水稻YEATS結構域包含基因OsYAF9的克隆及材料創(chuàng)制
發(fā)布時間:2021-05-20 02:03
抽穗期作為重要的農(nóng)藝性狀,是水稻適應季節(jié)、氣溫變化,保證產(chǎn)量的關鍵。水稻抽穗期同時受遺傳和環(huán)境的影響。目前,擬南芥作為長日照模式植物,對其開花時間的調(diào)控機制研究已經(jīng)非常深入。但是,水稻作為短日照模式植物,深入的抽穗期分子調(diào)控機制還有待進一步發(fā)掘。已有研究表明,YEATS結構域在進化上保守,在超過100個不同的真核蛋白中被發(fā)現(xiàn),參與轉錄與染色質(zhì)修飾。在酵母中,Yaf9,Taf14和Sas5組成YEATS結構域蛋白家族,其中Yaf9是組蛋白H4乙酰轉移酶復合體NuA4和染色質(zhì)重塑復合體SWR1的共同亞基,介導NuA4和SWR1復合物的聚合和分離,從而影響其功能。YEATS結構域是Yaf9行使功能所必須的,酵母菌缺失Yaf9時,對DNA損傷、冷害等較敏感。酵母Yaf9蛋白在擬南芥中有兩個同源物YAF9a和YAF9b(TAF14),其功能結構域YEATS在酵母,水稻,苜蓿,人和果蠅中的序列保守。研究發(fā)現(xiàn),YAF9a和YAF9b功能冗余,雙重突變體表現(xiàn)出包括早花在內(nèi)的多種表型缺陷。其中YAF9a通過影響FLC組蛋白H4乙;娇刂崎_花時間。但是,水稻中YEATS結構域包含基因的功能至今未見報道...
【文章來源】:沈陽農(nóng)業(yè)大學遼寧省
【文章頁數(shù)】:52 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻綜述
1.1 表觀遺傳學的概述
1.2 染色質(zhì)重塑的研究進展
1.2.1 染色質(zhì)重塑的分子機制
1.2.2 染色質(zhì)重塑復合體
1.2.3 染色質(zhì)重塑復合體在植物體中的功能
1.3 組蛋白乙酰化修飾的研究進展
1.3.1 組蛋白乙;瘜蜣D錄的調(diào)控作用
1.3.2 植物中的組蛋白乙;D移酶基因與乙;饔梦稽c
1.3.3 植物中的組蛋白去乙;淖饔脵C制
1.4 水稻抽穗期的調(diào)控機理
1.5 YEATS結構域在真核生物中的功能分析
1.6 研究的目的和意義
第二章 材料與方法
2.1 試驗材料
2.1.1 植物材料及生長條件
2.1.2 試驗中用到的菌種
2.1.3 試驗中用到的載體
2.1.4 試驗中所用到的試劑
2.1.5 試驗中所用到的儀器
2.2 試驗方法
2.2.1 OsYAF9 基因序列的獲取
2.2.2 OsYAF9 基因的進化分析
2.2.3 YEATS結構域序列保守性及蛋白結構預測
2.2.4 OsYAF9 基因的克隆及載體構建
2.2.5 農(nóng)桿菌介導的水稻遺傳轉化
2.2.6 水稻材料T1 代陽性植株檢測
2.2.7 瞬時轉化水稻原生質(zhì)體并觀察
2.2.8 轉基因植株編輯位點的檢測
2.2.9 不同組織器官中的表達模式分析
第三章 結果與分析
3.1 水稻YEATS結構域包含基因OsYAF9 的生物信息學分析
3.1.1 OsYAF9 基因的進化分析
3.1.2 Os YAF9 與其他真核生物中YAF9 的序列保守性分析
3.1.3 OsYAF9與YAF9a、YAF9b三級結構預測
3.2 水稻YEATS結構域包含基因OSYAF9 的載體構建和遺傳轉化
3.2.1 片段的PCR擴增
3.2.2 連接載體并鑒定
3.2.3 水稻的遺傳轉化
3.2.4 水稻遺傳轉化材料的陽性率檢測
3.2.5 基因編輯位點檢測
3.3 水稻中OSYAF9 基因的功能分析
3.3.1 水稻中OsYAF9 基因的表達模式分析
3.3.2 水稻中OsYAF9 基因的亞細胞定位
第四章 結論與討論
4.1 全文結論
4.2 討論
4.2.1 OsYAF9 基因的保守性分析
4.2.2 OsYAF9 基因的功能研究
參考文獻
附錄
致謝
【參考文獻】:
博士論文
[1]INO80染色質(zhì)重塑復合物通過從p21啟動子移除H2A.Z來激活doxorubicin誘導的p21表達[D]. 丁健.吉林大學 2018
[2]水稻OsTIPs的功能及其分子機理研究[D]. 楊賢莉.沈陽農(nóng)業(yè)大學 2017
