小黑楊與Alternaria alternata互作后基因表達(dá)模式分析
發(fā)布時(shí)間:2021-06-10 18:18
楊樹葉枯病是由鏈格孢菌引起的葉部病害,本研究以楊樹及葉枯病病原菌為研究對象,鑒定了葉枯病病原菌及其分子特性,分析了病原菌應(yīng)答H202脅迫的轉(zhuǎn)錄水平變化,也分析了楊樹應(yīng)答葉枯病菌脅迫轉(zhuǎn)錄水平變化,希望今后鑒定抗病基因和改良楊樹抗病性奠定基礎(chǔ),具體結(jié)果如下:首先,對葉枯病病原菌進(jìn)行分離純化,得到純菌種,進(jìn)而確定適合菌落生長的條件和溫度。根據(jù)植物細(xì)胞受到脅迫產(chǎn)生大量活性氧的原理,用H2O2溶液模擬活性氧條件處理病原菌,將實(shí)驗(yàn)組和對照組樣品進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序。結(jié)果表明,在活性氧脅迫條件下,病原菌基因表達(dá)量發(fā)生明顯變化,將差異表達(dá)基因與GO、COG、KOG和KEGG數(shù)據(jù)庫比對,發(fā)現(xiàn)差異表達(dá)基因功能涉及多種過程,在代謝、運(yùn)輸、膜結(jié)構(gòu)等方面富集到的基因數(shù)量較多。用葉枯病病原菌對楊樹葉片進(jìn)行脅迫處理48小時(shí),利用RNA-seq技術(shù)檢測基因差異表達(dá)情況,結(jié)果是表明楊樹葉片在脅迫下基因表達(dá)發(fā)生明顯變化,主要涉及代謝過程、氧化還原酶、膜結(jié)構(gòu)、發(fā)病機(jī)制相關(guān)蛋白等方面,參與到光合作用等14條代謝通路中。共發(fā)現(xiàn)27個(gè)轉(zhuǎn)錄因子,涉及到WRKY、MYB、bZIP等家族。分別在脅迫0、4、8、12、24、48和72小時(shí)進(jìn)行...
【文章來源】:東北林業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:56 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-2?18S序列PCR產(chǎn)物膠圖??-
2病原菌鑒定和轉(zhuǎn)錄組分析??Query?Cover和Per.?Ident均為100%,E?value值為0,從而確定本實(shí)驗(yàn)所用菌種為??Altemaria?aUernata?2-4)〇??Alternariaalternata屬半知菌綱,鏈孢霉目,黑霉科真菌,現(xiàn)與其他四種親緣關(guān)系較??近的鏈格孢菌做系統(tǒng)發(fā)育分析,了解他們之間的親緣關(guān)系。鏈格孢菌中,??能引起白菜黑斑病,Zeww/似/廳能引起蒼術(shù)黑斑病,??c/W麵cw/ar/6?能引起花舟葉斑病,能引起軸枯褐腐玻如圖2-5所示,從??系統(tǒng)進(jìn)化樹可看出,a/化與」/如m/r/flf?親緣關(guān)系最近,與其他三??種真菌親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。??i|gp=:??looobpr?,??750b£?■"?5,界:??圖2-2?18S序列PCR產(chǎn)物膠圖??Fig.2-2?Gel?map?of?the?18S?sequence?PCR?product??1?gcctgcggag?ggatcattac?acaaatatga?aggcgggctg?gaacctctcg?gggttacagc??61?cttgctgaat?tattcaccct?tgtcttttgc?gtacttcttg?tttccttggt?gggttcgccc??121?accactagga?caaacataaa?ccttttgtaa?ttgcaatcag?cgtcagtaac?aaattaataa??181?ttacaacttt?caacaacgga?tctcttggtt?ctggcatcga?tgaagaacgc?agcgaaatgc??241?gataagtagt?gtgaattgca?gaattcagtg?aatcat
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【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]植物轉(zhuǎn)錄因子研究方法及應(yīng)用[J]. 樊松樂,王紀(jì)坤,覃碧,王立豐. 分子植物育種. 2019(15)
