林肯鏈霉菌lmblH和lmbQ基因的功能探究
發(fā)布時間:2021-04-14 23:11
林可霉素是林可酰胺類抗生素的重要成員之一。作為臨床上廣泛使用的一類抗菌素,林可霉素通過抑制細(xì)菌蛋白質(zhì)的合成影響細(xì)菌的生長,因而用于治療各類感染性疾病。雖然通過發(fā)酵工藝的改進(jìn)和菌種的選育可以提高林可霉素的產(chǎn)量,但均具有一定的局限性,而基因工程改造是實(shí)現(xiàn)林可霉素生產(chǎn)能力飛躍的有效策略。林可霉素的生物合成途徑已被初步解析,其調(diào)控機(jī)制也變得逐漸清晰,但負(fù)責(zé)林可霉素生物合成的基因簇(lmb)內(nèi)仍有部分基因功能未知。其中,基因lmbIH和lmbQ生物信息學(xué)預(yù)測其編碼產(chǎn)物屬于PmbA-TldD家族,但作用機(jī)理未知,因此探究lmbIH和lmbQ的功能有望完善林可霉素生物合成與調(diào)控過程,為林可霉素高產(chǎn)菌株的遺傳改造提供操作靶點(diǎn)。為了探究林可霉素簇內(nèi)基因lmbIH和lmbQ的功能,本論文采用CRISPR/Cas介導(dǎo)的鏈霉菌基因組編輯技術(shù),以林肯鏈霉菌(Streptomyces lincolnensis)野生株NRRL2936為出發(fā)菌株,分別構(gòu)建了lmbIH和lmbQ單基因敲除株和雙基因聯(lián)合敲除株。發(fā)酵結(jié)果顯示,lmbIH和/或lmbQ的缺失顯著降低林可霉素的合成,但不影響孢子的形成。同時,為了探測lmbI...
【文章來源】:華東理工大學(xué)上海市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:74 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.2?PPL生物合成途徑??Figure?1.2?PPL?biosynthetic?pathway??MTL的生物合成??與PPL相比,MTL的生物合成途徑更為復(fù)雜,且機(jī)制解析還不夠完善
?事丨丨?-丨丨(丨^)??OH?OH?OH?OH?飛川」?〇H?/)p():??Octosc?8-phosphate?Octosc?1,8-bisphosphatc??/OH??人?H?r?r??^()H?,??.?n?Ho?LmbL,M,S?and?Z?i,n??LmbK?1|()?"?lmbo?^C^°H???_:??,l0?1?^()H??l,H?L,?"°?'?OH?/?^??Octosc?1?-phosphate?GDP-octose??圖1.3?IV1TL生物合成途徑??Figure?1.3?MTL?biosynthetic?pathway??縮合及修飾過程??林可霉素A生物合成的第三步是PPL和MTL的縮合及后續(xù)的修飾過程,??該部分的研宄進(jìn)展稍滯。2013年Lucie等人1361通過體外蛋白表達(dá)及酶活測定等??實(shí)驗(yàn),證明Lmb.l和CcW均可將脫甲基林可霉素(NDL)轉(zhuǎn)化為林可霉素,??而無需任何其他易形成多聚體結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)的幫助,LmW不僅能夠轉(zhuǎn)化NDL,??而且還能夠轉(zhuǎn)化含有四碳和五碳側(cè)鏈的化合物,此外還提出LmbC在林可霉素??生物合成中可特異性激活PPL。2015年Zhao等人1371發(fā)現(xiàn)了兩種低分丫歟的硫醉??-麥角硫醉(EGT)及放線硫氨酸(MSH),在林可霉素A的生物合成中均發(fā)揮??了重要作用。在縮合過程中,獨(dú)立的腺苷酸化域LmbC催化4?-丙基-L-M氨酸的??活化,LmbN轉(zhuǎn)變成全長的載休蛋「1結(jié)構(gòu)域形式|37_3ii|,?LmbT與麥角硫因催化形??成八糖綴合物|371;隨后,該偶聯(lián)物通過酰胺鍵4活化的4_丙基-L-脯氨酸在LmbD??催化的下縮合
ucn..m?II?1?0?1?⑴?SAM?SAH??1,0?,I,AC?(ilc^lns?||〇Ac?丨丨0?U:??h?7??VM?Oil?UH??1?1,0?0,1?"?y?IK)??JH?y?HO?Oil??■以?N?H?1?LmbF?M,C?N?LmWi?H.t?^??|i?°?'?I???*?I?|?〇?S"?SAM?SAM?d?I?〇?W??H〇?k?NH,.Wa,c?丨丨?〇?HO??Lincoinvcin??X?9??圖1.4?MTL及PPL的縮合及修飾途徑??Figure?1.4?MTL?and?PPL?condensation?and?modification?pathways??1.2.3林可霉素生物合成的調(diào)控研宄??經(jīng)過幾十年的研究,林可霉素的合成途徑愈加清晰,但是林可霉素的合成調(diào)??控卻鮮有報道。Hou等人于2018年首次提出LmbU作為一種新型的調(diào)控因子,??正調(diào)控林可霉素的合成。轉(zhuǎn)錄分析及新霉素抗性等實(shí)驗(yàn)證實(shí)LmbU可以激活??/wW/C/J/Pf基因的表達(dá),抑制/w從/t/基因的表達(dá)[17丨。同年,Hou等人提出??tRNA?BldA可以通過翻譯調(diào)節(jié)促進(jìn)林可霉素的產(chǎn)生,揭示了?6/以對林肯鏈霉菌??的形態(tài)分化及林可霉素合成的重要作用[|21。Xu等人I42】首次證實(shí)了?TetR型調(diào)節(jié)??因子SLCG-2919可與林可霉素生物合成基因簇的啟動子區(qū)域特異性結(jié)合,通過??抑制簇內(nèi)基因的轉(zhuǎn)錄進(jìn)而抑制林可霉素的合成。??在林可霉素的生物合成中,全局調(diào)控因子AdpA、BldD和GlnR也發(fā)揮了重??要作用:林肯鏈霉菌中AdpA可以直接與其自身啟動子結(jié)合
