乙醇脫氫酶和乙醛脫氫酶基因家族在胃癌中的臨床應(yīng)用價值及ALDH4A1的機(jī)制探索
發(fā)布時間:2021-04-19 20:11
目的本研究通過利用TCGA數(shù)據(jù)庫和KM plotter數(shù)據(jù)庫進(jìn)行分析ADH/ALDH基因家族,探索ADH/ALDH基因家族在胃癌中診斷和預(yù)后價值。材料和方法從UCSC Xena數(shù)據(jù)庫中下載胃癌TCGA臨床資料,從TCGA數(shù)據(jù)庫下載RNA測序數(shù)據(jù)。使用TCGA數(shù)據(jù)庫胃癌和癌旁邊組織m RNA表達(dá)量進(jìn)行非配對t檢驗,繪制癌與癌旁比較散點圖和ROC曲線圖;利用TCGA隊列中胃癌ADH/ALDH基因m RNA表達(dá)量與臨床生存時間進(jìn)行單因素分析和多因素Cox回歸模型生存分析,臨床病理參數(shù)進(jìn)行分層分析;最后在Kaplan–Meier plotter(KM plotter)數(shù)據(jù)庫中驗證ADH/ALDH基因家族與胃癌預(yù)后關(guān)系。結(jié)果經(jīng)過函數(shù)Log2計算375例胃癌與32例癌旁組織ADH/ALDH基因m RNA表達(dá)量后,獨立樣本t檢驗結(jié)果顯示,胃癌組織ADH1B、ADH1C、ADH4、ADH5、ADH7、ALDH1A1、ALDH1A2、ALDH1L1、ALDH2、ALDH3A1、ADH3B2、ALDH4A1、ALDH6A1、ALDH7A1、ALDH8A1和ALDH9A1基因m RNA表達(dá)量均低于癌旁組織。...
【文章來源】:廣西醫(yī)科大學(xué)廣西壯族自治區(qū)
【文章頁數(shù)】:193 頁
【學(xué)位級別】:博士
【文章目錄】:
個人簡歷
中文摘要
英文摘要
前言
第一部分 乙醇脫氫酶和乙醛脫氫酶基因家族MRNA表達(dá)水平在胃癌組織中的診斷和預(yù)后價值研究
前言
1 材料和方法
2 結(jié)果
3 討論
4 小結(jié)
第二部分ALDH4A1/ALDH5A1 基因免疫組化表達(dá)量在胃癌組織中的診斷和預(yù)后價值研究
前言
1 材料與方法
2 結(jié)果
3 討論
4 小結(jié)
第三部分 基于全基因組數(shù)據(jù)分析ALDH4A1 基因在胃癌組織中的潛在分子機(jī)制研究
前言
1 材料和方法
2 結(jié)果
3 討論
4 小結(jié)
全文總結(jié)
參考文獻(xiàn)
附錄
附表
綜述
參考文獻(xiàn)
致謝
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
本文編號:3148228
【文章來源】:廣西醫(yī)科大學(xué)廣西壯族自治區(qū)
【文章頁數(shù)】:193 頁
【學(xué)位級別】:博士
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個人簡歷
中文摘要
英文摘要
前言
第一部分 乙醇脫氫酶和乙醛脫氫酶基因家族MRNA表達(dá)水平在胃癌組織中的診斷和預(yù)后價值研究
前言
1 材料和方法
2 結(jié)果
3 討論
4 小結(jié)
第二部分ALDH4A1/ALDH5A1 基因免疫組化表達(dá)量在胃癌組織中的診斷和預(yù)后價值研究
前言
1 材料與方法
2 結(jié)果
3 討論
4 小結(jié)
第三部分 基于全基因組數(shù)據(jù)分析ALDH4A1 基因在胃癌組織中的潛在分子機(jī)制研究
前言
1 材料和方法
2 結(jié)果
3 討論
4 小結(jié)
全文總結(jié)
參考文獻(xiàn)
附錄
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綜述
參考文獻(xiàn)
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攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
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