目的篩選肺腺癌預(yù)后關(guān)鍵基因并進(jìn)行驗(yàn)證,分析其調(diào)控通路。方法從TCGA和GEO數(shù)據(jù)庫(kù)獲取肺腺癌轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),篩選共同差異表達(dá)基因。將LASSO引入到COX回歸模型中,進(jìn)一步篩選預(yù)后關(guān)鍵基因。計(jì)算TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)獲得的500例肺腺癌患者的預(yù)后關(guān)鍵基因相關(guān)風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分,以風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分中位數(shù)作為臨界值將患者分為高風(fēng)險(xiǎn)組和低風(fēng)險(xiǎn)組,比較兩組5年生存率。采用GEPIA數(shù)據(jù)庫(kù)分析癌組織預(yù)后關(guān)鍵基因表達(dá),Kaplan Meier-plotter數(shù)據(jù)庫(kù)分析預(yù)后關(guān)鍵基因表達(dá)與肺腺癌患者預(yù)后的關(guān)系。采用基因集變異分析（GSVA）預(yù)測(cè)肺腺癌預(yù)后關(guān)鍵基因的調(diào)控通路。結(jié)果在TCGA、GEO數(shù)據(jù)庫(kù)共得到166個(gè)共同差異表達(dá)基因,回歸分析篩選出DCN、RRAS、ECT2和PCP4是肺腺癌預(yù)后關(guān)鍵基因。高、低風(fēng)險(xiǎn)組5年生存率分別為29.3%、48.4%,兩組比較P <0.01。肺腺癌組織中DCN、RRAS mRNA表達(dá)均低于正常肺組織,PCP4、ECT2 mRNA表達(dá)均高于正常肺組織（P均<0.05）。RRAS、PCP4、ECT2高表達(dá)者5年生存率明顯低于低表達(dá)者,DCN高表達(dá)者5年生存率明顯高于低表達(dá)患者（P均<... 

【文章來(lái)源】：山東醫(yī)藥. 2020,60(23)

【文章頁(yè)數(shù)】：5 頁(yè)

【部分圖文】：

高風(fēng)險(xiǎn)組和低風(fēng)險(xiǎn)組的生存曲線

該風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分預(yù)測(cè)肺腺癌患者5年生存率的ROC曲線

肺腺癌組織與正常肺組織中預(yù)后關(guān)鍵基因表達(dá)比較


本文編號(hào)：3142396