目的:頭頸部鱗狀細胞癌（Head and neck squamous cell cancer,HNSCC）是全球最常見的癌癥類型之一。有許多報道表明,通過數(shù)據(jù)庫挖掘探索的生物標志物在預測HNSCC預后中起著至關(guān)重要的作用。然而,用于預后分析的單一生物標志物是不夠的。因此,越來越多的證據(jù)表明基因簽名可能是HNSCC預后的更好選擇。方法:1.下載人類腫瘤基因組數(shù)據(jù)庫（The Cancer Genome Atlas,TCGA）中頭頸鱗癌相關(guān)的mRNA數(shù)據(jù)及臨床病理參數(shù)。2.進行基因集富集分析（Gene Set Enrichment Analysis,GSEA）,我們發(fā)現(xiàn)參與上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化（Epithelial-Mesenchymal Transformation,EMT）的基因集HNSCC發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)。以歸一化P值（P<0.05）為條件進一步篩選所研究的基因集。3.篩選癌與癌旁組織中差異表達的基因。4.單因素以及多因素Cox回歸模型進行mRNAs與預后相關(guān)的篩選,并構(gòu)建基于mRNAs表達的分子標簽用于預測患者的預后。5.K-M曲線預測分子標簽對頭頸鱗癌患者預后的預測能力。6.將患者隨... 

【文章來源】：中國醫(yī)科大學遼寧省

【文章頁數(shù)】：51 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
英文縮略語
1 前言
2 材料與方法
    2.1 患者臨床參數(shù)及基因組表達數(shù)據(jù)
    2.2 功能富集分析
    2.3 統(tǒng)計分析
3 結(jié)果
    3.1 上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化相關(guān)基因集在癌旁樣本和腫瘤樣本之間差異顯著
    3.2 Cox回歸分析上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化相關(guān)的預后基因
    3.3 構(gòu)建基于4個mRNAs的分子標簽
    3.4 mRNAs分子標簽獨立于其他臨床變量預測患者預后
    3.5 HNSCC中4-m RNA標簽的功能富集分析
4 討論
5 結(jié)論
本研究創(chuàng)新性的自我評價
參考文獻
綜述
    1 前言
    2 分子技術(shù)和遺傳基因改變與頭頸癌
        2.1 細胞遺傳學與雜合性丟失
        2.2 微陣列
        2.3 抑癌基因
        2.4 癌基因
        2.5 線粒體突變
        2.6 其他基因改變
    3 結(jié)論
    參考文獻
攻讀學位期間取得的研究成果
致謝
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本文編號：3199162