[3]水稻OsFBHs的功能及其分子機理研究[D]. 閆志強.沈陽農(nóng)業(yè)大學 2017
[4]水稻染色質(zhì)重塑復合體SWR1的功能研究[D]. 崔志波.沈陽農(nóng)業(yè)大學 2015
[5]基因表達調(diào)控相關蛋白的結構和功能的研究[D]. 張穩(wěn).中國科學技術大學 2011
[6]組蛋白乙;瘜λ净ㄆ、基因表達以及雜種優(yōu)勢的表觀調(diào)控機制[D]. 李晨.華中農(nóng)業(yè)大學 2011
碩士論文
[1]水稻組蛋白去乙;窸sHDA706和OsHDA714的功能研究[D]. 劉源.華中農(nóng)業(yè)大學 2018
本文編號:3196863
【文章來源】:沈陽農(nóng)業(yè)大學遼寧省
【文章頁數(shù)】:52 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻綜述
1.1 表觀遺傳學的概述
1.2 染色質(zhì)重塑的研究進展
1.2.1 染色質(zhì)重塑的分子機制
1.2.2 染色質(zhì)重塑復合體
1.2.3 染色質(zhì)重塑復合體在植物體中的功能
1.3 組蛋白乙酰化修飾的研究進展
1.3.1 組蛋白乙;瘜蜣D錄的調(diào)控作用
1.3.2 植物中的組蛋白乙;D移酶基因與乙;饔梦稽c
1.3.3 植物中的組蛋白去乙;淖饔脵C制
1.4 水稻抽穗期的調(diào)控機理
1.5 YEATS結構域在真核生物中的功能分析
1.6 研究的目的和意義
第二章 材料與方法
2.1 試驗材料
2.1.1 植物材料及生長條件
2.1.2 試驗中用到的菌種
2.1.3 試驗中用到的載體
2.1.4 試驗中所用到的試劑
2.1.5 試驗中所用到的儀器
2.2 試驗方法
2.2.1 OsYAF9 基因序列的獲取
2.2.2 OsYAF9 基因的進化分析
2.2.3 YEATS結構域序列保守性及蛋白結構預測
2.2.4 OsYAF9 基因的克隆及載體構建
2.2.5 農(nóng)桿菌介導的水稻遺傳轉化
2.2.6 水稻材料T1 代陽性植株檢測
2.2.7 瞬時轉化水稻原生質(zhì)體并觀察
2.2.8 轉基因植株編輯位點的檢測
2.2.9 不同組織器官中的表達模式分析
第三章 結果與分析
3.1 水稻YEATS結構域包含基因OsYAF9 的生物信息學分析
3.1.1 OsYAF9 基因的進化分析
3.1.2 Os YAF9 與其他真核生物中YAF9 的序列保守性分析
3.1.3 OsYAF9與YAF9a、YAF9b三級結構預測
3.2 水稻YEATS結構域包含基因OSYAF9 的載體構建和遺傳轉化
3.2.1 片段的PCR擴增
3.2.2 連接載體并鑒定
3.2.3 水稻的遺傳轉化
3.2.4 水稻遺傳轉化材料的陽性率檢測
3.2.5 基因編輯位點檢測
3.3 水稻中OSYAF9 基因的功能分析
3.3.1 水稻中OsYAF9 基因的表達模式分析
3.3.2 水稻中OsYAF9 基因的亞細胞定位
第四章 結論與討論
4.1 全文結論
4.2 討論
4.2.1 OsYAF9 基因的保守性分析
4.2.2 OsYAF9 基因的功能研究
參考文獻
附錄
致謝
【參考文獻】:
博士論文
[1]INO80染色質(zhì)重塑復合物通過從p21啟動子移除H2A.Z來激活doxorubicin誘導的p21表達[D]. 丁健.吉林大學 2018
[2]水稻OsTIPs的功能及其分子機理研究[D]. 楊賢莉.沈陽農(nóng)業(yè)大學 2017
[3]水稻OsFBHs的功能及其分子機理研究[D]. 閆志強.沈陽農(nóng)業(yè)大學 2017
[4]水稻染色質(zhì)重塑復合體SWR1的功能研究[D]. 崔志波.沈陽農(nóng)業(yè)大學 2015
[5]基因表達調(diào)控相關蛋白的結構和功能的研究[D]. 張穩(wěn).中國科學技術大學 2011
[6]組蛋白乙;瘜λ净ㄆ、基因表達以及雜種優(yōu)勢的表觀調(diào)控機制[D]. 李晨.華中農(nóng)業(yè)大學 2011
碩士論文
[1]水稻組蛋白去乙;窸sHDA706和OsHDA714的功能研究[D]. 劉源.華中農(nóng)業(yè)大學 2018
本文編號:3196863
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