興安落葉松幾丁質(zhì)酶基因的功能分析
發(fā)布時(shí)間:2021-06-17 10:56
幾丁質(zhì)酶是一種病程相關(guān)蛋白,在植物抵御真菌中發(fā)揮作用。另一方面,該蛋白能夠降低冰點(diǎn),抑制了冰晶的生長(zhǎng)與重結(jié)晶,在植物抵御凍害中發(fā)揮作用。所以,幾丁質(zhì)酶基因?yàn)橹参锏目共『湍秃蜻z傳工程提供了一個(gè)重要的候選基因。本研究通過RNA-Seq技術(shù)獲取了興安落葉松的轉(zhuǎn)錄組,并對(duì)幾丁質(zhì)酶基因家族進(jìn)行分析。利用遺傳轉(zhuǎn)化擬南芥的方法鑒定了前期研究中克隆的興安落葉松幾丁質(zhì)酶基因(Lgchi2)在植物低溫與病害脅迫下發(fā)揮的作用。主要獲得以下結(jié)果:1.利用RNA-Seq技術(shù)對(duì)興安落葉松轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),在興安落葉松中含有7個(gè)幾丁質(zhì)酶基因家族成員,它們參與幾丁質(zhì)結(jié)合、幾丁質(zhì)酶的活性、細(xì)胞代謝過程、甲殼素分解代謝及幾丁質(zhì)酶的防御作用。該結(jié)果為后續(xù)系統(tǒng)分析興安落葉松幾丁質(zhì)酶基因的特征、調(diào)控機(jī)理及生物學(xué)功能奠定了基礎(chǔ)。2.為分析Lgchi基因的功能,通過花絮浸染的方法,獲得了轉(zhuǎn)Lgchi基因的擬南芥株系。低溫脅迫研究顯示,幾丁質(zhì)酶活性隨脅迫時(shí)間的增加呈現(xiàn)出先升高后降低趨勢(shì),轉(zhuǎn)化Lgchia1和Lgchia2基因的擬南芥植株的幾丁質(zhì)酶活性顯著高于野生型,并且轉(zhuǎn)化Lgchia2株系的幾丁質(zhì)酶活性大于轉(zhuǎn)化Lgchia1...
【文章來源】:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)內(nèi)蒙古自治區(qū)
【文章頁數(shù)】:39 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
幾丁質(zhì)酶基因結(jié)構(gòu)
結(jié)果功能注釋及基因表達(dá)和基因表達(dá)差異水平的衡量[48],如圖2-4:圖 2-4 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析流程圖Fig2-4 Transcriptome data analysis flow chart1 GO 功能富集分析??GO(Gene Ontology)[44]是對(duì)基因和蛋白質(zhì)功能進(jìn)行限定和描述, GO 功能富集分析是在 GO 數(shù)據(jù)庫分析可以找出在統(tǒng)計(jì)上,顯著富集的 GO Term,通過該分析能夠獲得該基因的 GO 信息。2 KEGG Pathy way 富集性分析??KEGG 是對(duì)基因功能,基因組信息數(shù)據(jù)庫進(jìn)一步系統(tǒng)分析。以 KEGG 公共數(shù)據(jù)庫為基礎(chǔ),并通過 ID 對(duì)應(yīng)方法找到與之對(duì)應(yīng)的 Pathy way ID,即基因的代謝途徑[44]。3 KOG 富集性分析?KOG 是真核生物直系同源蛋白簇,且典型地保留與原始蛋白有相同的功能[44]。查找方法如上。18
-1 Lgchia2農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化鑒定M:200bp DNA Marker1;農(nóng)桿菌2:農(nóng)桿菌grobacterium transformation Lg、鑒定選、鑒定 轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌 GV3101,南芥 T0代種子,在培擬南芥植株。通過自-2),及對(duì)實(shí)驗(yàn)前期轉(zhuǎn)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]植物低溫脅迫響應(yīng)機(jī)理的研究進(jìn)展[J]. 薛爽,饒麗莎,左丹丹,汪鳳林,林思祖. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(33)
[2]獨(dú)行菜種子轉(zhuǎn)錄組的高通量測(cè)序及分析[J]. 周茜,趙惠新,李萍萍,曾衛(wèi)軍,李艷紅,葛風(fēng)偉,趙君潔,趙和平. 中國(guó)生物工程雜志. 2016(01)
