忽地笑LaSUVH1基因克隆與功能分析
發(fā)布時間:2021-04-24 10:07
為了深入探究忽地笑(Lycoris aurea)組蛋白賴氨酸甲基轉移酶(histone lysine methyltransferase, HKMT)基因的功能,該研究根據(jù)前期轉錄組測序結果,采用RT-PCR方法克隆得到一個組蛋白賴氨酸甲基轉移酶基因LaSUVH1。序列分結果表明,LaSUVH1基因的編碼區(qū)(coding sequences, CDs)序列長2 007 bp,編碼668個氨基酸殘基;LaSUVH1蛋白不具有信號肽結構,無跨膜結構,為親水性蛋白,含有SET、YDG/SRA、Pre-SET和Post-SET結構域;序列比對和系統(tǒng)進化樹分析發(fā)現(xiàn),LaSUVH1與蘆筍AoSUVH1-like蛋白親緣關系最近。實時熒光定量PCR分析表明,LaSUVH1基因在忽地笑不同組織部位均有表達,且在葉中表達量最高。經(jīng)潮霉素篩選成功獲得3個反義過表達LaSUVH1的轉基因擬南芥株系。進一步功能分析發(fā)現(xiàn),反義過表達LaSUVH1促進了擬南芥幼苗側根的發(fā)生,降低了擬南芥對NaCl的耐受性,增加了擬南芥種子萌發(fā)對脫落酸(ABA)的敏感性,表明LaSUVH1基因響應鹽脅迫應答可能依賴ABA信號通路。
【文章來源】:西北植物學報. 2020,40(11)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:9 頁
【文章目錄】:
1 材料和方法
1.1 材料及處理
1.2 方 法
1.2.1 總RNA提取及cDNA第一鏈合成
1.2.2 LaSUVH1基因克隆
1.2.3 LaSUVH1基因的生物信息學分析
1.2.4 實時熒光定量PCR分析
1.2.5 LaSUVH1基因反義過表達載體構建及轉基因擬南芥LaSUVH1轉錄水平與表型分析
1.3 數(shù)據(jù)處理
2 結果與分析
2.1 LaSUVH1基因克隆與序列分析
2.2 LaSUVH1基因編碼蛋白的同源性及進化分析
2.3 LaSUVH1基因的組織表達分布
2.4 反義過表達LaSUVH1轉基因擬南芥表型分析
2.5 反義過表達LaSUVH1基因降低擬南芥對NaCl的抗性并增加擬南芥對ABA的敏感性
3 討 論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]植物組蛋白賴氨酸甲基化建立過程及其遺傳性研究進展[J]. 周偉,王宇,解莉楠. 生物技術通報. 2020(04)
[2]A group of SUVH methyl-DNA binding proteins regulate expression of the DNA demethylase ROS1 in Arabidopsis[J]. Xinlong Xiao,Jieqiong Zhang,Tao Li,Xing Fu,Viswanathan Satheesh,Qingfeng Niu,Zhaobo Lang,Jian-Kang Zhu,Mingguang Lei. Journal of Integrative Plant Biology. 2019(02)
[3]An update on histone lysine methylation in plants[J]. Yu Yu a, Zhongyuan Bu a, Wen-Hui Shen b, Aiwu Dong a,a State Key Laboratory of Genetic Engineering, Institute of Plant Biology, School of Life Sciences, Fudan University, Shanghai 200433, China b Institut de Biologie Moléculaire des Plantes (IBMP), Laboratoire Propre du CNRS (UPR 2357) conventionné avec l’Université LouisPasteur Strasbourg, 67084 Strasbourg Cédex, France. Progress in Natural Science. 2009(04)
本文編號:3157173
【文章來源】:西北植物學報. 2020,40(11)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:9 頁
【文章目錄】:
1 材料和方法
1.1 材料及處理
1.2 方 法
1.2.1 總RNA提取及cDNA第一鏈合成
1.2.2 LaSUVH1基因克隆
1.2.3 LaSUVH1基因的生物信息學分析
1.2.4 實時熒光定量PCR分析
1.2.5 LaSUVH1基因反義過表達載體構建及轉基因擬南芥LaSUVH1轉錄水平與表型分析
1.3 數(shù)據(jù)處理
2 結果與分析
2.1 LaSUVH1基因克隆與序列分析
2.2 LaSUVH1基因編碼蛋白的同源性及進化分析
2.3 LaSUVH1基因的組織表達分布
2.4 反義過表達LaSUVH1轉基因擬南芥表型分析
2.5 反義過表達LaSUVH1基因降低擬南芥對NaCl的抗性并增加擬南芥對ABA的敏感性
3 討 論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]植物組蛋白賴氨酸甲基化建立過程及其遺傳性研究進展[J]. 周偉,王宇,解莉楠. 生物技術通報. 2020(04)
[2]A group of SUVH methyl-DNA binding proteins regulate expression of the DNA demethylase ROS1 in Arabidopsis[J]. Xinlong Xiao,Jieqiong Zhang,Tao Li,Xing Fu,Viswanathan Satheesh,Qingfeng Niu,Zhaobo Lang,Jian-Kang Zhu,Mingguang Lei. Journal of Integrative Plant Biology. 2019(02)
[3]An update on histone lysine methylation in plants[J]. Yu Yu a, Zhongyuan Bu a, Wen-Hui Shen b, Aiwu Dong a,a State Key Laboratory of Genetic Engineering, Institute of Plant Biology, School of Life Sciences, Fudan University, Shanghai 200433, China b Institut de Biologie Moléculaire des Plantes (IBMP), Laboratoire Propre du CNRS (UPR 2357) conventionné avec l’Université LouisPasteur Strasbourg, 67084 Strasbourg Cédex, France. Progress in Natural Science. 2009(04)
本文編號:3157173
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