高粱GRF基因家族鑒定及SbGRF4原核表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-05-05 18:55
為研究高粱生長(zhǎng)調(diào)控因子(growth-regulating factor,GRF)在高粱生長(zhǎng)過(guò)程中的功能,采用生物信息學(xué)分析方法對(duì)高粱GRF基因家族進(jìn)行鑒定,并以高粱BTx623品種為材料,利用PCR技術(shù)擴(kuò)增獲得SbGRF4基因cDNA全長(zhǎng)序列,構(gòu)建pET-28a-SbGRF4重組質(zhì)粒,采用原核表達(dá)技術(shù)分別對(duì)表達(dá)菌株、誘導(dǎo)溫度以及異丙基-β-D-硫代半乳糖苷(isopropyl-β-D-thiogalactopyranoside,IPTG)誘導(dǎo)濃度進(jìn)行優(yōu)化,最后用Western blot技術(shù)對(duì)原核表達(dá)的SbGRF4蛋白進(jìn)行驗(yàn)證。結(jié)果表明,在高粱中共鑒定到10個(gè)GRF基因SbGRF1~SbGRF10;亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)結(jié)果顯示均定位于細(xì)胞核中;分布于高粱的6條染色體上,所有家族成員均含有QLQ和WRC保守結(jié)構(gòu)域;系統(tǒng)進(jìn)化結(jié)果顯示,高粱GRF蛋白分為Class 2、Class 3、Class 4a、Class 4b四個(gè)亞家族;相同亞家族各個(gè)成員間外顯子和內(nèi)含子的數(shù)量差異較小;同一亞家族的高粱GRF蛋白保守基序具有相似性;克隆到的SbGRF4基因c DNA序列全長(zhǎng)為1 221 bp,并成功構(gòu)建p...
【文章來(lái)源】:植物保護(hù)學(xué)報(bào). 2020,47(04)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:10 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
1.2.1 高粱GRF基因家族鑒定及生物信息學(xué)分析
1.2.2 高粱GRF基因家族的系統(tǒng)進(jìn)化分析
1.2.3 高粱SbGRF4基因的克隆及測(cè)序
1.2.4 SbGRF4蛋白的可溶性表達(dá)條件篩選
1.2.5 SbGRF4蛋白的Western blot檢測(cè)
2 結(jié)果與分析
2.1 高粱GRF基因家族鑒定及其生物信息學(xué)分析
2.2 高粱GRF基因家族系統(tǒng)進(jìn)化分析
2.3 高粱SbGRF4基因的克隆
2.4 高粱SbGRF4蛋白的原核表達(dá)條件
2.4.1 SbGRF4表達(dá)菌株的篩選
2.4.2 SbGRF4蛋白表達(dá)的誘導(dǎo)溫度篩選
2.4.3 SbGRF4蛋白表達(dá)的誘導(dǎo)劑IPTG濃度篩選
2.5 SbGRF4蛋白的Western blot檢測(cè)結(jié)果
3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]龍眼GRF家族全基因組鑒定及表達(dá)模式[J]. 劉蒲東,張舒婷,陳曉慧,蘇立遙,姚德恒,李漢生,張梓浩,陳裕坤,林玉玲,賴(lài)鐘雄. 應(yīng)用與環(huán)境生物學(xué)報(bào). 2020(02)
[2]藜麥GRF轉(zhuǎn)錄因子家族的鑒定及表達(dá)分析[J]. 時(shí)丕彪,何冰,費(fèi)月躍,王軍,王偉義,魏福友,呂遠(yuǎn)大,顧閩峰. 作物學(xué)報(bào). 2019(12)
[3]海島棉生長(zhǎng)調(diào)控因子GRF基因家族的全基因組及表達(dá)分析[J]. 趙柯柯,范蓉,劉亞麗,石穎穎,姜夢(mèng)輝,陳全家. 新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2019(03)
[4]茶樹(shù)GRF基因家族的全基因組鑒定及表達(dá)分析[J]. 王鵬杰,鄭玉成,林浥,周珍,楊江帆,葉乃興. 西北植物學(xué)報(bào). 2019(03)
[5]WRKY轉(zhuǎn)錄因子在植物抗病反應(yīng)中的功能研究進(jìn)展[J]. 禹陽(yáng),賈趙東,馬佩勇,郭小丁,謝一芝,邊小峰. 分子植物育種. 2018(21)
[6]毛竹GRF轉(zhuǎn)錄因子家族的全基因組鑒定與分析[J]. 何龍燕,劉武陽(yáng),婁永峰,肖復(fù)明. 植物科學(xué)學(xué)報(bào). 2018(05)
[7]沉默轉(zhuǎn)錄因子OsERF7提高水稻對(duì)褐飛虱和白背飛虱的抗性[J]. 陳夢(mèng)婷,周書(shū)行,張?jiān)掳?楊麗娟,呂靜,婁永根. 植物保護(hù)學(xué)報(bào). 2018(05)
[8]油菜GRF基因家族的鑒定和基本特征分析[J]. 阮先樂(lè),王俊生,劉紅占,趙錦慧. 分子植物育種. 2018(08)
