目的地塞米松（DEX）是經(jīng)典的構(gòu)建動(dòng)物腭裂模型的藥物,但目前尚未有學(xué)者對(duì)其誘導(dǎo)動(dòng)物腭裂發(fā)生中的基因表達(dá)變化進(jìn)行測(cè)序研究,文章試圖利用DEX誘導(dǎo)小鼠腭裂發(fā)生的模型進(jìn)行基因測(cè)序,以構(gòu)建完整的差異表達(dá)基因庫(kù)。方法胚胎第10.5天（E10.5）時(shí)隨機(jī)數(shù)字表法將孕鼠分為DEX組與等滲鹽水組,DEX組按照6 mg/kg的濃度腹腔注射DEX（DEX預(yù)先溶于等滲鹽水中,于E10.5-12.5每天同一時(shí)間連續(xù)注射3 d）,等滲鹽水組則按照同樣劑量和同樣時(shí)間腹腔注射等滲鹽水,于E14.5收集小鼠頜面部中份組織,利用Illumina平臺(tái)對(duì)提取的樣本進(jìn)行測(cè)序,篩選出差異表達(dá)基因（DEGs）并選擇部分基因進(jìn)行qPCR驗(yàn)證,最后利用生物信息學(xué)技術(shù)對(duì)DEGs進(jìn)行GO和KEGG分析,推測(cè)其參與的生物學(xué)功能及信號(hào)通路。結(jié)果樣本中檢測(cè)出的DEGs有796條,其中Dio1、Gm867、Grm5、Kcnk12、Otp等上調(diào)表達(dá)492條,Krt71、Ccer2、Cryba1、Crygf、Gja8等下調(diào)表達(dá)304條,且qPCR驗(yàn)證結(jié)果與測(cè)序結(jié)果一致。生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn)DEGs參與細(xì)胞發(fā)育、細(xì)胞分化、細(xì)胞黏附等多個(gè)生物學(xué)過(guò)程,并富... 

【文章來(lái)源】：醫(yī)學(xué)研究生學(xué)報(bào). 2020,33(10)北大核心

【文章頁(yè)數(shù)】：5 頁(yè)

【部分圖文】：

本組樣本差異表達(dá)基因火山圖

通過(guò)對(duì)篩選出來(lái)的DEGs進(jìn)行GO功能分析,可知DEGs主要涉及多細(xì)胞有機(jī)體發(fā)育、RNA聚合酶Ⅱ啟動(dòng)子的轉(zhuǎn)錄調(diào)控、離子轉(zhuǎn)運(yùn)、細(xì)胞分化和細(xì)胞黏附等生物學(xué)過(guò)程。根據(jù)enrich factor值的大小,按降序排列作圖,取前20個(gè)結(jié)果,見(jiàn)圖2。2.4 差異表達(dá)基因的通路顯著性富集分析

將DEGs以P<0.05為篩選條件進(jìn)行KEGG pathway分析,結(jié)果顯示DEGs可能涉及PI3K-AKT、Wnt及Hedgehog等信號(hào)通路,這與之前的研究結(jié)果相吻合。根據(jù)enrich factor值的大小,按降序排列作圖,取前20個(gè)結(jié)果,見(jiàn)圖3。2.5 q-PCR驗(yàn)證

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
[1]環(huán)境因素（地塞米松、維甲酸和二噁英）誘導(dǎo)腭裂的發(fā)病機(jī)制[D]. 胡曉.南方醫(yī)科大學(xué) 2013



本文編號(hào)：3144990