泡狀棘球蚴骨橋蛋白基因的克隆和生物信息學(xué)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-06-07 09:01
目的泡狀棘球蚴病是一種浸潤(rùn)性生長(zhǎng)為主的人獸共患疾病,大多數(shù)原發(fā)于肝臟,有“蟲癌”之稱。目前對(duì)其遷徙和轉(zhuǎn)移機(jī)制尚不明確。有研究發(fā)現(xiàn)骨橋蛋白(OPN)可以促進(jìn)腫瘤干細(xì)胞遷徙和轉(zhuǎn)移。通過對(duì)泡球蚴OPN基因進(jìn)行克隆并對(duì)其生物信息學(xué)進(jìn)行分析,為后續(xù)研究奠定基礎(chǔ)。方法取感染多房棘球蚴的長(zhǎng)爪沙鼠提取泡球蚴原頭節(jié),提取泡球蚴總RNA,逆轉(zhuǎn)錄成cDNA,從NCBI基因數(shù)據(jù)庫(kù)中通過BLAST找到可能的OPN基因保守序列片段(EMmg-13d08.q1k)通過軟件設(shè)計(jì)引物,PCR擴(kuò)增目的基因測(cè)序與多房棘球蚴OPN基因同源性片段再次上傳至NCBI進(jìn)行比對(duì),應(yīng)用RACE方法進(jìn)行3’-RACE PCR利用引物合成3’-RACE cDNA第一鏈,以3’-RACE cDNA為模板進(jìn)行巢氏PCR反應(yīng),5’-RACE PCR合成5’-RACE cDNA第一鏈,得到5’-RACE cDNA純化進(jìn)行巢氏PCR反應(yīng)。軟件對(duì)泡球蚴OPN基因保守序列、3’-RACE測(cè)序序列、5’-RACE測(cè)序序列進(jìn)行校正拼接得到泡球蚴OPN基因全長(zhǎng)序列。推測(cè)OPN開放閱讀框(ORF)所對(duì)應(yīng)的氨基酸序列,進(jìn)行蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)、三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)及抗原位表位...
【文章來源】:石河子大學(xué)新疆維吾爾自治區(qū) 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:47 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
多房棘球絳蟲與寄主飼養(yǎng)細(xì)胞共培養(yǎng)的建立(SpiliotisM等,2009)
泡狀棘球蚴骨橋蛋白基因的克隆和生物信息學(xué)分析6圖1多房棘球絳蟲與寄主飼養(yǎng)細(xì)胞共培養(yǎng)的建立(SpiliotisM等,2009)Fig1FlowchartsummarizingthesetupofE.multilocularismetacestodeco-cultureswithhostfeedercells(FromSpiliotisMet,al2009)b.制備無宿主細(xì)胞培養(yǎng)液,按照a步驟培養(yǎng)Hela細(xì)胞,一周后離心取上清液,每毫升上清液加入1μLβ-巰基乙醇、1μL浴銅靈二磺酸、1μLL-半胱氨酸和雙抗。放置-80℃保存?zhèn)溆谩E囵B(yǎng)3月后的小囊泡加入無宿主細(xì)胞培養(yǎng)液放入75cm2培養(yǎng)瓶,培養(yǎng)瓶中充進(jìn)氮?dú)猓饪。放?7°C培養(yǎng)箱。每2-3天更換無宿主細(xì)胞培養(yǎng)液,連續(xù)培養(yǎng)3月,觀察囊泡生長(zhǎng)情況。流程圖如圖(2)。圖2無宿主細(xì)胞的多房棘球絳蟲培養(yǎng)體系的建立(SpiliotisM等,2009)Fig2FlowchartsummarizingsetupofE.multilocularismetacestodesinaxenic(host-cellfree)culture.(FromSpiliotisMet,al2009)
泡球蚴總RNA提取Fig.1TheelectrophoreticbandsoftotalRNAfromEchinococcusmultilocularis