[3]甘蔗幾丁質(zhì)酶基因ScChiⅣ1的克隆、序列分析及其表達(dá)[J]. 許穎,王竹青,吳期濱,陳云,楊春春,馮敏謝,蘇亞春. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2015(06)
[4]油菜溫敏雄性不育系K121S育性轉(zhuǎn)換基因的分子定位[J]. 周筱妍,張傳利,李巖,楊進(jìn)成,李石開,白孟斌,陳升位,彭少丹,林良斌. 分子植物育種. 2015(04)
[5]低溫脅迫對(duì)葡萄枝條抗寒性的影響[J]. 盧精林,李丹,祁曉婷,孫曉燕. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2015(04)
[6]辣椒幾丁質(zhì)酶基因受疫霉菌及灰霉菌侵染時(shí)的表達(dá)變化[J]. 孔維文,閔琪,董京萍,李斌,黃奔立. 揚(yáng)州大學(xué)學(xué)報(bào)(農(nóng)業(yè)與生命科學(xué)版). 2014(03)
[7]轉(zhuǎn)幾丁質(zhì)酶基因煙草對(duì)三種真菌拮抗作用的研究[J]. 閆文慧,王兵,樓康怡,楊星勇,申鴻. 西南師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2014(10)
[8]NO處理對(duì)采后芒果抗氧化酶系統(tǒng)的影響[J]. 陳嬌,袁德保,譚琳,李奕星,李芬芳,鄭曉燕,鄭麗麗,金志強(qiáng). 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(26)
[9]低溫脅迫對(duì)核桃枝條活性氧代謝的影響[J]. 相昆,徐穎,王新亮,李國(guó)田,張美勇. 江西農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2014(01)
[10]甘蔗幾丁質(zhì)酶基因的電子克隆與生物信息學(xué)分析[J]. 蘇亞春,李國(guó)印,闕友雄,郭晉隆,徐景升,許莉萍. 生物信息學(xué). 2011(04)
博士論文
[1]唐古特白刺果實(shí)發(fā)育的差異表達(dá)基因分析及NtUFGT基因的克隆和功能研究[D]. 王佳.內(nèi)蒙古大學(xué) 2016
[2]甘藍(lán)型油菜低溫誘導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄組和蛋白組分析[D]. 杜春芳.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[3]低溫脅迫下甜菜堿對(duì)番茄葉片光合作用的保護(hù)機(jī)制[D]. 衛(wèi)丹丹.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[4]番茄葉綠體DnaJ蛋白SlCDJ2的功能分析[D]. 王國(guó)棟.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[5]西芹種子浸提液對(duì)黃瓜枯萎病菌化感作用及其機(jī)理的研究[D]. 賈俊英.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[6]低溫脅迫與鍛煉對(duì)草莓生理特性的影響和草莓幾丁質(zhì)酶基因的克隆[D]. 羅婭.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
[7]幾丁寡糖結(jié)構(gòu)類似物β-1,3-乙酰氨基葡聚糖的化學(xué)合成及其誘導(dǎo)植物抗病性的研究[D]. 姚艷平.浙江大學(xué) 2006
[8]小麥?zhǔn)軛l銹菌侵染后防衛(wèi)基因的表達(dá)特征及其克隆[D]. 崔素萍.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2005
碩士論文
[1]花椒幾丁質(zhì)酶基因ZaCHIT1克隆及表達(dá)分析[D]. 劉雪薇.貴州大學(xué) 2017
[2]興安落葉松幾丁質(zhì)酶基因的克隆及特性分析[D]. 張麗.內(nèi)蒙古大學(xué) 2016
[3]芍藥種子下胚軸休眠與萌發(fā)相關(guān)調(diào)控基因PlGAI1的克隆及功能分析[D]. 崔金秋.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[4]條紋斑竹鯊肝臟中GSTP1基因的miRNA調(diào)控及其相互作用蛋白的研究[D]. 史心怡.浙江理工大學(xué) 2016
[5]轉(zhuǎn)哈茨木霉雙幾丁質(zhì)酶基因(Ech42+Nag70)提高棉花黃萎病抗性的研究[D]. 辛文慧.浙江大學(xué) 2016
