阿爾茨海默病小鼠肌肉組織中基因表達差異相關通路分析
發(fā)布時間:2021-06-10 00:34
目的探討阿爾茨海默病小鼠肌肉組織和正常小鼠肌肉組織轉錄組差異表達基因,闡述差異表達基因在阿爾茨海默病發(fā)病機制中的作用。方法收集阿爾茨海默病小鼠(10只)和健康小鼠(10只)肌肉組織,運用二代高通量RNA轉錄測序(RNA-seq)技術進行測序,篩選差異表達基因,并對其進行基因功能注釋(GO)及京都基因與基因組百科全書(KEGG)通路分析。實時熒光定量聚合酶鏈反應(qRT-PCR)驗證候選基因在阿爾茨海默病和正常小鼠肌肉組織中的表達差異。結果 4 222個基因在阿爾茨海默病小鼠和健康小鼠肌肉中表達差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05或P<0.01),其中2 087個在阿爾茨海默病小鼠肌肉中高表達,2 135個低表達。GO分析結果顯示,顯著上調(diào)的功能基因主要富集于細胞過程、單一生物過程、代謝過程和催化活性等;KEGG通路分析結果表明,差異基因明顯富集于代謝和炎癥相關的信號通路等;qRT-PCR結果顯示,候選基因表達趨勢與轉錄組測序結果一致。結論在轉錄組水平上篩選出阿爾茨海默病小鼠和健康小鼠肌肉組織差異表達基因及相關重要調(diào)節(jié)信號通路,阿爾茨海默病小鼠肌肉組織中代謝和炎癥相關通路最為富集,...
【文章來源】:中華老年醫(yī)學雜志. 2020,39(08)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:4 頁
本文編號:3221647
【文章來源】:中華老年醫(yī)學雜志. 2020,39(08)北大核心CSCD
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