利用CRISPR/Cas9在Bel-7402細(xì)胞中靶向敲除SMYD3基因的初步研究
發(fā)布時(shí)間:2021-05-20 17:17
目的:1.設(shè)計(jì)三個(gè)靶向于SMYD3基因的sgRNA。分別記為sgRNA#1、sgRNA#2和sgRNA#3。2.構(gòu)建sgRNA#1-PX459、sgRNA#2-PX459和sgRNA#3-PX459重組質(zhì)粒。3.檢測(cè)SMYD3蛋白在HEK293T細(xì)胞和Bel-7402細(xì)胞中的表達(dá)情況。4.探索Lipofectamine?2000:1μg的sgRNA-PX459重組質(zhì)粒最佳的包裹比例。5.比較不同濃度嘌呤霉素分別作用于HEK293T細(xì)胞和Bel-7402細(xì)胞,確定三天時(shí)最低致死濃度。6.比較CRISPR/Cas9打靶載體的活性。7.制備SMYD3基因缺陷型Bel-7402細(xì)胞株。8.比較SMYD3基因缺陷型Bel-7402細(xì)胞株與野生型Bel-7402細(xì)胞的增殖能力。9.比較SMYD3基因缺陷型Bel-7402細(xì)胞株與野生型Bel-7402細(xì)胞的遷移能力。方法:1.在GenBank網(wǎng)站,搜索人SMYD3基因序列。在http://crispr.mit.edu/網(wǎng)站,設(shè)計(jì)靶向于SMYD3基因的sgRNA。2.使PX459質(zhì)粒線性化,把sgRNA連接入線性化的PX459,構(gòu)建sgRNA-PX4...
【文章來(lái)源】:山西醫(yī)科大學(xué)山西省
【文章頁(yè)數(shù)】:79 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
常用縮寫(xiě)詞中英文對(duì)照表
前言
1 實(shí)驗(yàn)材料
1.1 細(xì)胞株
1.2 菌株
1.3 質(zhì)粒
1.4 主要試劑
1.5 實(shí)驗(yàn)所需引物
1.6 實(shí)驗(yàn)器材
1.7 主要試劑配制
2 實(shí)驗(yàn)方法
2.1 質(zhì)粒準(zhǔn)備
2.2 細(xì)胞培養(yǎng)
2.3 WesternBlot檢測(cè)SMYD3蛋白在HEK293T細(xì)胞和Bel-7402細(xì)胞中的表達(dá)
2.4 CRISPR/Cas9打靶載體的構(gòu)建與驗(yàn)證
2.5 優(yōu)化脂質(zhì)體最佳負(fù)載量
2.6 嘌呤霉素對(duì)HEK293T細(xì)胞和Bel-7402細(xì)胞最低致死濃度篩選
2.7 CRISPR/Cas9打靶活性檢測(cè)
2.8 Bel-7402細(xì)胞SMYD3基因缺陷型單克隆細(xì)胞株制備
2.9 WesternBlot法檢測(cè)SMYD3蛋白在單克隆細(xì)胞株的表達(dá)
2.10 靶目的DNA片段測(cè)序驗(yàn)證
2.11 SMYD3敲除后對(duì)細(xì)胞功能的影響
2.12 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
3 結(jié)果
3.1 PX459質(zhì)粒測(cè)序結(jié)果
3.2 sgRNA設(shè)計(jì)結(jié)果
3.3 PX459酶切結(jié)果
3.4 菌液PCR鑒定陽(yáng)性sgRNA-PX459重組質(zhì)粒
3.5 sgRNA-PX459重組質(zhì)粒測(cè)序結(jié)果
3.6 細(xì)胞培養(yǎng)
3.7 WesternBlot檢測(cè)SMYD3蛋白在HEK293T細(xì)胞和Bel-7402細(xì)胞中的表達(dá)
3.8 脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染條件優(yōu)化
3.9 PCR產(chǎn)物分子量大小驗(yàn)證引物的有效性
3.10 測(cè)序驗(yàn)證靶位點(diǎn)PCR引物
3.11 打靶載體活性檢測(cè)
3.12 WesternBlot檢測(cè)SMYD3蛋白表達(dá)
3.13 篩選SMYD3基因缺陷性Bel-7402細(xì)胞株
3.14 cck-8法檢測(cè)細(xì)胞增殖
3.15 劃痕實(shí)驗(yàn)檢測(cè)細(xì)胞遷移
4 討論
5 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
綜述
參考文獻(xiàn)
致謝
在學(xué)期間研究成果
個(gè)人簡(jiǎn)歷
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基因組編輯技術(shù)在植物中的研究進(jìn)展與應(yīng)用前景[J]. 謝科,饒力群,李紅偉,安學(xué)麗,方才臣,萬(wàn)向元. 中國(guó)生物工程雜志. 2013(06)
[2]shRNA干擾SMYD3對(duì)肝癌細(xì)胞c-Myc表達(dá)及凋亡的影響[J]. 劉鑫,陳立波,葉進(jìn),江軍,何軍,徐鋆耀,錢(qián)偉. 世界華人消化雜志. 2008(13)
[3]Silencing SMYD3 in hepatoma demethylates RIZI promoter induces apoptosis and inhibits cell proliferation and migration[J]. Li-Bo Chen, Jun-Yao Xu, Zhen Yang, Guo-Bin Wang Li-Bo Chen, Guo-Bin Wang, Hepatobiliary center, Union Hospital of Huazhong University of Science & Technology, Wuhan 430022, Hubei province, China Jun-Yao Xu, Department of General Surgery, The Second Affiliated Hospital of Sun Yat-seu University, Guangzhou 510120, Guangdong province, China Zhen Yang, Department of integrated surgery, Tongji Hospital of Huazhong University of Science & Technology, Wuhan 430030, Hubei province, China. World Journal of Gastroenterology. 2007(43)
