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超表達(dá)AtHARBI1-2對(duì)轉(zhuǎn)基因擬南芥生長(zhǎng)發(fā)育的影響

發(fā)布時(shí)間:2021-06-22 18:17
  HARBI1(Harbinger Transposase Derived 1)蛋白起源于脊椎動(dòng)物共同祖先(硬骨魚綱)中的活躍的Harbinger轉(zhuǎn)座酶,是迄今唯一已知的與PIF/Harbinger轉(zhuǎn)座元件同源的脊椎動(dòng)物基因,編碼350個(gè)氨基酸。HARBI1是DDE轉(zhuǎn)座酶,屬于DDETnp4家族蛋白,該家族成員的蛋白分子結(jié)構(gòu)特征為具有三個(gè)高度保守的親核氨基酸殘基,包括兩個(gè)天冬氨酸殘基(D)和一個(gè)谷氨酸殘基(E)。HARBI1包含有DDE轉(zhuǎn)座酶的共同特征,能夠?qū)崿F(xiàn)轉(zhuǎn)座元件位移的反應(yīng),是催化DNA斷裂和重組的關(guān)鍵蛋白。本研究是在中間錦雞兒CiHA見B11基因的研究基礎(chǔ)上展開的。為驗(yàn)證更進(jìn)一步研究HARBI1在植物中的功能及其作用機(jī)制,本實(shí)驗(yàn)選取擬南芥(Arabidopsisthaliana)中的同源基因AtH4RBI1-2進(jìn)行了功能分析。主要結(jié)果如下:1.從擬南芥中克隆得到多脅迫響應(yīng)的DDETnp4家族基因AtHARBI1-2。其cDNA長(zhǎng)度為1509bp,編碼502個(gè)氨基酸,蛋白的分子量預(yù)測(cè)為56.82... 

【文章來(lái)源】:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)內(nèi)蒙古自治區(qū)

【文章頁(yè)數(shù)】:59 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

超表達(dá)AtHARBI1-2對(duì)轉(zhuǎn)基因擬南芥生長(zhǎng)發(fā)育的影響


圖2?IAA生物合成途徑??Fig.2?The?IAA?biosynthesis?pathway??生長(zhǎng)素極性轉(zhuǎn)運(yùn)對(duì)葉片及其葉脈的發(fā)育至關(guān)重要

技術(shù)路線圖,技術(shù)路線


?內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文?21??1.5創(chuàng)新點(diǎn)??HARBI1只在動(dòng)物中有研宄,在劉建政之前,它在植物中的研宄還未見報(bào)道,本??實(shí)驗(yàn)以劉建政的研宄為基礎(chǔ),更進(jìn)一步研究HARBI1在植物中的功能及其作用機(jī)制。??1.6技術(shù)路線??f擬南芥RNA、 ̄??.DNA轉(zhuǎn)取??:?T????士產(chǎn)、十卩f?AlHARBIl-2?]、「不同脅迫處理下的基??|生物fe息子分析卜?1?cDNA的克隆?"因表達(dá)模式分析??.?i?^?T-?;????(?'??突變體的PC?R鑒定?過(guò)表達(dá)載體的構(gòu)建??.??^?V?■/??三引物法?[遺傳轉(zhuǎn)化及過(guò)裁、??I?、?[株系的纖與觀,??獲得純合突變體j?f?、??—?f表型織??v??????????f生理生化指標(biāo)的檢測(cè)與1??分析??V?J???基因功能分析???S?t??圖4技術(shù)路線??Fig.4?The?technical?route??

疏水性,蛋白,二級(jí)結(jié)構(gòu),蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)


put?for?user_sequence??3??(?,?,?,???Hphob.?/Kyte?&?Doolittle?:??2???.i?I?|?丨丨"??,;f{?"I.獻(xiàn)滅機(jī)dfii?¥??x?I?fullr!?^?'ifiu?'I??,….11...?_丨〖例,十??:liljf?H,:?'?'?:-.J??1?I?.??_4??i?i?I?i?i??0?100?200?300?400?500??Position?■??圖6?AtHARBIl-2蛋白的疏水性預(yù)測(cè)??Fig.6?Prediction?of?hydrophobicity?of?AtHARBIl-2??3.1.3蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)??利用SOPMA對(duì)基因編碼的蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測(cè)分析,預(yù)測(cè)結(jié)??果如圖7所示,AtHARBIl-2的二級(jí)結(jié)構(gòu)中含有由270、163、48、21個(gè)氨基酸形成??的a-螺旋結(jié)構(gòu)、無(wú)規(guī)則卷曲、延伸鏈和(3-轉(zhuǎn)角,所占比例分別為53.78%、32.47%、9.56%??和?4_18%。??19?2&?30?43?S??m??!?i?I?I?I?i?i????EE££VCNV??DS65,V55KRk??e?TK?ii?Kdifnill-*6?gH£?K-QDQ£Af?f^S????hhh??t*?*hhhhhhhhhhhhhhs?hhhhhhKhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh??£^SLpQSrr/fiKR;:.?T^5DV^SDL?r^>;.D;-E£S<sDX^LKKiRvSftAVASVAVAiAS£ie^£SSSITaS5S??

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]細(xì)胞分裂素的生物合成、受體和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的研究進(jìn)展[J]. 羅超,黃世文,王菡,趙露.  特產(chǎn)研究. 2011(02)
[2]生長(zhǎng)素對(duì)擬南芥葉片發(fā)育調(diào)控的研究進(jìn)展[J]. 李林川,瞿禮嘉.  植物學(xué)通報(bào). 2006(05)

博士論文
[1]調(diào)控?cái)M南芥葉早期發(fā)育的重要基因AS1,AS2的克隆及功能分析[D]. 孫越.中國(guó)科學(xué)院研究生院(上海生命科學(xué)研究院) 2002

碩士論文
[1]超表達(dá)中間錦雞兒CiHARBI1基因影響轉(zhuǎn)基因擬南芥子葉形態(tài)建成[D]. 劉建政.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]中間錦雞兒3個(gè)DUF基因的生物信息學(xué)分析和CiDUF966-1基因功能分析[D]. 楊天瑞.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018



本文編號(hào):3243312

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