[6]興安落葉松幾丁質(zhì)酶基因的克隆及表達(dá)特性分析[D]. 余利敏.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[7]日本三角渦蟲轉(zhuǎn)錄組、再生表達(dá)譜及小RNA譜的鑒定與分析[D]. 秦云飛.鄭州大學(xué) 2012
[8]小麥幾丁質(zhì)酶基因的檢測(cè)及酶活性測(cè)定[D]. 徐恩靜.安徽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[9]花椰菜菌核病抗性種質(zhì)資源篩選及誘導(dǎo)抗性生理基礎(chǔ)研究[D]. 孫溶溶.浙江大學(xué) 2011
[10]球孢白僵菌幾丁質(zhì)酶基因Bbchit1抗病作用研究[D]. 郭紹輝.西南大學(xué) 2007
本文編號(hào):3235063
【文章來源】:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)內(nèi)蒙古自治區(qū)
【文章頁數(shù)】:39 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
幾丁質(zhì)酶基因結(jié)構(gòu)
結(jié)果功能注釋及基因表達(dá)和基因表達(dá)差異水平的衡量[48],如圖2-4:圖 2-4 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析流程圖Fig2-4 Transcriptome data analysis flow chart1 GO 功能富集分析??GO(Gene Ontology)[44]是對(duì)基因和蛋白質(zhì)功能進(jìn)行限定和描述, GO 功能富集分析是在 GO 數(shù)據(jù)庫分析可以找出在統(tǒng)計(jì)上,顯著富集的 GO Term,通過該分析能夠獲得該基因的 GO 信息。2 KEGG Pathy way 富集性分析??KEGG 是對(duì)基因功能,基因組信息數(shù)據(jù)庫進(jìn)一步系統(tǒng)分析。以 KEGG 公共數(shù)據(jù)庫為基礎(chǔ),并通過 ID 對(duì)應(yīng)方法找到與之對(duì)應(yīng)的 Pathy way ID,即基因的代謝途徑[44]。3 KOG 富集性分析?KOG 是真核生物直系同源蛋白簇,且典型地保留與原始蛋白有相同的功能[44]。查找方法如上。18
-1 Lgchia2農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化鑒定M:200bp DNA Marker1;農(nóng)桿菌2:農(nóng)桿菌grobacterium transformation Lg、鑒定選、鑒定 轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌 GV3101,南芥 T0代種子,在培擬南芥植株。通過自-2),及對(duì)實(shí)驗(yàn)前期轉(zhuǎn)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]植物低溫脅迫響應(yīng)機(jī)理的研究進(jìn)展[J]. 薛爽,饒麗莎,左丹丹,汪鳳林,林思祖. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(33)
[2]獨(dú)行菜種子轉(zhuǎn)錄組的高通量測(cè)序及分析[J]. 周茜,趙惠新,李萍萍,曾衛(wèi)軍,李艷紅,葛風(fēng)偉,趙君潔,趙和平. 中國(guó)生物工程雜志. 2016(01)
[3]甘蔗幾丁質(zhì)酶基因ScChiⅣ1的克隆、序列分析及其表達(dá)[J]. 許穎,王竹青,吳期濱,陳云,楊春春,馮敏謝,蘇亞春. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2015(06)
[4]油菜溫敏雄性不育系K121S育性轉(zhuǎn)換基因的分子定位[J]. 周筱妍,張傳利,李巖,楊進(jìn)成,李石開,白孟斌,陳升位,彭少丹,林良斌. 分子植物育種. 2015(04)
[5]低溫脅迫對(duì)葡萄枝條抗寒性的影響[J]. 盧精林,李丹,祁曉婷,孫曉燕. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2015(04)
[6]辣椒幾丁質(zhì)酶基因受疫霉菌及灰霉菌侵染時(shí)的表達(dá)變化[J]. 孔維文,閔琪,董京萍,李斌,黃奔立. 揚(yáng)州大學(xué)學(xué)報(bào)(農(nóng)業(yè)與生命科學(xué)版). 2014(03)