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]囊型包蟲病的治療現(xiàn)狀與進(jìn)展[J]. 唐群科,張瑛,喬建. 寄生蟲病與感染性疾病. 2019(04)
[2]氯舒隆和奧硝唑體外抗細(xì)粒棘球蚴原頭節(jié)和多房棘球蚴的效果評(píng)價(jià)[J]. 辛奇,高海軍,宋曉霞,孫旭東,呂薇,Nabil PERVAIZ,魯俊,景濤. 中國(guó)寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2018(04)
[3]多房棘球蚴LDH基因的克隆表達(dá)及免疫原性研究[J]. 何順偉,李洪清,李曉燕,趙瑞雪,魏曉星. 中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào). 2017(11)
[4]肝泡狀棘球蚴病的診斷和治療[J]. 方丹,陳哲宇. 臨床肝膽病雜志. 2017(05)
[5]IL-10對(duì)腫瘤免疫雙向調(diào)節(jié)的研究進(jìn)展[J]. 王佳麗,劉麗華. 中國(guó)腫瘤生物治療雜志. 2016(01)
[6]包蟲病病原在我國(guó)的流行現(xiàn)狀及成因分析[J]. 劉平,李金花,李印,康京麗,戴琪,趙娜,孫向東. 中國(guó)動(dòng)物檢疫. 2016(01)
[7]SOX2O CT4基因在惡性腫瘤轉(zhuǎn)移中的研究進(jìn)展[J]. 姚孟飛. 中國(guó)藥物與臨床. 2014(07)
[8]寄生蟲病原相關(guān)分子模式的研究進(jìn)展[J]. 楊慶利,申繼清. 中國(guó)寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2013(03)
[9]新疆包蟲病流行現(xiàn)狀與防控對(duì)策[J]. 李曉軍,王文明,趙莉,石保新,張文寶,閆昊,王光雷,張?zhí)m江,張旭,劉志強(qiáng),努爾,古努爾,米曉云,張壯志. 草食家畜. 2012(04)
[10]肝泡狀棘球蚴病治療方法的研究進(jìn)展[J]. 樊玉祥,任偉新. 中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào). 2012(03)
碩士論文
[1]泡狀棘球蚴EmAurora基因的克隆及功能鑒定[D]. 柴小莉.廈門大學(xué) 2017
[2]多房棘球蚴Em95基因克隆、原核表達(dá)及應(yīng)用[D]. 李建秋.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2015
[3]多房棘球絳蟲OCT4基因的克隆及功能鑒定[D]. 商桂華.廈門大學(xué) 2014
[4]骨橋蛋白促進(jìn)肝干細(xì)胞/肝前體細(xì)胞增殖和遷移的研究[D]. 劉瑩瑩.第二軍醫(yī)大學(xué) 2013
[5]骨橋蛋白在泡狀棘球蚴侵襲性生長(zhǎng)中的作用和應(yīng)用研究[D]. 張龍.石河子大學(xué) 2011
本文編號(hào):3216287
【文章來源】:石河子大學(xué)新疆維吾爾自治區(qū) 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:47 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
多房棘球絳蟲與寄主飼養(yǎng)細(xì)胞共培養(yǎng)的建立(SpiliotisM等,2009)
泡狀棘球蚴骨橋蛋白基因的克隆和生物信息學(xué)分析6圖1多房棘球絳蟲與寄主飼養(yǎng)細(xì)胞共培養(yǎng)的建立(SpiliotisM等,2009)Fig1FlowchartsummarizingthesetupofE.multilocularismetacestodeco-cultureswithhostfeedercells(FromSpiliotisMet,al2009)b.制備無宿主細(xì)胞培養(yǎng)液,按照a步驟培養(yǎng)Hela細(xì)胞,一周后離心取上清液,每毫升上清液加入1μLβ-巰基乙醇、1μL浴銅靈二磺酸、1μLL-半胱氨酸和雙抗。