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基于多維組學(xué)數(shù)據(jù)分析挖掘并驗證擬南芥PHO1;H10基因功能

發(fā)布時間:2021-04-12 02:48
  PHO1基因家族包含11個成員,分別被命名為PHO1及PHO1;H1-H10,它們的蛋白質(zhì)序列中均含有SPX和EXS兩個功能結(jié)構(gòu)域。Ribot等人研究發(fā)現(xiàn),擬南芥PHO1;H10基因受多種生物和非生物逆境脅迫調(diào)控,包括機(jī)械損傷、干旱、冷害、高鹽、病原菌侵染等,另外,該基因也受脫落酸(ABA)和茉莉酸(JA)前體物質(zhì)12-氧-植物二烯酸(OPDA)誘導(dǎo)表達(dá)。許多擬南芥轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)表明,PHO1;H10基因可能參與到逆境脅迫及植物激素代謝和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)過程中,如水分脅迫(如滲透、干旱和鹽脅迫等)、紫外線脅迫等逆境脅迫、ABA和水楊酸(SA)的信號通路等。但是,關(guān)于PHO1:H10基因表達(dá)的分子調(diào)控機(jī)制的進(jìn)一步探索和對其功能的具體實驗驗證目前還少見報道。為此,本研究運用生物信息學(xué)平臺和分析手段進(jìn)行多種組學(xué)的數(shù)據(jù)挖掘,對PHO1;H10的表達(dá)調(diào)控機(jī)制和基因功能進(jìn)行了探索和預(yù)測,并通過分子生物學(xué)和遺傳學(xué)等方法對PHO1;H10基因的可能功能進(jìn)行了初步實驗驗證。首先,通過在擬南芥順式作用元件平臺上進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),PHO1;H10基因的啟動子區(qū)域包含許多與ABA響應(yīng)相關(guān)的ABRE類的順式作用元件、干旱響應(yīng)相... 

【文章來源】:中國農(nóng)業(yè)大學(xué)北京市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:89 頁

【學(xué)位級別】:博士

【部分圖文】:

基于多維組學(xué)數(shù)據(jù)分析挖掘并驗證擬南芥PHO1;H10基因功能


圖1-3擬南芥受激素ABA和多種脅迫誘導(dǎo)表達(dá)(Ribotetal.2008b)??(A)

示意圖,示意圖,誘導(dǎo)合成,滲透脅迫


國農(nóng)業(yè)大學(xué)博士學(xué)位論文?第一章文獻(xiàn)的抗逆性(Leung?and?Giraudat,1998;?Finkelstein?et?al.,2002;?Zhu,?2002;?Fujii?and?Zhu,2009)。??干旱、冷等環(huán)境脅迫均會引起滲透脅迫,而滲透脅迫會導(dǎo)致植物體內(nèi)各器官脫水,影響正水分吸收。當(dāng)植物各組織出現(xiàn)脫水時,細(xì)胞中己存在的ABA首先會啟動下游信號轉(zhuǎn)導(dǎo)過導(dǎo)植物氣孔關(guān)閉降低蒸騰作用(Caspar?etal.,?2014);同時新的ABA?xí)徽T導(dǎo)合成并積累,進(jìn)動一系列的脅迫響應(yīng),通過下游信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路調(diào)節(jié)更多基因的表達(dá),最終誘導(dǎo)保衛(wèi)細(xì)胞氣,同時增加一些滲透調(diào)控物質(zhì)基因的表達(dá),以及Late?Embryogenesis?Abundant?(LEA)類髙蛋白的表達(dá),防止細(xì)胞及其中的大分子物質(zhì)脫水(Finkelstein?et?al.,2002;?Nakashima?aamaguchi-Shinozaki,2013)。而當(dāng)植株恢復(fù)水分吸收解除脫水狀態(tài)后,ABA的含量又會下ryadeep?et?al.,2013)。??此外,在種子成熟過程中也會積累一定量的ABA,這部分ABA可以調(diào)控合成一些種子蛋白種子發(fā)育和萌發(fā)過程中起作用。ABA可以誘導(dǎo)合成LEA類蛋白,增強(qiáng)成熟種子的耐脫水性,時抑制成熟種子萌發(fā)促進(jìn)其進(jìn)入休眠(Nakashima?and?Yamaguchi-Shinozaki,?2013)。?????

萌發(fā)狀態(tài),休眠狀態(tài),激素,種子


和?SUVH5、以及?LDL1?和?LDL2?表觀調(diào)控因子的調(diào)控(Zheng?et?al.,?2012;?Zhao?et?al_,?2015)。??如上所述,植物種子的休眠過程是由ABA、生長素和GA等多種植物激素調(diào)控ABI3、ABM??等轉(zhuǎn)錄因子的作用,并結(jié)合表觀調(diào)控因子調(diào)控基因表達(dá)的結(jié)果(圖1-6)。當(dāng)外界環(huán)境發(fā)生改變,??ABA、生長素、GA的合成和信號通路會發(fā)生改變,種子的休眠狀態(tài)進(jìn)而會被打破而進(jìn)入非休眠??狀態(tài),此時種子會經(jīng)過一系列生理生化變化進(jìn)入萌發(fā)狀態(tài)。種子的萌發(fā)過程是由包括油菜素內(nèi)酯??(BRSbrassinosteroids)、細(xì)胞分裂素(CTKscytokinins)、茉莉酸(JAjasmonicacid)在內(nèi)的多種植??物激素通過調(diào)節(jié)ABA和GA的合成和信號通路水平的變化,改變ABA/GA的平衡而實現(xiàn)的(Shu??etal.,2016)。轉(zhuǎn)錄因子ABI3、ABI4等與其下游的CTP70Z47、CZP7(?Z^基因、GA信號通路的??負(fù)調(diào)節(jié)子DELLAs蛋白、以及其上游的ARFs、MYB96和表觀調(diào)節(jié)子均參與其中(Lee?et?al.,2002;??Shu?et?al.,2016)。??\\j?/?y?i?&??\\^</\??伊??\/?\AP2?\?i?/?/?\?BIN2??暴(Y7^?at/T6?7KS5??J?ABI4?\J/?DELLAS??ARF10/16?|?/?AB'3?_^ABI5?丨??/?\cYP707A1/2?\?/????i?^?r?1?I?

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Regulation of OsSPX1 and OsSPX3 on Expression of OsSPX Domain Genes and Pi-starvation Signaling in Rice[J]. Zhiye Wang,Han Hu,Hongjie Huang,Ke Duan,Zhongchang Wu and Ping Wu(State Key Laboratory of Plant Physiology and Biochemistry,College of Life Sciences,Zhejiang University,Hangzhou 310058,China).  Journal of Integrative Plant Biology. 2009(07)

博士論文
[1]擬南芥WRKY6和PHO1參與ABA調(diào)控種子萌發(fā)和早期幼苗生長過程的分子機(jī)制[D]. 黃蕓.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]微管生長驅(qū)動的囊泡運輸參與擬南芥氣孔運動的機(jī)制研究[D]. 王書偉.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015



本文編號:3132461

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