[7]轉(zhuǎn)幾丁質(zhì)酶基因煙草對(duì)三種真菌拮抗作用的研究[J]. 閆文慧,王兵,樓康怡,楊星勇,申鴻. 西南師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2014(10)
[8]NO處理對(duì)采后芒果抗氧化酶系統(tǒng)的影響[J]. 陳嬌,袁德保,譚琳,李奕星,李芬芳,鄭曉燕,鄭麗麗,金志強(qiáng). 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(26)
[9]低溫脅迫對(duì)核桃枝條活性氧代謝的影響[J]. 相昆,徐穎,王新亮,李國(guó)田,張美勇. 江西農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2014(01)
[10]甘蔗幾丁質(zhì)酶基因的電子克隆與生物信息學(xué)分析[J]. 蘇亞春,李國(guó)印,闕友雄,郭晉隆,徐景升,許莉萍. 生物信息學(xué). 2011(04)
博士論文
[1]唐古特白刺果實(shí)發(fā)育的差異表達(dá)基因分析及NtUFGT基因的克隆和功能研究[D]. 王佳.內(nèi)蒙古大學(xué) 2016
[2]甘藍(lán)型油菜低溫誘導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄組和蛋白組分析[D]. 杜春芳.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[3]低溫脅迫下甜菜堿對(duì)番茄葉片光合作用的保護(hù)機(jī)制[D]. 衛(wèi)丹丹.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[4]番茄葉綠體DnaJ蛋白SlCDJ2的功能分析[D]. 王國(guó)棟.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[5]西芹種子浸提液對(duì)黃瓜枯萎病菌化感作用及其機(jī)理的研究[D]. 賈俊英.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[6]低溫脅迫與鍛煉對(duì)草莓生理特性的影響和草莓幾丁質(zhì)酶基因的克隆[D]. 羅婭.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
[7]幾丁寡糖結(jié)構(gòu)類似物β-1,3-乙酰氨基葡聚糖的化學(xué)合成及其誘導(dǎo)植物抗病性的研究[D]. 姚艷平.浙江大學(xué) 2006
[8]小麥?zhǔn)軛l銹菌侵染后防衛(wèi)基因的表達(dá)特征及其克隆[D]. 崔素萍.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2005
碩士論文
[1]花椒幾丁質(zhì)酶基因ZaCHIT1克隆及表達(dá)分析[D]. 劉雪薇.貴州大學(xué) 2017
[2]興安落葉松幾丁質(zhì)酶基因的克隆及特性分析[D]. 張麗.內(nèi)蒙古大學(xué) 2016
[3]芍藥種子下胚軸休眠與萌發(fā)相關(guān)調(diào)控基因PlGAI1的克隆及功能分析[D]. 崔金秋.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[4]條紋斑竹鯊肝臟中GSTP1基因的miRNA調(diào)控及其相互作用蛋白的研究[D]. 史心怡.浙江理工大學(xué) 2016
[5]轉(zhuǎn)哈茨木霉雙幾丁質(zhì)酶基因(Ech42+Nag70)提高棉花黃萎病抗性的研究[D]. 辛文慧.浙江大學(xué) 2016
[6]興安落葉松幾丁質(zhì)酶基因的克隆及表達(dá)特性分析[D]. 余利敏.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[7]日本三角渦蟲轉(zhuǎn)錄組、再生表達(dá)譜及小RNA譜的鑒定與分析[D]. 秦云飛.鄭州大學(xué) 2012
[8]小麥幾丁質(zhì)酶基因的檢測(cè)及酶活性測(cè)定[D]. 徐恩靜.安徽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[9]花椰菜菌核病抗性種質(zhì)資源篩選及誘導(dǎo)抗性生理基礎(chǔ)研究[D]. 孫溶溶.浙江大學(xué) 2011
[10]球孢白僵菌幾丁質(zhì)酶基因Bbchit1抗病作用研究[D]. 郭紹輝.西南大學(xué) 2007
本文編號(hào):3235063
本文鏈接:http://sikaile.net/kejilunwen/jiyingongcheng/3235063.html
最近更新
教材專著