原發(fā)性青光眼易感基因的多態(tài)性分析
發(fā)布時(shí)間:2021-07-04 00:25
目的:近來全基因組關(guān)聯(lián)分析報(bào)道了三個(gè)與原發(fā)性閉角型青光眼(primary angle closure glaucoma,PACG)有顯著關(guān)聯(lián)的單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)新位點(diǎn),即PLEKHA7基因的SNP位點(diǎn)rs11024102、COL11A1基因的SNP位點(diǎn)rs3753841及PCMTD1-ST18基因的SNP位點(diǎn)rs1015213。本研究旨在探討四川地區(qū)漢族人群PACG與這些SNPs的關(guān)聯(lián)性。方法:收集四川地區(qū)已明確診斷的PACG患者362例以及與之年齡、性別及民族相匹配的1056例四川地區(qū)的正常對照人群的外周血各5ml并提取基因組DNA,通過聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)法擴(kuò)增目的DNA片段,用單堿基延伸(SNaPshot)法對已報(bào)道的這3個(gè)SNPs位點(diǎn)進(jìn)行基因分型,并進(jìn)行病例-對照關(guān)聯(lián)分析。結(jié)果:Rs11024102(PLEKHA7)CC、CT、TT基因型的頻率在病例組分別為18.6%、47.2%、34.2%,在對照組分別為19.9%、48.6%、31.4%;rs3753841(COL11A1)CC、CT、TT基因型的頻率在...
【文章來源】:西南醫(yī)科大學(xué)四川省
【文章頁數(shù)】:77 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
PACG病人視野圖,視野有明顯缺損Figure1.2VisionfigureofPACGpatients
純合子 CC 純合子 TT 雜合子 CT圖 1.3 SNPs 位點(diǎn) rs11024102、rs3753841 和 rs1015213 結(jié)果分析Figure 1.3 Results of rs11024102、rs3753841 and rs1015213 SNPs analysis2.9 PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物測序驗(yàn)證為保證 SNapShot 單堿基延伸法基因分型結(jié)果可靠性,隨機(jī)抽取實(shí)驗(yàn)組和對照組純化后的 PCR 產(chǎn)物各 96 份,用 PLEKHA7、COL11A1與 PCMTD1-ST18 基因 SNPs 位點(diǎn)正反向引物 Sanger 法直接雙向測序驗(yàn)證結(jié)果。2.9.1 Sanger 法雙向測序1)配制測序熒光 PCR 反應(yīng)體系:
圖2.1 CAT 基因相關(guān) SNPs 位點(diǎn)連鎖不平衡ge disequilibrium analysis of CAT gene releCAT 基因在中國 POAG 人群中單體型分析aplotype association with POAG in Chinese頻率(病例組/對照組) χ2 檢 0.495, 0.455 0.5 0.257, 0.269 0.0 0.238, 0.251 0.0 0.012, 0.025 0.9
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]LOXL1基因多態(tài)性與四川地區(qū)原發(fā)性開角型青光眼的關(guān)聯(lián)研究[J]. 龔波,李秀蘭,李寧,郝芳,陳蓉,曾光群,張丁丁. 中華醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)雜志. 2015 (01)
[2]Six1基因與聽覺系統(tǒng)發(fā)生及疾病的關(guān)系[J]. 楊文飛,黃建民. 生命的化學(xué). 2011(01)
[3]GWAS在2型糖尿病相關(guān)基因研究中的應(yīng)用[J]. 楊雨晗,李亞. 中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào). 2010(07)
[4]全基因組關(guān)聯(lián)分析的進(jìn)展與反思[J]. 凃欣,石立松,汪樊,王擎. 生理科學(xué)進(jìn)展. 2010(02)
[5]安徽省桐城縣青光眼流行病學(xué)調(diào)查[J]. 高宗峰. 中華眼科雜志. 1995(02)
[6]廣東省斗門縣原發(fā)性閉角型青光眼流行病學(xué)調(diào)查[J]. 于強(qiáng),許京京,朱斯平,柳青. 中華眼科雜志. 1995(02)
本文編號(hào):3263649
【文章來源】:西南醫(yī)科大學(xué)四川省
【文章頁數(shù)】:77 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
PACG病人視野圖,視野有明顯缺損Figure1.2VisionfigureofPACGpatients
純合子 CC 純合子 TT 雜合子 CT圖 1.3 SNPs 位點(diǎn) rs11024102、rs3753841 和 rs1015213 結(jié)果分析Figure 1.3 Results of rs11024102、rs3753841 and rs1015213 SNPs analysis2.9 PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物測序驗(yàn)證為保證 SNapShot 單堿基延伸法基因分型結(jié)果可靠性,隨機(jī)抽取實(shí)驗(yàn)組和對照組純化后的 PCR 產(chǎn)物各 96 份,用 PLEKHA7、COL11A1與 PCMTD1-ST18 基因 SNPs 位點(diǎn)正反向引物 Sanger 法直接雙向測序驗(yàn)證結(jié)果。2.9.1 Sanger 法雙向測序1)配制測序熒光 PCR 反應(yīng)體系:
圖2.1 CAT 基因相關(guān) SNPs 位點(diǎn)連鎖不平衡ge disequilibrium analysis of CAT gene releCAT 基因在中國 POAG 人群中單體型分析aplotype association with POAG in Chinese頻率(病例組/對照組) χ2 檢 0.495, 0.455 0.5 0.257, 0.269 0.0 0.238, 0.251 0.0 0.012, 0.025 0.9
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]LOXL1基因多態(tài)性與四川地區(qū)原發(fā)性開角型青光眼的關(guān)聯(lián)研究[J]. 龔波,李秀蘭,李寧,郝芳,陳蓉,曾光群,張丁丁. 中華醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)雜志. 2015 (01)
[2]Six1基因與聽覺系統(tǒng)發(fā)生及疾病的關(guān)系[J]. 楊文飛,黃建民. 生命的化學(xué). 2011(01)
[3]GWAS在2型糖尿病相關(guān)基因研究中的應(yīng)用[J]. 楊雨晗,李亞. 中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào). 2010(07)
[4]全基因組關(guān)聯(lián)分析的進(jìn)展與反思[J]. 凃欣,石立松,汪樊,王擎. 生理科學(xué)進(jìn)展. 2010(02)
[5]安徽省桐城縣青光眼流行病學(xué)調(diào)查[J]. 高宗峰. 中華眼科雜志. 1995(02)
[6]廣東省斗門縣原發(fā)性閉角型青光眼流行病學(xué)調(diào)查[J]. 于強(qiáng),許京京,朱斯平,柳青. 中華眼科雜志. 1995(02)
本文編號(hào):3263649
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