萜類化合物是廣泛于存在自然界的一種天然產(chǎn)物,在植物的生長(zhǎng)發(fā)育和對(duì)環(huán)境的適應(yīng)性方面起著重要的作用。萜類化合物在植物中主要通過(guò)兩種途徑合成,細(xì)胞質(zhì)中的MVA途徑和質(zhì)體中的MEP途徑。MVA途徑第一個(gè)重要的限速酶是3-羥基-3-甲基戊二酰輔酶A還原酶（HMGR）,在細(xì)胞質(zhì)萜類化合物生物合成過(guò)程中起著關(guān)鍵作用。前人研究表明,HMGR基因在雷蒙德氏棉中發(fā)生了擴(kuò)增,但是HMGR基因家族在棉屬植物中的特征和進(jìn)化還不明確。基于棉屬中多個(gè)棉種已完成全基因組測(cè)序,本研究從全基因組水平對(duì)雷蒙德氏棉、亞洲棉和陸地棉HMGR基因家族進(jìn)行鑒定和比較分析,為進(jìn)一步解析棉屬植物細(xì)胞質(zhì)萜類化合物合成提供了有用的信息。主要結(jié)果如下:1、利用棉屬的基因組數(shù)據(jù),在雷蒙德氏棉、亞洲棉和陸地棉中分別鑒定出9、9和18個(gè)HMGR基因,同時(shí)也鑒定了棉屬M(fèi)VA途徑中其它基因,結(jié)果表明只有HMGR基因發(fā)生了顯著的擴(kuò)增,且均存在一個(gè)包括四個(gè)緊密相鄰基因的HMGR基因簇。2、對(duì)雷蒙德氏棉、亞洲棉和陸地棉中HMGR基因的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系、染色體定位、基因結(jié)構(gòu)和蛋白保守結(jié)構(gòu)域進(jìn)行了分析。結(jié)果表明,在雷蒙德氏棉和亞洲棉的祖先種中發(fā)生了片段復(fù)制和串聯(lián)復(fù)... 

【文章來(lái)源】：河南農(nóng)業(yè)大學(xué)河南省

【文章頁(yè)數(shù)】：62 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

植物細(xì)胞中MVA途徑和MEP途徑的酶促反應(yīng)[16]

在線預(yù)測(cè)工具分別對(duì)雷蒙德氏棉 HMGR 蛋白質(zhì)（圖 4.2）、亞洲棉 HMGR 蛋白質(zhì)（圖 4.3）和陸地棉 HMGR 蛋白質(zhì)（圖 4.4）進(jìn)行預(yù)測(cè)。結(jié)果顯示，N 端的兩次跨膜結(jié)構(gòu)域出現(xiàn)在具有完整開(kāi)放閱讀框的所有 34 個(gè) HMGR 蛋白質(zhì)中，推測(cè)與別的植物中一樣，棉屬 HMGR 基因在進(jìn)行催化反應(yīng)時(shí)，也需要通過(guò)兩次跨膜運(yùn)動(dòng)將 HMGR 蛋白錨定在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜上。

雷蒙德氏棉HMGR蛋白質(zhì)的跨膜區(qū)預(yù)測(cè)


本文編號(hào)：3236190