異育銀鯽Ⅰ型干擾素基因的克
發(fā)布時(shí)間:2021-05-21 06:58
異育銀鯽(Carassius auratus gibelio)是我國(guó)主要的淡水養(yǎng)殖品種之一。由鯉皰疹病毒II型(Cyprinid herpesvirus 2,CyHV-2)感染引起的鯽造血器官壞死癥是一種嚴(yán)重的病毒性傳染病,給水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)造成了巨大的經(jīng)濟(jì)損失,開(kāi)展鯽魚(yú)抗病毒防御機(jī)制研究對(duì)其病毒性疾病的防控具有重要的現(xiàn)實(shí)意義。干擾素(Interferon,IFN)是一類(lèi)重要的分泌型細(xì)胞因子,能夠抑制病毒增殖和調(diào)節(jié)機(jī)體免疫應(yīng)答,在先天性和適應(yīng)性免疫中發(fā)揮著重要作用。目前,I型干擾素(IFN-I)已在多種硬骨魚(yú)類(lèi)中得到研究,但有關(guān)異育銀鯽IFN-I的研究還未深入開(kāi)展。本研究克隆獲得一種異育銀鯽IFN-I基因(CagIFNa),完成了對(duì)該基因的鑒定和序列結(jié)構(gòu)分析,分析了CagIFNa在體內(nèi)和體外的表達(dá)模式,并對(duì)CagIFNa在鯽魚(yú)腦細(xì)胞系(Gibel carp brain cell line,GiCB)中抵抗CyHV-2感染的抗病毒活性進(jìn)行了研究。旨在進(jìn)一步揭示魚(yú)類(lèi)先天性抗病毒感染機(jī)制,為鯽魚(yú)皰疹病毒造血器官壞死癥的有效防控奠定理論基礎(chǔ)。主要結(jié)果如下:1.CagIFNa的克隆和序列結(jié)構(gòu)分析基于R...
【文章來(lái)源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:84 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
縮略語(yǔ)表(按字母順序排列)
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 硬骨魚(yú)類(lèi)Ⅰ型干擾素研究進(jìn)展
1.1 Ⅰ型干擾素的種類(lèi)及表達(dá)特征
1.1.1 Ⅰ型干擾素的種類(lèi)
1.1.2 Ⅰ型干擾素的表達(dá)特征
1.2 硬骨魚(yú)類(lèi)Ⅰ型干擾素受體及信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路
1.2.1 Ⅰ型干擾素受體
1.2.2 Ⅰ型干擾素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路
1.3 硬骨魚(yú)類(lèi)Ⅰ型干擾素抗病毒功能及其應(yīng)用
1.3.1 Ⅰ型干擾素抗病毒功能
1.3.2 Ⅰ型干擾素應(yīng)用
2 鯉皰疹病毒Ⅱ型研究進(jìn)展
2.1 流行病學(xué)
2.1.1 流行區(qū)域
2.1.2 傳播特征
2.2 臨床癥狀及病理特征
2.3 病原學(xué)
2.4 檢測(cè)技術(shù)
2.4.1 電鏡技術(shù)
2.4.2 細(xì)胞培養(yǎng)技術(shù)
2.4.3 分子生物學(xué)檢測(cè)
2.4.3.1 聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)
2.4.3.2 實(shí)時(shí)熒光定量PCR
2.4.3.3 環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)
3 魚(yú)類(lèi)免疫系統(tǒng)的研究
第二章 異育銀鯽Ⅰ型干擾素的克隆及生物信息學(xué)分析
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物、質(zhì)粒和菌種
1.1.2 主要試劑及耗材
1.1.3 主要實(shí)驗(yàn)儀器
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
1.2.1 異育銀鯽組織樣品RNA提取
1.2.2 異育銀鯽組織樣品c DNA合成
1.2.3 5'RACE-Ready c DNA和3'RACE-Ready c DNA合成
1.2.4 RACE法擴(kuò)增異育銀鯽IFN-Ⅰ基因c DNA部分序列
1.2.5 PCR產(chǎn)物膠回收
1.2.6 PCR產(chǎn)物的連接與轉(zhuǎn)化
1.2.7 陽(yáng)性克隆的篩選與測(cè)序鑒定
1.2.8 普通PCR擴(kuò)增確定Cag IFNa ORF序列全長(zhǎng)
1.2.9 生物信息學(xué)分析
2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.1 異育銀鯽IFN-Ⅰ(Cag IFNa)核苷酸序列與氨基酸序列分析
2.2 Cag IFNa氨基酸多序列比對(duì)分析
2.3 Cag IFNa氨基酸系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析
3 討論
第三章 異育銀鯽Ⅰ型干擾素組織表達(dá)分布與誘導(dǎo)表達(dá)
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
