野生大豆較栽培大豆有更廣的遺傳多樣性,在組學水平整體分析其基因表達模式對篩選抗旱關鍵基因、解析干旱脅迫響應調控網(wǎng)絡和促進分子育種具有重要意義。本研究采用高通量測序技術對PEG6000模擬干旱脅迫處理第0 h、6 h、12 h、24 h和48 h的30d苗齡野生大豆RNA進行轉錄組測序,獲得了1796條糖代謝途徑相關序列。淀粉和蔗糖代謝途徑通路注釋的差異基因最多,半乳糖代謝途徑次之;在獲得的109個差異表達基因中,干旱脅迫處理第12 h差異表達基因最多;對以上109個差異表達基因構建蛋白質相互作用網(wǎng)絡,以節(jié)點度>10為標準篩選中心節(jié)點,共獲得8個關鍵基因。為進一步研究野生大豆干旱脅迫下的糖代謝相關基因奠定了基礎。 

【文章來源】：中國油料作物學報. 2020,42(04)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：9 頁

【圖文】：

差異基因表達模式聚類分析

差異基因蛋白質相互作用網(wǎng)絡分析

圖2 差異基因蛋白質相互作用網(wǎng)絡分析GLYMA20G03250.2和GLYMA08G45210.1的功能注釋均為淀粉磷酸化酶，前者為質體形式（Pho-L,Pho1），后者為外質體形式（Pho-H,Pho2），兩者在野生大豆體內含量很低，均在干旱脅迫處理后快速應答，之后隨處理的時間增加其差異表達量變緩，但GLYMA20G03250.2在處理48 h再次差異高表達；參與的生物學過程均包含逆境應答和初級代謝過程，GLYMA20G03250.2還參與非生物刺激；GLYMA08G45210.1參與了金屬離子應答。淀粉磷酸化酶的早期研究是在豌豆和馬鈴薯中，之后在擬南芥、水稻、玉米等中的功能研究取得了一定的進展[28,29]，此外裴金利[30]在對木薯MePho基因家族及其在多種環(huán)境下表達模式分析中提到，MePho2和MePholc在干旱，鹽脅迫以及外源ABA處理下表達量顯著升高，說明其在逆境脅迫下木薯淀粉合成中有重要作用。

【參考文獻】：
期刊論文
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博士論文
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碩士論文
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本文編號：3141160