腫瘤是目前危害到生物體健康的疾病之一,威脅到生命有機(jī)體的生存,其發(fā)病的概率不低,我國(guó)的患病人數(shù)占到了全球總患病人數(shù)的一半。各種各樣類型的腫瘤都是由普通的細(xì)胞所轉(zhuǎn)變得到的,腫瘤是缺少了部分正常功能和擁有異常的流動(dòng)性的細(xì)胞形成的�；蛴羞x擇性的表達(dá)導(dǎo)致了細(xì)胞存在各種各樣的表型,與此同時(shí),當(dāng)基因的表達(dá)出現(xiàn)異常情況時(shí),這就為腫瘤細(xì)胞的產(chǎn)生提供了基礎(chǔ)。而基因的表達(dá)水平之間的差異能夠被檢測(cè)到,分析這些表達(dá)差異的基因,從中尋找到具有生物學(xué)意義的信息,為進(jìn)一步研究相關(guān)基因在腫瘤產(chǎn)生發(fā)展的過(guò)程中的發(fā)揮的作用提供了基礎(chǔ),也為進(jìn)一步的治療疾病、挖掘基因靶點(diǎn)提供了線索。本文利用GEO（The Gene Expression Omnibus）數(shù)據(jù)庫(kù)編碼為GES5847基因表達(dá)譜芯片數(shù)據(jù)研究腫瘤組織與正�；|(zhì)細(xì)胞之間的表達(dá)差異,以此來(lái)研究這些差異在腫瘤發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮的作用和意義,期望對(duì)挖掘腫瘤的生物學(xué)過(guò)程有所幫助。加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析（Weighted gene co-expression network analysis,WGCNA）通過(guò)建立分子網(wǎng)絡(luò)的思想,利用不同組別基因表達(dá)的差別,把網(wǎng)絡(luò)中表達(dá)關(guān)聯(lián)程度高的... 

【文章來(lái)源】：哈爾濱工程大學(xué)黑龍江省 211工程院校

【文章頁(yè)數(shù)】：69 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

中心法則現(xiàn)在人類已經(jīng)完全進(jìn)入了生命科學(xué)研究階段的后基因組織的時(shí)代，這是因?yàn)槿祟惖?br>

一種將生物學(xué)科、計(jì)算機(jī)學(xué)科、化學(xué)等多種學(xué)科結(jié)合在一起出數(shù)以萬(wàn)計(jì)的基因的表達(dá)水平。這種芯片采用了雜交測(cè)序的膠片或者特殊的有機(jī)高分子薄片上使用照相平板印刷技術(shù)或下得到許多序列特殊的短鏈核苷酸或 cDNA 片段，組成為芯本 DNA 上做出特別的標(biāo)記，標(biāo)記后的樣本放入到基因芯片本雜交后芯片上熒光強(qiáng)度不一樣，使用激光來(lái)掃描芯片，可芯片圖片來(lái)測(cè)量每個(gè)基因的雜交強(qiáng)度，這樣就能夠判斷出芯本中，以及可以從芯片中得知其序列，最終得到檢測(cè)出的樣優(yōu)點(diǎn)很突出，芯片實(shí)驗(yàn)速度快，實(shí)驗(yàn)簡(jiǎn)單，檢測(cè)過(guò)程不需要測(cè)的要求，其應(yīng)用領(lǐng)域廣泛，在藥物研究、疾病的快速判斷都有應(yīng)用。本文選用的基因表達(dá)譜芯片數(shù)據(jù)就是通過(guò)基因表記好的腫瘤細(xì)胞樣本及正常細(xì)胞樣本一同與芯片雜交，掃描光的強(qiáng)度進(jìn)行比較，得到的值可以用來(lái)表示樣本基因表達(dá)的常需要使用到基因表達(dá)譜芯片，在判別腫瘤型號(hào)、腫瘤機(jī)制等方面都有著大量的應(yīng)用。

圖 1.3 基因芯片分類1.2.2.2 DNA 測(cè)序技術(shù)DNA 測(cè)序技術(shù)也發(fā)展非常迅速，從第一代 DNA 測(cè)序技術(shù)的產(chǎn)生跳躍到第二代測(cè)序技術(shù)甚至第三代測(cè)序技術(shù)的出現(xiàn)，測(cè)序的成本大大的降低了，第一代測(cè)序技術(shù)的準(zhǔn)確度雖然非常高，但是其測(cè)序成本太高，而且通量太小，使得這種技術(shù)得不到廣泛的應(yīng)用[20]。而第二代測(cè)序技術(shù)使得測(cè)序成本大幅度降低的同時(shí)，測(cè)序的高通量性使得這種技術(shù)快速的得到了廣泛的關(guān)注。高通量測(cè)序技術(shù)的出現(xiàn)對(duì)測(cè)序的影響非常深遠(yuǎn)，顛覆了傳統(tǒng)技術(shù)，對(duì)數(shù)萬(wàn)甚至上百萬(wàn)級(jí)別的 DNA 序列進(jìn)行測(cè)定只需要一次就可以完成，與此同時(shí)成本也是越來(lái)越低，這使得用少量花費(fèi)來(lái)測(cè)定一個(gè)人類基因組的目標(biāo)越來(lái)越成為可能，下圖為測(cè)序成本的變化。

【參考文獻(xiàn)】：
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碩士論文
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本文編號(hào)：3217996