目的篩選肺腺癌預后關鍵基因并進行驗證,分析其調控通路。方法從TCGA和GEO數據庫獲取肺腺癌轉錄組數據,篩選共同差異表達基因。將LASSO引入到COX回歸模型中,進一步篩選預后關鍵基因。計算TCGA數據庫獲得的500例肺腺癌患者的預后關鍵基因相關風險評分,以風險評分中位數作為臨界值將患者分為高風險組和低風險組,比較兩組5年生存率。采用GEPIA數據庫分析癌組織預后關鍵基因表達,Kaplan Meier-plotter數據庫分析預后關鍵基因表達與肺腺癌患者預后的關系。采用基因集變異分析（GSVA）預測肺腺癌預后關鍵基因的調控通路。結果在TCGA、GEO數據庫共得到166個共同差異表達基因,回歸分析篩選出DCN、RRAS、ECT2和PCP4是肺腺癌預后關鍵基因。高、低風險組5年生存率分別為29.3%、48.4%,兩組比較P <0.01。肺腺癌組織中DCN、RRAS mRNA表達均低于正常肺組織,PCP4、ECT2 mRNA表達均高于正常肺組織（P均<0.05）。RRAS、PCP4、ECT2高表達者5年生存率明顯低于低表達者,DCN高表達者5年生存率明顯高于低表達患者（P均<... 

【文章來源】：山東醫(yī)藥. 2020,60(23)

【文章頁數】：5 頁

【部分圖文】：

高風險組和低風險組的生存曲線

該風險評分預測肺腺癌患者5年生存率的ROC曲線

肺腺癌組織與正常肺組織中預后關鍵基因表達比較


本文編號：3142396