目的:利用生物信息學技術,預測沙利度胺在血液系統(tǒng)腫瘤治療中所參與的信號通路、蛋白互作網(wǎng)絡及靶基因,并通過分子對接軟件進行靶基因驗證。研究方法:利用Pubchem數(shù)據(jù)庫獲取沙利度胺的藥物信息;BATMAN-TCM數(shù)據(jù)庫及Drugbank數(shù)據(jù)庫獲得沙利度胺的作用靶點;STRING10.5數(shù)據(jù)庫對沙利度胺作用靶點相關基因的表達產(chǎn)物進行蛋白質相互作用分析;WebGestalt數(shù)據(jù)庫對富集基因進行GO分析及Pathway分析;cBioPortal數(shù)據(jù)庫和HumanProteinAtlas數(shù)據(jù)庫分析靶基因在人體組織中的表達及變異情況;Schrodinger Suites軟件對沙利度胺及靶基因進行分子對接驗證。結果:利用BATMAN-TCM數(shù)據(jù)庫及Drugbank數(shù)據(jù)庫篩選出52個沙利度胺作用靶點;利用STRING10.5數(shù)據(jù)庫分別對52個靶基因所對應的蛋白進行分析,共篩選出300個與靶蛋白相互作用的蛋白;利用WebGestalt數(shù)據(jù)庫對上述基因進行Pathway分析,富集在10條通路,篩選出4條與腫瘤相關的信號通路:MAPK signaling pathway、Ras signaling path... 

【文章來源】：中國醫(yī)科大學遼寧省

【文章頁數(shù)】：32 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
abstract
英文縮略語
1 前言
2 材料方法
3 研究結果
    3.1 利用Pubchem數(shù)據(jù)庫獲得沙利度胺的藥物信息及分子結構式并利BATMAN-TCM數(shù)據(jù)庫及獲取沙利度胺的作用靶點
    3.2 通過STRING數(shù)據(jù)庫進行蛋白互作分析
    3.3 通過Web Gestalt數(shù)據(jù)庫將基因富集到通路上
    3.4 hub基因在腫瘤中的變異情況
    3.5 hub基因在人類不同癌組織中的表達情況
    3.6 通過Schrodinger Suites軟件對靶基因進行分子對接驗證
4 討論
5 結論
本研究創(chuàng)新性的自我評價
參考文獻
綜述
    參考文獻
致謝
個人簡介


【參考文獻】：
期刊論文
[1]炎癥在腫瘤發(fā)生過程中所起作用研究進展[J]. 周峰,劉子杰,段勇.  世界最新醫(yī)學信息文摘. 2018(09)
[2]MAPK/ERK信號傳導通路與腫瘤發(fā)生的相關機制研究進展[J]. 劉偉,黃瑋,李瑞琴.  中國現(xiàn)代醫(yī)藥雜志. 2016(08)
[3]靶向RAS信號通路的抗腫瘤藥物治療[J]. 何勤思,鐘軍,鄭智.  實用癌癥雜志. 2016(07)
[4]沙利度胺抗腫瘤機制及其作用靶點CRBN的研究進展[J]. 黃海寧,張浩,汪海.  中國藥理學通報. 2015(06)
[5]基于PubChem數(shù)據(jù)庫的天然產(chǎn)物快速尋靶方法[J]. 劉海波,彭勇,黃璐琦,肖培根.  中草藥. 2012(11)



本文編號：3173472