[2]Bt蛋白對楊扇舟蛾連續(xù)世代存活與發(fā)育的影響[J]. 王留成,劉潔,高佳敏,孟丹陽,姚彤,孫天驊,高寶嘉. 西北農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2019(06)
[3]小黑楊基因組的初步組裝及SSR信息分析[J]. 周玉敏,王遂,劉軼,李開隆,由香玲. 植物研究. 2019(01)
[4]深綠木霉對山新楊生長及抗葉枯病能力的影響[J]. 遇文婧,楊帥,刁桂萍. 東北林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2019(01)
[5]瞬時(shí)表達(dá)葡萄病毒A外殼蛋白基因?qū)煵葜胁《巨D(zhuǎn)錄的影響[J]. 王建輝,劉建軍,陳克玲,李洪雯,何建,關(guān)斌,何禮,王東. 核農(nóng)學(xué)報(bào). 2018(09)
[6]楊樹灰斑病的識別和防治方法[J]. 許晶,王東濤. 農(nóng)民致富之友. 2018(03)
[7]茉莉酸信號通路中的轉(zhuǎn)錄因子對藥用植物次生代謝調(diào)控的研究進(jìn)展[J]. 姚娜,荊禮,鄭漢,陳敏,申業(yè). 中國中藥雜志. 2018(05)
[8]轉(zhuǎn)錄因子研究方法進(jìn)展[J]. 劉相蓮,喬芳,黃德玉,袁宗輝,王旭. 生理科學(xué)進(jìn)展. 2017(01)
[9]WRKY transcription factors in plant responses to stresses[J]. Jingjing Jiang,Shenghui Ma,Nenghui Ye,Ming Jiang,Jiashu Cao,Jianhua Zhang. Journal of Integrative Plant Biology. 2017(02)
[10]2種木霉菌對楊樹葉枯病致病菌的抑菌活性研究[J]. 梁丹,沈威,劉璐,楊子健,先文娟,殷嬌,熊靜. 防護(hù)林科技. 2017(01)
博士論文
[1]柑橘褐斑病菌比較基因組和轉(zhuǎn)錄組分析及柑橘綠霉病菌產(chǎn)孢中心調(diào)控途徑和高滲甘油途徑的功能基因研究[D]. 王明爽.浙江大學(xué) 2016
碩士論文
[1]楊屬五大派樹種苗期形態(tài)與生理性狀的遺傳變異[D]. 欒鹖慧.中國林業(yè)科學(xué)研究院 2011
本文編號:3222885
【文章來源】:東北林業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:56 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-2?18S序列PCR產(chǎn)物膠圖??-
2病原菌鑒定和轉(zhuǎn)錄組分析??Query?Cover和Per.?Ident均為100%,E?value值為0,從而確定本實(shí)驗(yàn)所用菌種為??Altemaria?aUernata?2-4)〇??Alternariaalternata屬半知菌綱,鏈孢霉目,黑霉科真菌,現(xiàn)與其他四種親緣關(guān)系較??近的鏈格孢菌做系統(tǒng)發(fā)育分析,了解他們之間的親緣關(guān)系。鏈格孢菌中,??能引起白菜黑斑病,Zeww/似/廳能引起蒼術(shù)黑斑病,??c/W麵cw/ar/6?能引起花舟葉斑病,能引起軸枯褐腐玻如圖2-5所示,從??系統(tǒng)進(jìn)化樹可看出,a/化與」/如m/r/flf?親緣關(guān)系最近,與其他三??種真菌親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。??i|gp=:??looobpr?,??750b£?■"?5,界:??圖2-2?18S序列PCR產(chǎn)物膠圖??Fig.2-2?Gel?map?of?the?18S?sequence?PCR?product??1?gcctgcggag?ggatcattac?acaaatatga?aggcgggctg?gaacctctcg?gggttacagc??61?cttgctgaat?tattcaccct?tgtcttttgc?gtacttcttg?tttccttggt?gggttcgccc??121?accactagga?caaacataaa?ccttttgtaa?ttgcaatcag?cgtcagtaac?aaattaataa??181?ttacaacttt?caacaacgga?tctcttggtt?ctggcatcga?tgaagaacgc?agcgaaatgc??241?gataagtagt?gtgaattgca?gaattcagtg?aatcat