1.1.2 細(xì)胞及病毒
1.1.3 實(shí)驗(yàn)試劑及耗材
1.1.4 實(shí)驗(yàn)儀器及設(shè)備
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
1.2.1 CyHV-2 的培養(yǎng)與病毒滴度測(cè)定
1.2.2 健康異育銀鯽各組織Cag IFNa的本底表達(dá)分析
1.2.3 異育銀鯽感染CyHV-2 后頭腎和脾臟中Cag IFNa時(shí)序表達(dá)分析
1.2.4 Poly I:C刺激和CyHV-2 感染后GiCB細(xì)胞中Cag IFNa時(shí)序表達(dá)分析
1.2.5 熒光定量PCR引物設(shè)計(jì)及實(shí)驗(yàn)方法
1.2.6 數(shù)據(jù)分析
2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.1 健康異育銀鯽Cag IFNa的組織表達(dá)分布
2.2 異育銀鯽感染CyHV-2 后頭腎和脾臟中Cag IFNa時(shí)序表達(dá)模式
2.3 Poly Ⅰ:C刺激和CyHV-2 感染GiCB細(xì)胞后Cag IFNa時(shí)序表達(dá)模式
3 討論
第四章 異育銀鯽Ⅰ型干擾素真核表達(dá)載體構(gòu)建及抗病毒活性研究
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.1.1 細(xì)胞和病毒
1.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑及耗材
1.1.3 實(shí)驗(yàn)儀器及耗材
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
1.2.1 真核表達(dá)質(zhì)粒pCMV-HA-Cag IFNa的構(gòu)建
1.2.1.1 Cag IFNa ORF片段的克隆
1.2.1.2 Cag IFNa ORF與 pCMV-HA-N質(zhì)粒的酶切與連接
1.2.1.3 pCMV-HA-Cag IFNa超純質(zhì)粒的提取
1.2.2 真核表達(dá)質(zhì)粒pCMV-HA-Cag IFNa轉(zhuǎn)染GiCB細(xì)胞
1.2.3 Western-blot驗(yàn)證Cag IFNa基因的過(guò)表達(dá)
1.2.4 GiCB細(xì)胞中過(guò)表達(dá)Cag IFNa后抗病毒活性研究
1.2.4.1 細(xì)胞病變觀察及病毒滴度測(cè)定
1.2.4.2 熒光定量PCR檢測(cè)病毒基因及Ⅰ型干擾素信號(hào)通路相關(guān)基因的表達(dá)
1.2.5 數(shù)據(jù)分析
2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.1 pCMV-HA-Cag IFNa表達(dá)質(zhì)粒的構(gòu)建
2.1.1 Cag IFNa基因ORF擴(kuò)增
2.1.2 陽(yáng)性克隆篩選
2.2 免疫印跡檢測(cè)HA-Cag IFNa蛋白在GiCB細(xì)胞中的表達(dá)
2.3 GiCB細(xì)胞感染CyHV-2 后的細(xì)胞形態(tài)學(xué)觀察
2.4 質(zhì)粒轉(zhuǎn)染后CyHV-2 病毒滴度及病毒相關(guān)基因檢測(cè)
2.5 質(zhì)粒轉(zhuǎn)染后IFN-Ⅰ系統(tǒng)相關(guān)基因的檢測(cè)
3 討論
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
本文編號(hào):3199265
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摘要
ABSTRACT
縮略語(yǔ)表(按字母順序排列)
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 硬骨魚(yú)類(lèi)Ⅰ型干擾素研究進(jìn)展
1.1 Ⅰ型干擾素的種類(lèi)及表達(dá)特征
1.1.1 Ⅰ型干擾素的種類(lèi)
1.1.2 Ⅰ型干擾素的表達(dá)特征
1.2 硬骨魚(yú)類(lèi)Ⅰ型干擾素受體及信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路
1.2.1 Ⅰ型干擾素受體
1.2.2 Ⅰ型干擾素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路
1.3 硬骨魚(yú)類(lèi)Ⅰ型干擾素抗病毒功能及其應(yīng)用
1.3.1 Ⅰ型干擾素抗病毒功能
1.3.2 Ⅰ型干擾素應(yīng)用
2 鯉皰疹病毒Ⅱ型研究進(jìn)展
2.1 流行病學(xué)
2.1.1 流行區(qū)域
2.1.2 傳播特征
2.2 臨床癥狀及病理特征
2.3 病原學(xué)
2.4 檢測(cè)技術(shù)
2.4.1 電鏡技術(shù)
2.4.2 細(xì)胞培養(yǎng)技術(shù)
2.4.3 分子生物學(xué)檢測(cè)
2.4.3.1 聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)
2.4.3.2 實(shí)時(shí)熒光定量PCR
2.4.3.3 環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)