放置-80℃保存?zhèn)溆谩E囵B(yǎng)3月后的小囊泡加入無宿主細(xì)胞培養(yǎng)液放入75cm2培養(yǎng)瓶,培養(yǎng)瓶中充進(jìn)氮?dú)猓饪。放?7°C培養(yǎng)箱。每2-3天更換無宿主細(xì)胞培養(yǎng)液,連續(xù)培養(yǎng)3月,觀察囊泡生長(zhǎng)情況。流程圖如圖(2)。圖2無宿主細(xì)胞的多房棘球絳蟲培養(yǎng)體系的建立(SpiliotisM等,2009)Fig2FlowchartsummarizingsetupofE.multilocularismetacestodesinaxenic(host-cellfree)culture.(FromSpiliotisMet,al2009)
泡球蚴總RNA提取Fig.1TheelectrophoreticbandsoftotalRNAfromEchinococcusmultilocularis
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]囊型包蟲病的治療現(xiàn)狀與進(jìn)展[J]. 唐群科,張瑛,喬建. 寄生蟲病與感染性疾病. 2019(04)
[2]氯舒隆和奧硝唑體外抗細(xì)粒棘球蚴原頭節(jié)和多房棘球蚴的效果評(píng)價(jià)[J]. 辛奇,高海軍,宋曉霞,孫旭東,呂薇,Nabil PERVAIZ,魯俊,景濤. 中國(guó)寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2018(04)
[3]多房棘球蚴LDH基因的克隆表達(dá)及免疫原性研究[J]. 何順偉,李洪清,李曉燕,趙瑞雪,魏曉星. 中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào). 2017(11)
[4]肝泡狀棘球蚴病的診斷和治療[J]. 方丹,陳哲宇. 臨床肝膽病雜志. 2017(05)
[5]IL-10對(duì)腫瘤免疫雙向調(diào)節(jié)的研究進(jìn)展[J]. 王佳麗,劉麗華. 中國(guó)腫瘤生物治療雜志. 2016(01)
[6]包蟲病病原在我國(guó)的流行現(xiàn)狀及成因分析[J]. 劉平,李金花,李印,康京麗,戴琪,趙娜,孫向東. 中國(guó)動(dòng)物檢疫. 2016(01)
[7]SOX2O CT4基因在惡性腫瘤轉(zhuǎn)移中的研究進(jìn)展[J]. 姚孟飛. 中國(guó)藥物與臨床. 2014(07)
[8]寄生蟲病原相關(guān)分子模式的研究進(jìn)展[J]. 楊慶利,申繼清. 中國(guó)寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2013(03)
[9]新疆包蟲病流行現(xiàn)狀與防控對(duì)策[J]. 李曉軍,王文明,趙莉,石保新,張文寶,閆昊,王光雷,張?zhí)m江,張旭,劉志強(qiáng),努爾,古努爾,米曉云,張壯志. 草食家畜. 2012(04)
[10]肝泡狀棘球蚴病治療方法的研究進(jìn)展[J]. 樊玉祥,任偉新. 中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào). 2012(03)
碩士論文
[1]泡狀棘球蚴EmAurora基因的克隆及功能鑒定[D]. 柴小莉.廈門大學(xué) 2017
[2]多房棘球蚴Em95基因克隆、原核表達(dá)及應(yīng)用[D]. 李建秋.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2015
[3]多房棘球絳蟲OCT4基因的克隆及功能鑒定[D]. 商桂華.廈門大學(xué) 2014
[4]骨橋蛋白促進(jìn)肝干細(xì)胞/肝前體細(xì)胞增殖和遷移的研究[D]. 劉瑩瑩.第二軍醫(yī)大學(xué) 2013
[5]骨橋蛋白在泡狀棘球蚴侵襲性生長(zhǎng)中的作用和應(yīng)用研究[D]. 張龍.石河子大學(xué) 2011
本文編號(hào):3216287
本文鏈接:http://sikaile.net/kejilunwen/jiyingongcheng/3216287.html
最近更新
教材專著