本文編號(hào):3198136
【文章來(lái)源】:山西醫(yī)科大學(xué)山西省
【文章頁(yè)數(shù)】:79 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
常用縮寫(xiě)詞中英文對(duì)照表
前言
1 實(shí)驗(yàn)材料
1.1 細(xì)胞株
1.2 菌株
1.3 質(zhì)粒
1.4 主要試劑
1.5 實(shí)驗(yàn)所需引物
1.6 實(shí)驗(yàn)器材
1.7 主要試劑配制
2 實(shí)驗(yàn)方法
2.1 質(zhì)粒準(zhǔn)備
2.2 細(xì)胞培養(yǎng)
2.3 WesternBlot檢測(cè)SMYD3蛋白在HEK293T細(xì)胞和Bel-7402細(xì)胞中的表達(dá)
2.4 CRISPR/Cas9打靶載體的構(gòu)建與驗(yàn)證
2.5 優(yōu)化脂質(zhì)體最佳負(fù)載量
2.6 嘌呤霉素對(duì)HEK293T細(xì)胞和Bel-7402細(xì)胞最低致死濃度篩選
2.7 CRISPR/Cas9打靶活性檢測(cè)
2.8 Bel-7402細(xì)胞SMYD3基因缺陷型單克隆細(xì)胞株制備
2.9 WesternBlot法檢測(cè)SMYD3蛋白在單克隆細(xì)胞株的表達(dá)
2.10 靶目的DNA片段測(cè)序驗(yàn)證
2.11 SMYD3敲除后對(duì)細(xì)胞功能的影響
2.12 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
3 結(jié)果
3.1 PX459質(zhì)粒測(cè)序結(jié)果
3.2 sgRNA設(shè)計(jì)結(jié)果
3.3 PX459酶切結(jié)果
3.4 菌液PCR鑒定陽(yáng)性sgRNA-PX459重組質(zhì)粒
3.5 sgRNA-PX459重組質(zhì)粒測(cè)序結(jié)果
3.6 細(xì)胞培養(yǎng)
3.7 WesternBlot檢測(cè)SMYD3蛋白在HEK293T細(xì)胞和Bel-7402細(xì)胞中的表達(dá)
3.8 脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染條件優(yōu)化
3.9 PCR產(chǎn)物分子量大小驗(yàn)證引物的有效性
3.10 測(cè)序驗(yàn)證靶位點(diǎn)PCR引物
3.11 打靶載體活性檢測(cè)
3.12 WesternBlot檢測(cè)SMYD3蛋白表達(dá)
3.13 篩選SMYD3基因缺陷性Bel-7402細(xì)胞株
3.14 cck-8法檢測(cè)細(xì)胞增殖
3.15 劃痕實(shí)驗(yàn)檢測(cè)細(xì)胞遷移
4 討論
5 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
綜述
參考文獻(xiàn)
致謝
在學(xué)期間研究成果
個(gè)人簡(jiǎn)歷
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基因組編輯技術(shù)在植物中的研究進(jìn)展與應(yīng)用前景[J]. 謝科,饒力群,李紅偉,安學(xué)麗,方才臣,萬(wàn)向元. 中國(guó)生物工程雜志. 2013(06)
[2]shRNA干擾SMYD3對(duì)肝癌細(xì)胞c-Myc表達(dá)及凋亡的影響[J]. 劉鑫,陳立波,葉進(jìn),江軍,何軍,徐鋆耀,錢(qián)偉. 世界華人消化雜志. 2008(13)
[3]Silencing SMYD3 in hepatoma demethylates RIZI promoter induces apoptosis and inhibits cell proliferation and migration[J]. Li-Bo Chen, Jun-Yao Xu, Zhen Yang, Guo-Bin Wang Li-Bo Chen, Guo-Bin Wang, Hepatobiliary center, Union Hospital of Huazhong University of Science & Technology, Wuhan 430022, Hubei province, China Jun-Yao Xu, Department of General Surgery, The Second Affiliated Hospital of Sun Yat-seu University, Guangzhou 510120, Guangdong province, China Zhen Yang, Department of integrated surgery, Tongji Hospital of Huazhong University of Science & Technology, Wuhan 430030, Hubei province, China. World Journal of Gastroenterology. 2007(43)
本文編號(hào):3198136
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