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興安落葉松幾丁質(zhì)酶基因的功能分析

發(fā)布時(shí)間:2021-06-17 10:56
  幾丁質(zhì)酶是一種病程相關(guān)蛋白,在植物抵御真菌中發(fā)揮作用。另一方面,該蛋白能夠降低冰點(diǎn),抑制了冰晶的生長(zhǎng)與重結(jié)晶,在植物抵御凍害中發(fā)揮作用。所以,幾丁質(zhì)酶基因?yàn)橹参锏目共『湍秃蜻z傳工程提供了一個(gè)重要的候選基因。本研究通過RNA-Seq技術(shù)獲取了興安落葉松的轉(zhuǎn)錄組,并對(duì)幾丁質(zhì)酶基因家族進(jìn)行分析。利用遺傳轉(zhuǎn)化擬南芥的方法鑒定了前期研究中克隆的興安落葉松幾丁質(zhì)酶基因(Lgchi2)在植物低溫與病害脅迫下發(fā)揮的作用。主要獲得以下結(jié)果:1.利用RNA-Seq技術(shù)對(duì)興安落葉松轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),在興安落葉松中含有7個(gè)幾丁質(zhì)酶基因家族成員,它們參與幾丁質(zhì)結(jié)合、幾丁質(zhì)酶的活性、細(xì)胞代謝過程、甲殼素分解代謝及幾丁質(zhì)酶的防御作用。該結(jié)果為后續(xù)系統(tǒng)分析興安落葉松幾丁質(zhì)酶基因的特征、調(diào)控機(jī)理及生物學(xué)功能奠定了基礎(chǔ)。2.為分析Lgchi基因的功能,通過花絮浸染的方法,獲得了轉(zhuǎn)Lgchi基因的擬南芥株系。低溫脅迫研究顯示,幾丁質(zhì)酶活性隨脅迫時(shí)間的增加呈現(xiàn)出先升高后降低趨勢(shì),轉(zhuǎn)化Lgchia1和Lgchia2基因的擬南芥植株的幾丁質(zhì)酶活性顯著高于野生型,并且轉(zhuǎn)化Lgchia2株系的幾丁質(zhì)酶活性大于轉(zhuǎn)化Lgchia1... 

【文章來源】:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)內(nèi)蒙古自治區(qū)

【文章頁數(shù)】:39 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

興安落葉松幾丁質(zhì)酶基因的功能分析


幾丁質(zhì)酶基因結(jié)構(gòu)

流程圖,轉(zhuǎn)錄組,數(shù)據(jù)分析,流程圖


結(jié)果功能注釋及基因表達(dá)和基因表達(dá)差異水平的衡量[48],如圖2-4:圖 2-4 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析流程圖Fig2-4 Transcriptome data analysis flow chart1 GO 功能富集分析??GO(Gene Ontology)[44]是對(duì)基因和蛋白質(zhì)功能進(jìn)行限定和描述, GO 功能富集分析是在 GO 數(shù)據(jù)庫分析可以找出在統(tǒng)計(jì)上,顯著富集的 GO Term,通過該分析能夠獲得該基因的 GO 信息。2 KEGG Pathy way 富集性分析??KEGG 是對(duì)基因功能,基因組信息數(shù)據(jù)庫進(jìn)一步系統(tǒng)分析。以 KEGG 公共數(shù)據(jù)庫為基礎(chǔ),并通過 ID 對(duì)應(yīng)方法找到與之對(duì)應(yīng)的 Pathy way ID,即基因的代謝途徑[44]。3 KOG 富集性分析?KOG 是真核生物直系同源蛋白簇,且典型地保留與原始蛋白有相同的功能[44]。查找方法如上。18

農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化,農(nóng)桿菌


-1 Lgchia2農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化鑒定M:200bp DNA Marker1;農(nóng)桿菌2:農(nóng)桿菌grobacterium transformation Lg、鑒定選、鑒定 轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌 GV3101,南芥 T0代種子,在培擬南芥植株。通過自-2),及對(duì)實(shí)驗(yàn)前期轉(zhuǎn)

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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博士論文
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碩士論文
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[5]轉(zhuǎn)哈茨木霉雙幾丁質(zhì)酶基因(Ech42+Nag70)提高棉花黃萎病抗性的研究[D]. 辛文慧.浙江大學(xué) 2016
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[7]日本三角渦蟲轉(zhuǎn)錄組、再生表達(dá)譜及小RNA譜的鑒定與分析[D]. 秦云飛.鄭州大學(xué) 2012
[8]小麥幾丁質(zhì)酶基因的檢測(cè)及酶活性測(cè)定[D]. 徐恩靜.安徽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
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本文編號(hào):3235063

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