3 魚(yú)類(lèi)免疫系統(tǒng)的研究
第二章 異育銀鯽Ⅰ型干擾素的克隆及生物信息學(xué)分析
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物、質(zhì)粒和菌種
1.1.2 主要試劑及耗材
1.1.3 主要實(shí)驗(yàn)儀器
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
1.2.1 異育銀鯽組織樣品RNA提取
1.2.2 異育銀鯽組織樣品c DNA合成
1.2.3 5'RACE-Ready c DNA和3'RACE-Ready c DNA合成
1.2.4 RACE法擴(kuò)增異育銀鯽IFN-Ⅰ基因c DNA部分序列
1.2.5 PCR產(chǎn)物膠回收
1.2.6 PCR產(chǎn)物的連接與轉(zhuǎn)化
1.2.7 陽(yáng)性克隆的篩選與測(cè)序鑒定
1.2.8 普通PCR擴(kuò)增確定Cag IFNa ORF序列全長(zhǎng)
1.2.9 生物信息學(xué)分析
2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.1 異育銀鯽IFN-Ⅰ(Cag IFNa)核苷酸序列與氨基酸序列分析
2.2 Cag IFNa氨基酸多序列比對(duì)分析
2.3 Cag IFNa氨基酸系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析
3 討論
第三章 異育銀鯽Ⅰ型干擾素組織表達(dá)分布與誘導(dǎo)表達(dá)
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
1.1.2 細(xì)胞及病毒
1.1.3 實(shí)驗(yàn)試劑及耗材
1.1.4 實(shí)驗(yàn)儀器及設(shè)備
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
1.2.1 CyHV-2 的培養(yǎng)與病毒滴度測(cè)定
1.2.2 健康異育銀鯽各組織Cag IFNa的本底表達(dá)分析
1.2.3 異育銀鯽感染CyHV-2 后頭腎和脾臟中Cag IFNa時(shí)序表達(dá)分析
1.2.4 Poly I:C刺激和CyHV-2 感染后GiCB細(xì)胞中Cag IFNa時(shí)序表達(dá)分析
1.2.5 熒光定量PCR引物設(shè)計(jì)及實(shí)驗(yàn)方法
1.2.6 數(shù)據(jù)分析
2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.1 健康異育銀鯽Cag IFNa的組織表達(dá)分布
2.2 異育銀鯽感染CyHV-2 后頭腎和脾臟中Cag IFNa時(shí)序表達(dá)模式
2.3 Poly Ⅰ:C刺激和CyHV-2 感染GiCB細(xì)胞后Cag IFNa時(shí)序表達(dá)模式
3 討論
第四章 異育銀鯽Ⅰ型干擾素真核表達(dá)載體構(gòu)建及抗病毒活性研究
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.1.1 細(xì)胞和病毒
1.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑及耗材
1.1.3 實(shí)驗(yàn)儀器及耗材
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
1.2.1 真核表達(dá)質(zhì)粒pCMV-HA-Cag IFNa的構(gòu)建
1.2.1.1 Cag IFNa ORF片段的克隆
1.2.1.2 Cag IFNa ORF與 pCMV-HA-N質(zhì)粒的酶切與連接
1.2.1.3 pCMV-HA-Cag IFNa超純質(zhì)粒的提取
1.2.2 真核表達(dá)質(zhì)粒pCMV-HA-Cag IFNa轉(zhuǎn)染GiCB細(xì)胞
1.2.3 Western-blot驗(yàn)證Cag IFNa基因的過(guò)表達(dá)
1.2.4 GiCB細(xì)胞中過(guò)表達(dá)Cag IFNa后抗病毒活性研究
1.2.4.1 細(xì)胞病變觀察及病毒滴度測(cè)定
1.2.4.2 熒光定量PCR檢測(cè)病毒基因及Ⅰ型干擾素信號(hào)通路相關(guān)基因的表達(dá)
1.2.5 數(shù)據(jù)分析
2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.1 pCMV-HA-Cag IFNa表達(dá)質(zhì)粒的構(gòu)建
2.1.1 Cag IFNa基因ORF擴(kuò)增
2.1.2 陽(yáng)性克隆篩選
2.2 免疫印跡檢測(cè)HA-Cag IFNa蛋白在GiCB細(xì)胞中的表達(dá)
2.3 GiCB細(xì)胞感染CyHV-2 后的細(xì)胞形態(tài)學(xué)觀察
2.4 質(zhì)粒轉(zhuǎn)染后CyHV-2 病毒滴度及病毒相關(guān)基因檢測(cè)
2.5 質(zhì)粒轉(zhuǎn)染后IFN-Ⅰ系統(tǒng)相關(guān)基因的檢測(cè)
3 討論
結(jié)論
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