目的運(yùn)用生物信息學(xué)方法篩選及鑒定腎透明細(xì)胞癌（ccRCC）相關(guān)的潛在靶基因及信號(hào)通路。方法在GEO網(wǎng)站搜索基因芯片GSE40435、GSE53757、GSE46699和GSE16441的數(shù)據(jù)集,用GEO2R識(shí)別ccRCC和正常腎組織之間的差異表達(dá)基因,并對(duì)4組數(shù)據(jù)的共同差異表達(dá)基因進(jìn)行聚類分析。然后用DAVID網(wǎng)站對(duì)差異基因進(jìn)行基因本體（gene ontology）分析和KEGG通路富集分析,最后用STRING網(wǎng)站和Cytoscape軟件構(gòu)建蛋白-蛋白互作（PPI）網(wǎng)絡(luò),同時(shí)從中篩選出最具有意義的模塊及核心基因。結(jié)果與正常腎組織相比,共計(jì)101個(gè)基因在4組ccRCC中差異表達(dá),其中33個(gè)基因高表達(dá),68個(gè)基因低表達(dá)�；虮倔w分析顯示大部分差異表達(dá)基因在脂質(zhì)代謝、跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)、通道活性和胞外區(qū)中顯著富集,信號(hào)通路分析表明差異表達(dá)基因在代謝和黏附分子信號(hào)途徑中有共同的通路。從PPI網(wǎng)絡(luò)中共挑選出的10個(gè)核心基因全部都參與黏著斑信號(hào)通路。結(jié)論被鑒定出的10個(gè)核心基因很可能在ccRCC的發(fā)病過程中發(fā)揮重要的作用,這些基因可能成為治療的新靶點(diǎn)。 

【文章來源】：現(xiàn)代泌尿外科雜志. 2020,25(12)

【文章頁數(shù)】：8 頁

【部分圖文】：

共同差異表達(dá)基因DEGs圖

以GSE16441為參考所繪DEGs熱圖

三個(gè)功能組的基因表達(dá)量圖


本文編號(hào)：3261536