基于轉(zhuǎn)錄組的三月李及其紅肉突變體Expansin基因家族鑒定及分析
發(fā)布時(shí)間:2021-05-06 08:18
【目的】Expansin是廣泛存在于植物中的一類(lèi)細(xì)胞壁蛋白,通過(guò)調(diào)節(jié)細(xì)胞壁柔韌性在植物生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中發(fā)揮作用。本研究旨在分析Expansin基因家族特征及其在果實(shí)成熟過(guò)程中的表達(dá)模式,并比較Expansin基因在三月李及其紅肉突變體之間的差異表達(dá)!痉椒ā炕谌吕罴捌浼t肉突變體果實(shí)成熟過(guò)程的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),采用生物信息學(xué)分析方法進(jìn)行Expansin家族基因鑒定與分析!窘Y(jié)果】鑒定出33個(gè)李Expansin基因家族成員,編碼蛋白長(zhǎng)度在176~460 aa,分子量在19.21~51.33 kD,等電點(diǎn)4.62~9.83,大部分為位于細(xì)胞外的穩(wěn)定親水蛋白。系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析表明李Expansin家族成員可分為4個(gè)組:22個(gè)EXPA、 6個(gè)EXPB、 1個(gè)EXPLA和4個(gè)EXPLB。所有李Expansin蛋白質(zhì)均具有保守的DPBB1和Pollenallerg1結(jié)構(gòu)域。保守基序分析表明,同一組Expansin成員具有相似的基序組成。9個(gè)Expansin基因在三月李及其紅肉突變體果實(shí)成熟過(guò)程中差異表達(dá)!窘Y(jié)論】Expansin在三月李及其...
【文章來(lái)源】:福建農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2020,35(09)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:10 頁(yè)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于轉(zhuǎn)錄組的‘三月李’及其紅肉突變體ARF基因家族鑒定及分析[J]. 方智振,姜翠翠,周丹蓉,潘少霖,葉新福. 應(yīng)用與環(huán)境生物學(xué)報(bào). 2019(06)
[2]玉米擴(kuò)展蛋白Expansin基因家族定位及基因表達(dá)模式分析[J]. 姜志磊,周琳,武奉慈,宋新元. 生物技術(shù)進(jìn)展. 2018(01)
[3]桃EXPANSIN基因家族序列特征及其在根結(jié)線蟲(chóng)侵染后的誘導(dǎo)表達(dá)分析[J]. 張倩,曹珂,朱更瑞,方偉超,王新衛(wèi),王力榮. 果樹(shù)學(xué)報(bào). 2018(01)
[4]輻射三月李紅肉遲熟突變體的ISSR分析[J]. 方智振,葉新福,周丹蓉,潘少霖,姜翠翠. 核農(nóng)學(xué)報(bào). 2016(02)
[5]黃瓜擴(kuò)展蛋白基因家族的鑒定與生物信息學(xué)分析[J]. 郝西,理向陽(yáng),臘貴曉,代丹丹,楊鐵鋼. 分子植物育種. 2015(10)
[6]水稻擴(kuò)展蛋白家族的生物信息學(xué)分析[J]. 施楊,徐筱,李昊陽(yáng),徐倩,徐吉臣. 遺傳. 2014(08)
[7]柿采后丙烯和1–甲基環(huán)丙烯處理對(duì)兩個(gè)擴(kuò)展蛋白基因表達(dá)的影響[J]. 孫振營(yíng),韓葉,李秀芳,馬秋詩(shī),饒景萍. 園藝學(xué)報(bào). 2014(06)
[8]楊樹(shù)擴(kuò)展蛋白基因家族的生物信息學(xué)分析[J]. 李昊陽(yáng),施楊,丁亞娜,徐吉臣. 北京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2014(02)
本文編號(hào):3171585
【文章來(lái)源】:福建農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2020,35(09)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:10 頁(yè)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于轉(zhuǎn)錄組的‘三月李’及其紅肉突變體ARF基因家族鑒定及分析[J]. 方智振,姜翠翠,周丹蓉,潘少霖,葉新福. 應(yīng)用與環(huán)境生物學(xué)報(bào). 2019(06)
[2]玉米擴(kuò)展蛋白Expansin基因家族定位及基因表達(dá)模式分析[J]. 姜志磊,周琳,武奉慈,宋新元. 生物技術(shù)進(jìn)展. 2018(01)
[3]桃EXPANSIN基因家族序列特征及其在根結(jié)線蟲(chóng)侵染后的誘導(dǎo)表達(dá)分析[J]. 張倩,曹珂,朱更瑞,方偉超,王新衛(wèi),王力榮. 果樹(shù)學(xué)報(bào). 2018(01)
[4]輻射三月李紅肉遲熟突變體的ISSR分析[J]. 方智振,葉新福,周丹蓉,潘少霖,姜翠翠. 核農(nóng)學(xué)報(bào). 2016(02)
[5]黃瓜擴(kuò)展蛋白基因家族的鑒定與生物信息學(xué)分析[J]. 郝西,理向陽(yáng),臘貴曉,代丹丹,楊鐵鋼. 分子植物育種. 2015(10)
[6]水稻擴(kuò)展蛋白家族的生物信息學(xué)分析[J]. 施楊,徐筱,李昊陽(yáng),徐倩,徐吉臣. 遺傳. 2014(08)
[7]柿采后丙烯和1–甲基環(huán)丙烯處理對(duì)兩個(gè)擴(kuò)展蛋白基因表達(dá)的影響[J]. 孫振營(yíng),韓葉,李秀芳,馬秋詩(shī),饒景萍. 園藝學(xué)報(bào). 2014(06)
[8]楊樹(shù)擴(kuò)展蛋白基因家族的生物信息學(xué)分析[J]. 李昊陽(yáng),施楊,丁亞娜,徐吉臣. 北京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2014(02)
本文編號(hào):3171585
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