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結(jié)直腸癌組織中CD133及LGR5蛋白的表達(dá)及差異表達(dá)基因分析

發(fā)布時(shí)間:2021-06-30 21:42
  目的研究結(jié)直腸癌組織CD133和LGR5蛋白以及差異表達(dá)基因的表達(dá)情況。方法采用免疫組化法檢測正常結(jié)直腸、結(jié)直腸息肉、結(jié)直腸癌組織中CD133和LGR5蛋白表達(dá)水平。采用生物信息學(xué)手段分析結(jié)直腸癌細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),進(jìn)行差異表達(dá)基因篩選、GO分析及KEGG分析,分析CD133及LGR5基因在結(jié)直腸癌、大腸癌及結(jié)直腸癌伴肝轉(zhuǎn)移細(xì)胞中的表達(dá)情況,以及結(jié)直腸癌患者預(yù)后生存率。結(jié)果與正常結(jié)直腸組織和息肉組織比較,結(jié)直腸癌組織中CD133及LGR5蛋白的表達(dá)均明顯升高(P<0.05)。分析GSE2509數(shù)據(jù)庫的轉(zhuǎn)錄組表達(dá)譜共篩選到1 265個(gè)差異表達(dá)基因,其中,與結(jié)腸癌SW480細(xì)胞系相比,CD133和LGR5基因在強(qiáng)侵襲性的結(jié)腸癌SW620細(xì)胞系中均呈高表達(dá)。分析GSE21510的轉(zhuǎn)錄表達(dá)譜,與正常對(duì)照相比,結(jié)直腸癌細(xì)胞的CD133及LGR5基因亦呈高表達(dá)。對(duì)GSE72718數(shù)據(jù)庫的表達(dá)譜數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,比較原發(fā)性結(jié)直腸癌細(xì)胞以及結(jié)直腸癌伴肝轉(zhuǎn)移細(xì)胞的表達(dá)譜,其中CD133基因差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),LGR5基因差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。對(duì)GSE12945數(shù)據(jù)庫中... 

【文章來源】:檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)與臨床. 2020,17(20)

【文章頁數(shù)】:5 頁

【部分圖文】:

結(jié)直腸癌組織中CD133及LGR5蛋白的表達(dá)及差異表達(dá)基因分析


免疫組化法分析CD133蛋白在正常結(jié)直腸、結(jié)直腸息肉、結(jié)直腸癌組織的表達(dá)情況

直腸癌,直腸,免疫組化法,蛋白


通過免疫組化染色,觀察正常結(jié)直腸、結(jié)直腸息肉、結(jié)直腸癌組織中LGR5蛋白的表達(dá)。結(jié)果表明,LGR5蛋白在正常結(jié)直腸組織中陽性率為41.6%(5例),在結(jié)直腸息肉組織為50.0%(6例)。但是在結(jié)直腸癌組織中,其陽性率為69.2%(9例),高于正常結(jié)直腸組織、結(jié)直腸息肉組織,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。見圖2。2.2 信息技術(shù)分析、篩選結(jié)直腸癌相關(guān)的差異表達(dá)基因

基因,數(shù)據(jù)庫,直腸癌,信息技術(shù)


GES21510、GES72718數(shù)據(jù)庫中差異表達(dá)基因分析


本文編號(hào):3258546

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