野生大豆較栽培大豆有更廣的遺傳多樣性,在組學(xué)水平整體分析其基因表達(dá)模式對篩選抗旱關(guān)鍵基因、解析干旱脅迫響應(yīng)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)和促進(jìn)分子育種具有重要意義。本研究采用高通量測序技術(shù)對PEG6000模擬干旱脅迫處理第0 h、6 h、12 h、24 h和48 h的30d苗齡野生大豆RNA進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,獲得了1796條糖代謝途徑相關(guān)序列。淀粉和蔗糖代謝途徑通路注釋的差異基因最多,半乳糖代謝途徑次之;在獲得的109個差異表達(dá)基因中,干旱脅迫處理第12 h差異表達(dá)基因最多;對以上109個差異表達(dá)基因構(gòu)建蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò),以節(jié)點度>10為標(biāo)準(zhǔn)篩選中心節(jié)點,共獲得8個關(guān)鍵基因。為進(jìn)一步研究野生大豆干旱脅迫下的糖代謝相關(guān)基因奠定了基礎(chǔ)。 

【文章來源】：中國油料作物學(xué)報. 2020,42(04)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：9 頁

【圖文】：

差異基因表達(dá)模式聚類分析

差異基因蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)分析

圖2 差異基因蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)分析GLYMA20G03250.2和GLYMA08G45210.1的功能注釋均為淀粉磷酸化酶，前者為質(zhì)體形式（Pho-L,Pho1），后者為外質(zhì)體形式（Pho-H,Pho2），兩者在野生大豆體內(nèi)含量很低，均在干旱脅迫處理后快速應(yīng)答，之后隨處理的時間增加其差異表達(dá)量變緩，但GLYMA20G03250.2在處理48 h再次差異高表達(dá)；參與的生物學(xué)過程均包含逆境應(yīng)答和初級代謝過程，GLYMA20G03250.2還參與非生物刺激；GLYMA08G45210.1參與了金屬離子應(yīng)答。淀粉磷酸化酶的早期研究是在豌豆和馬鈴薯中，之后在擬南芥、水稻、玉米等中的功能研究取得了一定的進(jìn)展[28,29]，此外裴金利[30]在對木薯MePho基因家族及其在多種環(huán)境下表達(dá)模式分析中提到，MePho2和MePholc在干旱，鹽脅迫以及外源ABA處理下表達(dá)量顯著升高，說明其在逆境脅迫下木薯淀粉合成中有重要作用。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]基于MSAP技術(shù)的中國野生大豆群體遺傳多樣性分析[J]. 燕雪飛,郭偉,曹瑩,王玉民,袁翠平,趙洪錕,董英山,劉曉冬.  大豆科學(xué). 2020(03)
[2]干旱脅迫下紫花苜蓿幼苗非結(jié)構(gòu)性碳水化合物代謝對NO的響應(yīng)[J]. 馬文靜,魏小紅,宿梅飛,駱巧娟,趙穎.  生態(tài)學(xué)報. 2019(21)
[3]野生大豆轉(zhuǎn)錄因子GsWRKY57基因的克隆與抗旱性功能分析[J]. 王巖巖,張永興,郭葳,代文君,周新安,矯永慶,沈欣杰.  中國油料作物學(xué)報. 2019(04)
[4]基于RNA-Seq技術(shù)的向日葵油酸形成的轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析[J]. 于海峰,韓平安,李美娜,陳阜,郭樹春,李素萍,張艷芳,趙建軍,閆明霞.  中國油料作物學(xué)報. 2018(06)
[5]PEG模擬干旱脅迫下野生大豆轉(zhuǎn)錄組分析[J]. 張小芳,王冰冰,徐燕,張煒坤,趙恢,張鍇,喬亞科,李桂蘭.  大豆科學(xué). 2018(05)
[6]基于轉(zhuǎn)錄組測序的山茱萸轉(zhuǎn)錄因子CobHLH34的克隆與分析[J]. 侯典云,李炯,楊萌萌,張紅曉,胥華偉,趙杏利.  基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2018(08)
[7]干旱脅迫下發(fā)菜蔗糖合成酶基因Sus2克隆與差異表達(dá)[J]. 李曉旭,丁苗苗,劉陽,王猛,嚴(yán)奉坤,梁文裕,徐婷婷,王俊,王玲霞.  分子植物育種. 2018(20)
[8]轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)關(guān)聯(lián)分析在植物研究中的應(yīng)用[J]. 王曉丹,肖鋼,張振乾,肖楠,陳浩,官春云.  基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2018(01)
[9]植物響應(yīng)干旱的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究進(jìn)展[J]. 倪知游,梁東,高帆,胡容平,夏惠.  分子植物育種. 2018(08)
[10]野生大豆耐鹽性研究進(jìn)展[J]. 嚴(yán)勇亮,路子峰,張金波,章艷鳳,叢花.  農(nóng)業(yè)科技與信息. 2017(21)

博士論文
[1]花后高溫和干旱對小麥籽粒淀粉合成、加工品質(zhì)及產(chǎn)量的影響[D]. 王晨陽.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005

碩士論文
[1]基于RNA-Seq分析甜菜堿和棉子糖代謝途徑在小桐子干旱響應(yīng)與適應(yīng)過程中的作用[D]. 王君珂.云南師范大學(xué) 2017
[2]木薯MePho和MeSBE基因家族及其在多種環(huán)境下表達(dá)模式分析[D]. 裴金利.海南大學(xué) 2015
[3]干旱脅迫下木薯葉片蛋白質(zhì)組學(xué)的初步研究[D]. 杜偉.海南大學(xué) 2012
[4]水稻淀粉磷酸化酶基因的表達(dá)及對稻米品質(zhì)影響的研究[D]. 袁亞芳.揚州大學(xué) 2007



本文編號：3141160