目的對癌癥疼痛基因進(jìn)行生物信息學(xué)分析和篩選,為癌癥患者的疼痛治療提供依據(jù)。方法從高通量基因表達(dá)（GEO）數(shù)據(jù)庫下載GSE47603數(shù)據(jù)并整理分析,利用BART和Metascape（http://metascape.org/gp/index.html）數(shù)據(jù)庫繪制火山圖、熱圖以及進(jìn)行基因本體（GO）功能注釋和京都基因與基因組百科全書（KEGG）分析,再利用基因、蛋白質(zhì)相互作用關(guān)系檢索工具（String）數(shù)據(jù)庫和Cytoscape軟件進(jìn)行蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用（PPI）和關(guān)鍵基因篩選,最后再利用Oncomine腫瘤芯片數(shù)據(jù)庫對篩選的關(guān)鍵基因進(jìn)行腫瘤相關(guān)分析。結(jié)果通過對GSE47603數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,共得到37個差異基因,其中表達(dá)下調(diào)的基因4個,表達(dá)上調(diào)的基因33個;差異表達(dá)基因的GO功能主要富集在細(xì)胞因子介導(dǎo)、細(xì)胞對γ干擾素反應(yīng)、對外部刺激反應(yīng)的調(diào)節(jié)和神經(jīng)遞質(zhì)的生物合成等上,KEGG主要富集在細(xì)胞因子與細(xì)胞因子受體的相互作用通路、白細(xì)胞介素（IL）-7信號通路和造血細(xì)胞調(diào)節(jié)等通路;通過對差異表達(dá)基因進(jìn)行關(guān)鍵基因篩選得到得分排名居前10位的關(guān)鍵基因分別為非肌性肌球蛋白重鏈9（MYH9）、CXC趨... 

【文章來源】：中國醫(yī)藥指南. 2020,18(28)

【文章頁數(shù)】：4 頁

【部分圖文】：

火山圖和熱圖

關(guān)鍵基因篩選圖表2關(guān)鍵基因得分排名情況排名關(guān)鍵基因得分1MYH97

【參考文獻(xiàn)】：
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