?東北林業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文???Oistritjutiors?af?tbe?ixtp?IMi?Blast?Nils?on?lOd?subject?s?qu?fue&??i?i?mi?*■.:-,::〇??圖2-4在NCBI上Blast序列得到與J//er/7(7r/a?(7//er/7G/^的比對情況??Fig.2-4?Alignment?of?Blast?sequence?with?Alternaria?alternata?on?NCBI??59?Alternaria?citrimacularis?????Alternaria?vitis???Alternaria?tenuissima??Alternaria?alternata??100?Alternaria?brassicae??I?1??1??圖2-5五種鏈格孢菌構(gòu)建進(jìn)化樹??Fig.2-5?Phylogeny?of?five?species?of?Alternaria??2.2.2不同溫度條件下病原菌生長活性變化??本實(shí)驗(yàn)根據(jù)病原菌菌落直徑判斷其生長活性,由圖2-6可知,不同溫度條件下,病??原菌的生長活性不同。在培養(yǎng)Id時(shí),各溫度下的生長活性差別不明顯,2d后不同溫度??-12-??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]植物轉(zhuǎn)錄因子研究方法及應(yīng)用[J]. 樊松樂,王紀(jì)坤,覃碧,王立豐. 分子植物育種. 2019(15)
[2]Bt蛋白對楊扇舟蛾連續(xù)世代存活與發(fā)育的影響[J]. 王留成,劉潔,高佳敏,孟丹陽,姚彤,孫天驊,高寶嘉. 西北農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2019(06)
[3]小黑楊基因組的初步組裝及SSR信息分析[J]. 周玉敏,王遂,劉軼,李開隆,由香玲. 植物研究. 2019(01)
[4]深綠木霉對山新楊生長及抗葉枯病能力的影響[J]. 遇文婧,楊帥,刁桂萍. 東北林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2019(01)
[5]瞬時(shí)表達(dá)葡萄病毒A外殼蛋白基因?qū)煵葜胁《巨D(zhuǎn)錄的影響[J]. 王建輝,劉建軍,陳克玲,李洪雯,何建,關(guān)斌,何禮,王東. 核農(nóng)學(xué)報(bào). 2018(09)
[6]楊樹灰斑病的識別和防治方法[J]. 許晶,王東濤. 農(nóng)民致富之友. 2018(03)
[7]茉莉酸信號通路中的轉(zhuǎn)錄因子對藥用植物次生代謝調(diào)控的研究進(jìn)展[J]. 姚娜,荊禮,鄭漢,陳敏,申業(yè). 中國中藥雜志. 2018(05)
[8]轉(zhuǎn)錄因子研究方法進(jìn)展[J]. 劉相蓮,喬芳,黃德玉,袁宗輝,王旭. 生理科學(xué)進(jìn)展. 2017(01)
[9]WRKY transcription factors in plant responses to stresses[J]. Jingjing Jiang,Shenghui Ma,Nenghui Ye,Ming Jiang,Jiashu Cao,Jianhua Zhang. Journal of Integrative Plant Biology. 2017(02)
[10]2種木霉菌對楊樹葉枯病致病菌的抑菌活性研究[J]. 梁丹,沈威,劉璐,楊子健,先文娟,殷嬌,熊靜. 防護(hù)林科技. 2017(01)
博士論文
[1]柑橘褐斑病菌比較基因組和轉(zhuǎn)錄組分析及柑橘綠霉病菌產(chǎn)孢中心調(diào)控途徑和高滲甘油途徑的功能基因研究[D]. 王明爽.浙江大學(xué) 2016
碩士論文
[1]楊屬五大派樹種苗期形態(tài)與生理性狀的遺傳變異[D]. 欒鹖慧.中國林業(yè)科學(xué)研究院 2011
本文編號:3222885
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