阿爾茨海默病小鼠肌肉組織中基因表達(dá)差異相關(guān)通路分析
發(fā)布時(shí)間:2021-06-10 00:34
目的探討阿爾茨海默病小鼠肌肉組織和正常小鼠肌肉組織轉(zhuǎn)錄組差異表達(dá)基因,闡述差異表達(dá)基因在阿爾茨海默病發(fā)病機(jī)制中的作用。方法收集阿爾茨海默病小鼠(10只)和健康小鼠(10只)肌肉組織,運(yùn)用二代高通量RNA轉(zhuǎn)錄測(cè)序(RNA-seq)技術(shù)進(jìn)行測(cè)序,篩選差異表達(dá)基因,并對(duì)其進(jìn)行基因功能注釋(GO)及京都基因與基因組百科全書(KEGG)通路分析。實(shí)時(shí)熒光定量聚合酶鏈反應(yīng)(qRT-PCR)驗(yàn)證候選基因在阿爾茨海默病和正常小鼠肌肉組織中的表達(dá)差異。結(jié)果 4 222個(gè)基因在阿爾茨海默病小鼠和健康小鼠肌肉中表達(dá)差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05或P<0.01),其中2 087個(gè)在阿爾茨海默病小鼠肌肉中高表達(dá),2 135個(gè)低表達(dá)。GO分析結(jié)果顯示,顯著上調(diào)的功能基因主要富集于細(xì)胞過程、單一生物過程、代謝過程和催化活性等;KEGG通路分析結(jié)果表明,差異基因明顯富集于代謝和炎癥相關(guān)的信號(hào)通路等;qRT-PCR結(jié)果顯示,候選基因表達(dá)趨勢(shì)與轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果一致。結(jié)論在轉(zhuǎn)錄組水平上篩選出阿爾茨海默病小鼠和健康小鼠肌肉組織差異表達(dá)基因及相關(guān)重要調(diào)節(jié)信號(hào)通路,阿爾茨海默病小鼠肌肉組織中代謝和炎癥相關(guān)通路最為富集,...
【文章來源】:中華老年醫(yī)學(xué)雜志. 2020,39(08)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:4 頁
本文編號(hào):3221647
【文章來源】:中華老年醫(yī)學(xué)雜志. 2020,39(08)北大核心CSCD
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