌SQR9對香蕉根系分泌物響應的轉(zhuǎn)錄組分析[J]. 羅興,馮海超,夏麗明,張瑞福,余光輝,沈其榮,張楠. 南京農(nóng)業(yè)大學學報. 2019(01)
[2]青梗花椰菜和白�；ㄒ宿D(zhuǎn)錄組分析[J]. 林琿,薛珠政,李永平,李大忠,劉建汀,朱海生,溫慶放. 核農(nóng)學報. 2018(09)
[3]柑橘潰瘍病菌分化及防治研究進展[J]. 姚廷山,周彥,周常勇. 園藝學報. 2015(09)
碩士論文
[1]響應柑橘黃龍病的MAPK基因和PR基因鑒定及遺傳轉(zhuǎn)化[D]. 王苗苗.西南大學 2018
本文編號：3263695
【文章來源】：湖南農(nóng)業(yè)大學湖南省
【文章頁數(shù)】：93 頁
【學位級別】：碩士
【部分圖文】：
枸櫞C-05轉(zhuǎn)錄組測序中PR基因的差異表達分析
湖南農(nóng)業(yè)大學碩士學位論文20圖2-3枸櫞C-05及冰糖橙中PR基因的比較分析JYC-05：枸櫞C-05轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中該基因受Xcc誘導表達量變化；BTC：冰糖橙轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中該基因受Xcc誘導表達量變化；JYC-05Xoo：枸櫞C-05轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中該基因受Xoo誘導表達量變化；BTCXoo：冰糖橙轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中該基因受Xoo誘導表達量變化Figure2-3TranscriptomicprofilingofPRgenesbetweenCitronC-05and‘Bingtang’sweetorange
第三章柑橘PR4基因?qū)Ω涕贊儾【憫磉_分析27表3-4甜橙基因組PR4基因Table3-4ThePR4genesofsweetorange基因Gene基因編號GeneID轉(zhuǎn)錄本數(shù)NumberofTranscripts內(nèi)含子數(shù)NumberofIntrons外顯子數(shù)NumberofExon蛋白大小ProteinSizePR4-1Cs8g13680112143aaPR4-2Cs8g13700112241aaPR4-3Cs8g13710112194aaPR4-4Cs8g13730112210aaPR4-5PR4ACs8g13740112200aa圖3-1CsPR4基因染色體定位及基因結(jié)構(gòu)Figure3-1LocalizationsofPR4genesonchromosomeandthestructureofPR4s5個不同的PR4基因均含有2個外顯子和1個內(nèi)含子（圖3-1B，表3-4），甜橙中PR4-1、PR4-2、PR4-3、PR4-4和PR4A基因的gDNA總大小分別為524bp、523bp、1194bp、1082bp和602bp，5個PR4基因編碼的PR4蛋白大小分別為143aa、141aa、194aa、194aa和144aa。其中PR4-3蛋白與PR4-4蛋白氨基酸序列間相似度有97.4%，PR4-1蛋白與PR4-2蛋白氨基酸序列間相似度有83.9%，而PR4A蛋白與PR4-1、PR4-2、PR4-3和PR4-4均有較大差異，相似度分別為71.5%、65.3%、49%和47.9%（圖3-2）。PR4蛋白家族有兩類蛋白，兩類蛋白均含有參與植物防御反應的Barwin結(jié)構(gòu)域。兩類蛋白的差異在于是否含有Hevein結(jié)構(gòu)域（幾丁質(zhì)結(jié)合域），第一類蛋白含有幾丁AB
【參考文獻】：
期刊論文
[1]根際促生解淀粉芽胞桿菌SQR9對香蕉根系分泌物響應的轉(zhuǎn)錄組分析[J]. 羅興,馮海超,夏麗明,張瑞福,余光輝,沈其榮,張楠. 南京農(nóng)業(yè)大學學報. 2019(01)
[2]青梗花椰菜和白�；ㄒ宿D(zhuǎn)錄組分析[J]. 林琿,薛珠政,李永平,李大忠,劉建汀,朱海生,溫慶放. 核農(nóng)學報. 2018(09)
[3]柑橘潰瘍病菌分化及防治研究進展[J]. 姚廷山,周彥,周常勇. 園藝學報. 2015(09)
碩士論文
[1]響應柑橘黃龍病的MAPK基因和PR基因鑒定及遺傳轉(zhuǎn)化[D]. 王苗苗.西南大學 2018
本文編號：3263695
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