目的:利用生物信息學(xué)技術(shù),預(yù)測(cè)沙利度胺在血液系統(tǒng)腫瘤治療中所參與的信號(hào)通路、蛋白互作網(wǎng)絡(luò)及靶基因,并通過分子對(duì)接軟件進(jìn)行靶基因驗(yàn)證。研究方法:利用Pubchem數(shù)據(jù)庫獲取沙利度胺的藥物信息;BATMAN-TCM數(shù)據(jù)庫及Drugbank數(shù)據(jù)庫獲得沙利度胺的作用靶點(diǎn);STRING10.5數(shù)據(jù)庫對(duì)沙利度胺作用靶點(diǎn)相關(guān)基因的表達(dá)產(chǎn)物進(jìn)行蛋白質(zhì)相互作用分析;WebGestalt數(shù)據(jù)庫對(duì)富集基因進(jìn)行GO分析及Pathway分析;cBioPortal數(shù)據(jù)庫和HumanProteinAtlas數(shù)據(jù)庫分析靶基因在人體組織中的表達(dá)及變異情況;Schrodinger Suites軟件對(duì)沙利度胺及靶基因進(jìn)行分子對(duì)接驗(yàn)證。結(jié)果:利用BATMAN-TCM數(shù)據(jù)庫及Drugbank數(shù)據(jù)庫篩選出52個(gè)沙利度胺作用靶點(diǎn);利用STRING10.5數(shù)據(jù)庫分別對(duì)52個(gè)靶基因所對(duì)應(yīng)的蛋白進(jìn)行分析,共篩選出300個(gè)與靶蛋白相互作用的蛋白;利用WebGestalt數(shù)據(jù)庫對(duì)上述基因進(jìn)行Pathway分析,富集在10條通路,篩選出4條與腫瘤相關(guān)的信號(hào)通路:MAPK signaling pathway、Ras signaling path... 

【文章來源】：中國(guó)醫(yī)科大學(xué)遼寧省

【文章頁數(shù)】：32 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
abstract
英文縮略語
1 前言
2 材料方法
3 研究結(jié)果
    3.1 利用Pubchem數(shù)據(jù)庫獲得沙利度胺的藥物信息及分子結(jié)構(gòu)式并利BATMAN-TCM數(shù)據(jù)庫及獲取沙利度胺的作用靶點(diǎn)
    3.2 通過STRING數(shù)據(jù)庫進(jìn)行蛋白互作分析
    3.3 通過Web Gestalt數(shù)據(jù)庫將基因富集到通路上
    3.4 hub基因在腫瘤中的變異情況
    3.5 hub基因在人類不同癌組織中的表達(dá)情況
    3.6 通過Schrodinger Suites軟件對(duì)靶基因進(jìn)行分子對(duì)接驗(yàn)證
4 討論
5 結(jié)論
本研究創(chuàng)新性的自我評(píng)價(jià)
參考文獻(xiàn)
綜述
    參考文獻(xiàn)
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)介


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號(hào)：3173472