棉屬3-羥基-3-甲基戊二酰輔酶A還原酶(HMGR)基因家族的全基因組鑒定及比較分析
發(fā)布時間:2021-06-18 00:16
萜類化合物是廣泛于存在自然界的一種天然產(chǎn)物,在植物的生長發(fā)育和對環(huán)境的適應性方面起著重要的作用。萜類化合物在植物中主要通過兩種途徑合成,細胞質(zhì)中的MVA途徑和質(zhì)體中的MEP途徑。MVA途徑第一個重要的限速酶是3-羥基-3-甲基戊二酰輔酶A還原酶(HMGR),在細胞質(zhì)萜類化合物生物合成過程中起著關鍵作用。前人研究表明,HMGR基因在雷蒙德氏棉中發(fā)生了擴增,但是HMGR基因家族在棉屬植物中的特征和進化還不明確。基于棉屬中多個棉種已完成全基因組測序,本研究從全基因組水平對雷蒙德氏棉、亞洲棉和陸地棉HMGR基因家族進行鑒定和比較分析,為進一步解析棉屬植物細胞質(zhì)萜類化合物合成提供了有用的信息。主要結果如下:1、利用棉屬的基因組數(shù)據(jù),在雷蒙德氏棉、亞洲棉和陸地棉中分別鑒定出9、9和18個HMGR基因,同時也鑒定了棉屬MVA途徑中其它基因,結果表明只有HMGR基因發(fā)生了顯著的擴增,且均存在一個包括四個緊密相鄰基因的HMGR基因簇。2、對雷蒙德氏棉、亞洲棉和陸地棉中HMGR基因的系統(tǒng)發(fā)育關系、染色體定位、基因結構和蛋白保守結構域進行了分析。結果表明,在雷蒙德氏棉和亞洲棉的祖先種中發(fā)生了片段復制和串聯(lián)復...
【文章來源】:河南農(nóng)業(yè)大學河南省
【文章頁數(shù)】:62 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
植物細胞中MVA途徑和MEP途徑的酶促反應[16]
在線預測工具分別對雷蒙德氏棉 HMGR 蛋白質(zhì)(圖 4.2)、亞洲棉 HMGR 蛋白質(zhì)(圖 4.3)和陸地棉 HMGR 蛋白質(zhì)(圖 4.4)進行預測。結果顯示,N 端的兩次跨膜結構域出現(xiàn)在具有完整開放閱讀框的所有 34 個 HMGR 蛋白質(zhì)中,推測與別的植物中一樣,棉屬 HMGR 基因在進行催化反應時,也需要通過兩次跨膜運動將 HMGR 蛋白錨定在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜上。
雷蒙德氏棉HMGR蛋白質(zhì)的跨膜區(qū)預測
本文編號:3236190
【文章來源】:河南農(nóng)業(yè)大學河南省
【文章頁數(shù)】:62 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
植物細胞中MVA途徑和MEP途徑的酶促反應[16]
在線預測工具分別對雷蒙德氏棉 HMGR 蛋白質(zhì)(圖 4.2)、亞洲棉 HMGR 蛋白質(zhì)(圖 4.3)和陸地棉 HMGR 蛋白質(zhì)(圖 4.4)進行預測。結果顯示,N 端的兩次跨膜結構域出現(xiàn)在具有完整開放閱讀框的所有 34 個 HMGR 蛋白質(zhì)中,推測與別的植物中一樣,棉屬 HMGR 基因在進行催化反應時,也需要通過兩次跨膜運動將 HMGR 蛋白錨定在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜上。
雷蒙德氏棉HMGR蛋白質(zhì)的跨膜區(qū)預測
本文編號:3236190
本文鏈接:http://sikaile.net/kejilunwen/jiyingongcheng/3236190.html
最近更新
教材專著