谷胱甘肽-抗壞血酸（ascorbate-glutathione, AsA-GSH）途徑在植物抗氧化過程中具有重要作用。本研究基于忍冬轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),利用生物信息學(xué)的方法對AsA-GSH途徑中的LAPX、RRM、G6PD、NRT和PGD調(diào)控基因進(jìn)行相關(guān)分析。結(jié)果表明:LjLAPX、LjG6PD和LjNRT為不穩(wěn)定的疏水蛋白, LjRRM和LjPGD為穩(wěn)定的疏水蛋白。二級結(jié)構(gòu)均為混合型結(jié)構(gòu),α-螺旋作為多肽鏈中的大量結(jié)構(gòu)元件分布于整個多肽鏈中。利用同源建模法分析了蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)�？缒そY(jié)構(gòu)預(yù)測顯示LjRRM、LjG6PD和LjPGD無跨膜區(qū), LjLAPX和LjNRT分別有2個和11個跨膜區(qū)域。KEGG分析了AsA-GSH途徑的代謝調(diào)控網(wǎng)絡(luò)�；虮磉_(dá)分析發(fā)現(xiàn),整個低溫過程中LjLAPX、LjRRM、LjG6PD、LjNRT和LjPGD基因均差異表達(dá),共同調(diào)控GSH和AsA的水平,提高植物的抗性。RT-qPCR試驗進(jìn)一步證明了轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的可靠性。 

【文章來源】：植物生理學(xué)報. 2020,56(11)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：8 頁

【部分圖文】：

蛋白質(zhì)的預(yù)測二級結(jié)構(gòu)

跨膜結(jié)構(gòu)域(trans-membrane domain,TMD)是由跨膜蛋白的效應(yīng)區(qū)域所展現(xiàn),其跨膜部分為β-轉(zhuǎn)角或α-螺旋。對5個蛋白進(jìn)行跨膜結(jié)構(gòu)預(yù)測分析,結(jié)果表明,Lj RRM、Lj G6PD和Lj PGD無跨膜區(qū),Lj LAPX和Lj NRT分別有2個和11個跨膜區(qū)域。由此可以推測Lj LAPX和Lj NRT在胞質(zhì)中需要經(jīng)過跨膜轉(zhuǎn)運(yùn),才能催化下一步反應(yīng)。圖3 蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)域分析

蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)域分析

【參考文獻(xiàn)】：
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碩士論文
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本文編號：3122173