細(xì)胞質(zhì)雄性不育是利用雜種優(yōu)勢創(chuàng)制油菜雜交種的重要途徑之一。而恢復(fù)系的選育及恢復(fù)基因的研究有利于提高細(xì)胞質(zhì)雄性不育系的應(yīng)用價值。該研究以甘藍(lán)型油菜細(xì)胞質(zhì)雄性不育系1193A和恢復(fù)系15-R1為親本,以F₂群體構(gòu)建了2個極端性狀混池,采用BSA-seq技術(shù)方法,對恢復(fù)基因進行定位分析。結(jié)果表明:（1）不育系1193A與恢復(fù)系15-R1之間共獲得非同義突變的SNPs共33 883個,混池間共有7 996個非同義編碼突變。（2）InDel檢測與注釋結(jié)果表明,親本間引起移碼突變的有2 918個,混池間引起移碼突變的有840個。（3）綜合SNP和InDel的關(guān)聯(lián)分析結(jié)果,將恢復(fù)基因定位于C09染色體上的0～880000區(qū)域,總長度為880 kb。（4）對候選區(qū)域的SNP和InDel注釋發(fā)現(xiàn),親本間存在非同義突變的SNP共40個,混池間存在非同義突變的SNP共65個,親本間存在移碼突變的InDel共7個,混池間存在移碼突變的InDel共11個;對候選區(qū)間內(nèi)的編碼基因進行注釋,結(jié)果共注釋到162個基因,其中存在非同義突變基因11個,移碼突變基因5個,這些基因可能與育性恢復(fù)有關(guān)。 

【文章來源】：西北植物學(xué)報. 2020,40(07)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：9 頁

【文章目錄】：
1 材料和方法
    1.1 材料來源
    1.2 極端混合池構(gòu)建與測序
    1.3 關(guān)聯(lián)分析
    1.4 候選區(qū)域的功能注釋
2 結(jié)果與分析
    2.1 F2群體育性分離情況
    2.2 測序數(shù)據(jù)分析
    2.3 關(guān)聯(lián)分析與候選區(qū)域的篩選
        2.3.1 SNP關(guān)聯(lián)分析
        2.3.2 InDel關(guān)聯(lián)分析
        2.3.3 候選區(qū)域的篩選
    2.4 候選區(qū)域基因注釋與分析
3 討 論


【參考文獻】：
期刊論文
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本文編號：3201843