蔗糖轉(zhuǎn)運蛋白（SUT）在蔗糖從"源"到"庫"的運輸與分配過程中發(fā)揮著重要作用。該研究基于最新公布的陸地棉基因組數(shù)據(jù),利用生物信息學和熒光定量PCR等方法,對陸地棉SUT基因家族進行全基因組鑒定,并對他們的表達特性進行系統(tǒng)分析。結(jié)果顯示:（1）在陸地棉基因組中,共鑒定到18個GhSUT基因（GhSUT1-GhSUT18）,他們不均勻地分布在陸地棉11條染色體上。（2）GhSUT蛋白間序列一致性很高,均具有11～12個跨膜結(jié)構(gòu)域,且都定位于質(zhì)膜。（3）進化關(guān)系分析表明,陸地棉GhSUT蛋白主要分布在雙子葉植物特有的SUT1亞組,以及單、雙子葉植物共有的SUT2亞組和SUT4亞組,其中SUT1亞組成員最多,包含8個GhSUT基因。（4）位于同一亞組的GhSUT基因具有相似的內(nèi)含子-外顯子分布模式,不同亞組間GhSUT基因內(nèi)含子/外顯子數(shù)目差異很大。（5）轉(zhuǎn)錄組分析表明,GhSUT基因在表達水平上存在差異,GhSUT1和GhSUT10在被檢測的組織不表達,GhSUT5、GhSUT14、GhSUT7和GhSUT16在被檢測的組織表達量較低,其他GhSUT基因在被檢測的組織具有較高的表達水平;另外... 

【文章來源】：西北植物學報. 2020,40(08)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：10 頁

【文章目錄】：
1 材料和方法
    1.1 實驗材料
    1.2 方 法
        1.2.1 陸地棉SUT家族成員的鑒定
        1.2.2 蛋白序列分析和亞細胞定位預測
        1.2.3 系統(tǒng)進化樹分析
        1.2.4 基因結(jié)構(gòu)和染色體定位分析
        1.2.5 基因表達特性的轉(zhuǎn)錄組分析
        1.2.6 RNA的提取和cDNA反轉(zhuǎn)錄
        1.2.7 熒光定量PCR(qRT-PCR)分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 陸地棉SUT基因家族的全基因組鑒定
    2.2 陸地棉SUT家族成員的蛋白序列分析
    2.3 陸地棉SUT家族成員的系統(tǒng)進化樹分析
    2.4 陸地棉SUT家族成員的基因結(jié)構(gòu)分析
    2.5 陸地棉SUT家族成員的染色體分布
    2.6 陸地棉SUT家族基因表達特性的轉(zhuǎn)錄組分析
    2.7 陸地棉GhSUT基因組織表達特性分析
3 討 論


【參考文獻】：
期刊論文
[1]陸地棉蔗糖磷酸合成酶基因家族的鑒定及表達分析[J]. 晁毛妮,胡海燕,付麗娜,溫青玉,胡根海,駱雨鋒,李婭楠,王清連.  棉花學報. 2020(01)
[2]植物蔗糖轉(zhuǎn)運蛋白研究進展[J]. 張清,胡偉長,張積森.  熱帶作物學報. 2016(01)
[3]水稻蔗糖轉(zhuǎn)運蛋白研究進展[J]. 孫學武,譚炎寧,孫志忠,袁定陽,段美娟.  生命科學研究. 2014(02)
[4]擬南芥蔗糖轉(zhuǎn)運蛋白（SUTs）的功能研究進展[J]. 高蕾,肖文芳,李文燕,彭昌操.  分子植物育種. 2011(02)



本文編號：3179577