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Streptomyces lincolnensis新遺傳操作方法的建立以及l(fā)mbQ基因功能研究[J]. 王增亮,趙群飛,高淑紅,陳長華,劉文. 生物技術(shù)通報. 2010(11)
[2]林可霉素生物合成研究進(jìn)展[J]. 張惠展,張長生,周軍. 國外醫(yī)藥(抗生素分冊). 1998(04)
本文編號:3138186
【文章來源】:華東理工大學(xué)上海市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:74 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.2?PPL生物合成途徑??Figure?1.2?PPL?biosynthetic?pathway??MTL的生物合成??與PPL相比,MTL的生物合成途徑更為復(fù)雜,且機(jī)制解析還不夠完善
?事丨丨?-丨丨(丨^)??OH?OH?OH?OH?飛川」?〇H?/)p():??Octosc?8-phosphate?Octosc?1,8-bisphosphatc??/OH??人?H?r?r??^()H?,??.?n?Ho?LmbL,M,S?and?Z?i,n??LmbK?1|()?"?lmbo?^C^°H???_:??,l0?1?^()H??l,H?L,?"°?'?OH?/?^??Octosc?1?-phosphate?GDP-octose??圖1.3?IV1TL生物合成途徑??Figure?1.3?MTL?biosynthetic?pathway??縮合及修飾過程??林可霉素A生物合成的第三步是PPL和MTL的縮合及后續(xù)的修飾過程,??該部分的研宄進(jìn)展稍滯。2013年Lucie等人1361通過體外蛋白表達(dá)及酶活測定等??實(shí)驗(yàn),證明Lmb.l和CcW均可將脫甲基林可霉素(NDL)轉(zhuǎn)化為林可霉素,??而無需任何其他易形成多聚體結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)的幫助,LmW不僅能夠轉(zhuǎn)化NDL,??而且還能夠轉(zhuǎn)化含有四碳和五碳側(cè)鏈的化合物,此外還提出LmbC在林可霉素??生物合成中可特異性激活PPL。2015年Zhao等人1371發(fā)現(xiàn)了兩種低分丫歟的硫醉??-麥角硫醉(EGT)及放線硫氨酸(MSH),在林可霉素A的生物合成中均發(fā)揮??了重要作用。在縮合過程中,獨(dú)立的腺苷酸化域LmbC催化4?-丙基-L-M氨酸的??活化,LmbN轉(zhuǎn)變成全長的載休蛋「1結(jié)構(gòu)域形式|37_3ii|,?LmbT與麥角硫因催化形??成八糖綴合物|371;隨后,該偶聯(lián)物通過酰胺鍵4活化的4_丙基-L-脯氨酸在LmbD??催化的下縮合
ucn..m?II?1?0?1?⑴?SAM?SAH??1,0?,I,AC?(ilc^lns?||〇Ac?丨丨0?U:??h?7??VM?Oil?UH??1?1,0?0,1?"?y?IK)??JH?y?HO?Oil??■以?N?H?1?LmbF?M,C?N?LmWi?H.t?^??|i?°?'?I???*?I?|?〇?S"?SAM?SAM?d?I?〇?W??H〇?k?NH,.Wa,c?丨丨?〇?HO??Lincoinvcin??X?9??圖1.4?MTL及PPL的縮合及修飾途徑??Figure?1.4?MTL?and?PPL?condensation?and?modification?pathways??1.2.3林可霉素生物合成的調(diào)控研宄??經(jīng)過幾十年的研究,林可霉素的合成途徑愈加清晰,但是林可霉素的合成調(diào)??控卻鮮有報道。Hou等人于2018年首次提出LmbU作為一種新型的調(diào)控因子,??正調(diào)控林可霉素的合成。轉(zhuǎn)錄分析及新霉素抗性等實(shí)驗(yàn)證實(shí)LmbU可以激活??/wW/C/J/Pf基因的表達(dá),抑制/w從/t/基因的表達(dá)[17丨。同年,Hou等人提出??tRNA?BldA可以通過翻譯調(diào)節(jié)促進(jìn)林可霉素的產(chǎn)生,揭示了?6/以對林肯鏈霉菌??的形態(tài)分化及林可霉素合成的重要作用[|21。Xu等人I42】首次證實(shí)了?TetR型調(diào)節(jié)??因子SLCG-2919可與林可霉素生物合成基因簇的啟動子區(qū)域特異性結(jié)合,通過??抑制簇內(nèi)基因的轉(zhuǎn)錄進(jìn)而抑制林可霉素的合成。??在林可霉素的生物合成中,全局調(diào)控因子AdpA、BldD和GlnR也發(fā)揮了重??要作用:林肯鏈霉菌中AdpA可以直接與其自身啟動子結(jié)合
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Streptomyces lincolnensis新遺傳操作方法的建立以及l(fā)mbQ基因功能研究[J]. 王增亮,趙群飛,高淑紅,陳長華,劉文. 生物技術(shù)通報. 2010(11)
[2]林可霉素生物合成研究進(jìn)展[J]. 張惠展,張長生,周軍. 國外醫(yī)藥(抗生素分冊). 1998(04)
本文編號:3138186
本文鏈接:http://sikaile.net/kejilunwen/jiyingongcheng/3138186.html
最近更新
教材專著