[9]桃GRF基因家族的序列及其組織特異性表達(dá)分析[J]. 曹珂,薛靈姿,王蛟,方偉超,朱更瑞,陳昌文,王新衛(wèi),王力榮. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2018(03)
[10]GRF轉(zhuǎn)錄因子對(duì)植物生長(zhǎng)發(fā)育及脅迫響應(yīng)調(diào)控的分子機(jī)制[J]. 馬超,原佳樂(lè),張?zhí)K,賈琦石,馮雅嵐. 核農(nóng)學(xué)報(bào). 2017(11)
碩士論文
[1]利用原核系統(tǒng)表達(dá)富含二硫鍵蛋白質(zhì)的探索與改進(jìn)[D]. 劉開(kāi)泉.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
本文編號(hào):3170406
【文章來(lái)源】:植物保護(hù)學(xué)報(bào). 2020,47(04)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:10 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
1.2.1 高粱GRF基因家族鑒定及生物信息學(xué)分析
1.2.2 高粱GRF基因家族的系統(tǒng)進(jìn)化分析
1.2.3 高粱SbGRF4基因的克隆及測(cè)序
1.2.4 SbGRF4蛋白的可溶性表達(dá)條件篩選
1.2.5 SbGRF4蛋白的Western blot檢測(cè)
2 結(jié)果與分析
2.1 高粱GRF基因家族鑒定及其生物信息學(xué)分析
2.2 高粱GRF基因家族系統(tǒng)進(jìn)化分析
2.3 高粱SbGRF4基因的克隆
2.4 高粱SbGRF4蛋白的原核表達(dá)條件
2.4.1 SbGRF4表達(dá)菌株的篩選
2.4.2 SbGRF4蛋白表達(dá)的誘導(dǎo)溫度篩選
2.4.3 SbGRF4蛋白表達(dá)的誘導(dǎo)劑IPTG濃度篩選
2.5 SbGRF4蛋白的Western blot檢測(cè)結(jié)果
3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]龍眼GRF家族全基因組鑒定及表達(dá)模式[J]. 劉蒲東,張舒婷,陳曉慧,蘇立遙,姚德恒,李漢生,張梓浩,陳裕坤,林玉玲,賴(lài)鐘雄. 應(yīng)用與環(huán)境生物學(xué)報(bào). 2020(02)
[2]藜麥GRF轉(zhuǎn)錄因子家族的鑒定及表達(dá)分析[J]. 時(shí)丕彪,何冰,費(fèi)月躍,王軍,王偉義,魏福友,呂遠(yuǎn)大,顧閩峰. 作物學(xué)報(bào). 2019(12)
[3]海島棉生長(zhǎng)調(diào)控因子GRF基因家族的全基因組及表達(dá)分析[J]. 趙柯柯,范蓉,劉亞麗,石穎穎,姜夢(mèng)輝,陳全家. 新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2019(03)
[4]茶樹(shù)GRF基因家族的全基因組鑒定及表達(dá)分析[J]. 王鵬杰,鄭玉成,林浥,周珍,楊江帆,葉乃興. 西北植物學(xué)報(bào). 2019(03)
[5]WRKY轉(zhuǎn)錄因子在植物抗病反應(yīng)中的功能研究進(jìn)展[J]. 禹陽(yáng),賈趙東,馬佩勇,郭小丁,謝一芝,邊小峰. 分子植物育種. 2018(21)
[6]毛竹GRF轉(zhuǎn)錄因子家族的全基因組鑒定與分析[J]. 何龍燕,劉武陽(yáng),婁永峰,肖復(fù)明. 植物科學(xué)學(xué)報(bào). 2018(05)
[7]沉默轉(zhuǎn)錄因子OsERF7提高水稻對(duì)褐飛虱和白背飛虱的抗性[J]. 陳夢(mèng)婷,周書(shū)行,張?jiān)掳?楊麗娟,呂靜,婁永根. 植物保護(hù)學(xué)報(bào). 2018(05)
[8]油菜GRF基因家族的鑒定和基本特征分析[J]. 阮先樂(lè),王俊生,劉紅占,趙錦慧. 分子植物育種. 2018(08)
[9]桃GRF基因家族的序列及其組織特異性表達(dá)分析[J]. 曹珂,薛靈姿,王蛟,方偉超,朱更瑞,陳昌文,王新衛(wèi),王力榮. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2018(03)
[10]GRF轉(zhuǎn)錄因子對(duì)植物生長(zhǎng)發(fā)育及脅迫響應(yīng)調(diào)控的分子機(jī)制[J]. 馬超,原佳樂(lè),張?zhí)K,賈琦石,馮雅嵐. 核農(nóng)學(xué)報(bào). 2017(11)
碩士論文
[1]利用原核系統(tǒng)表達(dá)富含二硫鍵蛋白質(zhì)的探索與改進(jìn)[D]. 劉開(kāi)泉.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
本文編號(hào):3170406
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