【目的】通過生物信息學(xué)分析明確磷脂酰乙醇胺結(jié)合蛋白（phosphatidyl ethanolamine-binding proteins,PEBP）家族在桃基因組中的分布、結(jié)構(gòu)及進(jìn)化特征,并解析桃PEBP蛋白家族成員PpTFL1基因功能,為后續(xù)利用分子手段調(diào)控桃開花時(shí)間提供理論依據(jù)�！痉椒ā恳詳M南芥6個(gè)PEBP蛋白的氨基酸序列為參考序列,檢索桃基因組中的PEBP基因家族成員,并對其進(jìn)行生物信息學(xué)分析;采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR（qRT-PCR）方法檢測PpTFL1基因在桃不同組織中的表達(dá)量,構(gòu)建PpTFL1過表達(dá)載體轉(zhuǎn)化擬南芥�！窘Y(jié)果】從桃全基因組鑒定出5個(gè)PEBP蛋白家族基因,均由4個(gè)外顯子和3個(gè)內(nèi)含子組成。5個(gè)桃PEBP蛋白中都包含PEBP保守基序和決定FT/TFL1功能的關(guān)鍵氨基酸位點(diǎn);桃PEBP蛋白基因家族可分為TFL1-like、MFT-like和FT-like三個(gè)亞族�？寺～@得PpTFL1基因編碼序列（CDS）,片段大小為519 bp;qRT-PCR結(jié)果表明,PpTFL1在‘中油桃14號’莖尖的表達(dá)量最高;與野生型相比,5個(gè)轉(zhuǎn)PpTFL1的轉(zhuǎn)基因擬南芥陽性株系均表現(xiàn)花期推遲;P... 

【文章來源】：果樹學(xué)報(bào). 2020,37(10)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：12 頁

【部分圖文】：

桃PEBP家族基因結(jié)構(gòu)

分別將2個(gè)單子葉物種（水稻和玉米）和5個(gè)雙子葉物種（擬南芥、蘋果、葡萄、草莓和棉花）中的PEBP基因家族蛋白序列與桃中的5個(gè)PEBP蛋白序列結(jié)合構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，PEBP蛋白基因家族可分為TFL1-like、MFT-like和FT-like三個(gè)亞族，其中Pp TFL1、Pp CEN和Pp BFT同屬于TFL1-like亞族，Pp MFT屬于MFT-like亞族，Pp FT屬于FT-like亞族。在這3個(gè)亞族中，TFL1-like亞族成員最多，MFT-like亞族成員數(shù)量最少。MFT-like和FT-like亞族都分為兩個(gè)簇，分別對應(yīng)于單子葉植物和雙子葉植物；TFL1-like亞族中，同屬于單子葉植物的水稻和玉米聚為一簇，其中Pp TFL1和Pp BFT分別與同屬于薔薇科的蘋果的Md TFL1a/Md TFL1b和MdBFT首先聚類在一起，類似的現(xiàn)象也存在于Pp FT、Pp MFT和Pp CEN中。表明在每個(gè)亞族中，大多數(shù)具有相同植物科的物種傾向于在同一分支中分組（圖3）。2.4 桃PEBP基因家族啟動子元件分析

對桃PEBP蛋白基因家族的啟動子順式作用元件進(jìn)行分析，結(jié)果表明，5個(gè)Pp PEBPs基因啟動子中順式作用元件數(shù)量為15～27;Pp PEBPs基因的順式作用元件中有光信號相關(guān)元件、干旱誘導(dǎo)相關(guān)元件、防御和應(yīng)激相關(guān)元件、低溫反應(yīng)相關(guān)元件和分生組織相關(guān)元件，此外還發(fā)現(xiàn)與生長素、水楊酸、脫落酸和赤霉素相關(guān)的順式作用元件，5個(gè)Pp PEBPs基因啟動子中均包含光信號、水楊酸相關(guān)和赤霉素相關(guān)順式作用元件，且光信號相關(guān)順式作用元件數(shù)量最多（8～19），而與低溫反應(yīng)和生長素相關(guān)順式作用元件最少（表3）�；谏鲜鼋Y(jié)果推測，Pp PEBP蛋白基因家族成員不僅受到光、溫、干旱脅迫等環(huán)境條件的影響，還受到脫落酸、水楊酸和赤霉素等多種激素的影響，從而共同調(diào)控桃開花等相關(guān)過程的生長發(fā)育。2.5 Pp TFL1克隆及過表達(dá)載體構(gòu)建

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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