小麥莖稈發(fā)育調(diào)控基因qd1精細定位與克隆
發(fā)布時間:2021-04-21 00:42
小麥是我國重要的糧食作物,對保障國家糧食安全具有重要意義。本實驗室前期利用7Li離子束誘變冬小麥品種輪選987(WT)獲得一個莖稈階段性快速發(fā)育突變體(quick development mutant,qd),并對其莖稈發(fā)育調(diào)控基因qd1進行了初定位,定位區(qū)間為26.80 Mb~31.88 Mb。本研究利用全基因組重測序技術(shù)開發(fā)分子標記,對小麥莖稈發(fā)育調(diào)控基因qd1進行精細定位和克隆。主要研究結(jié)果如下:1、野生型與突變體株高表型鑒定。從拔節(jié)中后期至孕穗期,突變體光合作用產(chǎn)生的干物質(zhì)在其莖稈中大量積累,加快第二節(jié)和第三節(jié)莖稈節(jié)間細胞的伸長速率,導致此階段突變體莖稈發(fā)育速率快于野生型,在孕穗期階段二者株高達到極顯著性差異,突變體比野生型高10 cm左右。2、小麥莖稈發(fā)育調(diào)控基因qd1的精細定位。利用全基因組重測序技術(shù)在初定位區(qū)間內(nèi)開發(fā)出4481個SNP位點,其中25個位點可以用于遺傳分離群體。通過對F2:3群體2338株重組單株和F2:4群體4123株重組單株進行基因分型,從中篩選出6個重組株系182株重組單株,將小麥莖稈發(fā)育調(diào)控基因qd1精細定...
【文章來源】:中國農(nóng)業(yè)科學院北京市
【文章頁數(shù)】:60 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
主要符號對照表
第一章 緒論
1.1 小麥莖稈發(fā)育調(diào)控基因的研究
1.1.1 小麥矮稈基因的來源與分類
1.1.2 小麥矮稈基因的鑒定
1.1.3 小麥莖稈發(fā)育調(diào)控新基因的開發(fā)
1.2 誘變技術(shù)實現(xiàn)種質(zhì)資源的創(chuàng)新
1.2.1 誘變技術(shù)的創(chuàng)新與發(fā)展
1.2.2 種質(zhì)資源的改良與創(chuàng)新
1.3 小麥基因精細定位
1.3.1 全基因組重測序技術(shù)在精細定位中的應用
1.3.2 QTL定位
1.3.3 作圖群體的分類
1.3.4 遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建
1.3.5 基因精細定位
1.4 基因克隆
1.4.1 目的基因的篩選
1.4.2 基因克隆
1.5 研究目的、意義和技術(shù)路線
1.5.1 研究目的和意義
1.5.2 技術(shù)路線
第二章 小麥快速發(fā)育突變體表型鑒定
2.1 材料與方法
2.1.1 材料種植
2.1.2 實驗儀器及耗材
2.1.3 實驗方法
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 親本材料株高表型鑒定
2.2.2 親本材料表型數(shù)據(jù)分析
2.3 討論
第三章 小麥莖稈發(fā)育調(diào)控基因qd1的精細定位
3.1 材料與方法
3.1.1 材料種植
3.1.2 實驗儀器及耗材
3.1.3 實驗試劑及藥品
3.1.4 實驗藥品配制
3.1.5 實驗方法
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 全基因組重測序數(shù)據(jù)處理
3.2.2 初定位結(jié)果驗證
3.2.3 遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建
3.2.4 小麥莖稈發(fā)育調(diào)控基因qd1的精細定位
3.3 討論
第四章 候選基因Traes CS4B02G042300 克隆
4.1 材料與方法
4.1.1 材料種植
4.1.2 實驗儀器及耗材
4.1.3 實驗試劑及藥品
4.1.4 實驗藥品配制
4.1.5 實驗方法
4.2 結(jié)果與分析
4.2.1 區(qū)間內(nèi)候選基因
4.2.2 候選基因差異表達
4.2.3 候選基因測序
4.2.4 基因結(jié)構(gòu)注釋
4.2.5 基因克隆
4.2.6 基因系統(tǒng)進化樹的構(gòu)建
4.3 討論
第五章 結(jié)論
參考文獻
附錄
致謝
作者簡歷
本文編號:3150714
【文章來源】:中國農(nóng)業(yè)科學院北京市
【文章頁數(shù)】:60 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
主要符號對照表
第一章 緒論
1.1 小麥莖稈發(fā)育調(diào)控基因的研究
1.1.1 小麥矮稈基因的來源與分類
1.1.2 小麥矮稈基因的鑒定
1.1.3 小麥莖稈發(fā)育調(diào)控新基因的開發(fā)
1.2 誘變技術(shù)實現(xiàn)種質(zhì)資源的創(chuàng)新
1.2.1 誘變技術(shù)的創(chuàng)新與發(fā)展
1.2.2 種質(zhì)資源的改良與創(chuàng)新
1.3 小麥基因精細定位
1.3.1 全基因組重測序技術(shù)在精細定位中的應用
1.3.2 QTL定位
1.3.3 作圖群體的分類
1.3.4 遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建
1.3.5 基因精細定位
1.4 基因克隆
1.4.1 目的基因的篩選
1.4.2 基因克隆
1.5 研究目的、意義和技術(shù)路線
1.5.1 研究目的和意義
1.5.2 技術(shù)路線
第二章 小麥快速發(fā)育突變體表型鑒定
2.1 材料與方法
2.1.1 材料種植
2.1.2 實驗儀器及耗材
2.1.3 實驗方法
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 親本材料株高表型鑒定
2.2.2 親本材料表型數(shù)據(jù)分析
2.3 討論
第三章 小麥莖稈發(fā)育調(diào)控基因qd1的精細定位
3.1 材料與方法
3.1.1 材料種植
3.1.2 實驗儀器及耗材
3.1.3 實驗試劑及藥品
3.1.4 實驗藥品配制
3.1.5 實驗方法
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 全基因組重測序數(shù)據(jù)處理
3.2.2 初定位結(jié)果驗證
3.2.3 遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建
3.2.4 小麥莖稈發(fā)育調(diào)控基因qd1的精細定位
3.3 討論
第四章 候選基因Traes CS4B02G042300 克隆
4.1 材料與方法
4.1.1 材料種植
4.1.2 實驗儀器及耗材
4.1.3 實驗試劑及藥品
4.1.4 實驗藥品配制
4.1.5 實驗方法
4.2 結(jié)果與分析
4.2.1 區(qū)間內(nèi)候選基因
4.2.2 候選基因差異表達
4.2.3 候選基因測序
4.2.4 基因結(jié)構(gòu)注釋
4.2.5 基因克隆
4.2.6 基因系統(tǒng)進化樹的構(gòu)建
4.3 討論
第五章 結(jié)論
參考文獻
附錄
致謝
作者簡歷
本文編號:3150714
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