基于二代測序技術(shù)檢測肺肉瘤樣癌患者的基因突變與腫瘤突變負(fù)荷的研究
發(fā)布時間:2021-04-06 05:05
目的:探求肺肉瘤樣癌(Pulmonary Sarcomatoid Carcinomas,PSC)可能的靶向基因,為尋找有效的靶向藥物提供線索。研究PSC的腫瘤突變負(fù)荷(Tumor Mutation Burden,TMB)變化水平,為免疫檢查點抑制劑治療提供可行的依據(jù)。材料與方法:我們利用二代測序技術(shù)(Next Generation Sequencing,NGS)檢測32例PSC組織標(biāo)本中416種癌癥相關(guān)基因和腫瘤突變負(fù)荷。結(jié)果:我們共發(fā)現(xiàn)216種癌癥相關(guān)基因共有516種突變類型。其中較為常見的突變基因為TP53(69%),EGFR(28%),RB1(25%),KRAS(22%),ARID1A(22%),KMT2B(22%),RET(22%)。PSC患者EGFR突變中敏感突變占25%,罕見突變?yōu)?5%。PSC患者M(jìn)ET陽性率為16%。其中外顯子14跳躍突變率為60%。TMB范圍是7到45個突變/Mb,TMB中位數(shù)為15個突變/Mb。當(dāng)BRCA2、SMARCA4突變時,TMB顯著升高。多因素回歸分析認(rèn)為腫瘤分期是影響PSC患者預(yù)后的獨(dú)立因素。KRAS陽性的III-Ⅳ期PSC患者,OS時間較...
【文章來源】:蘇州大學(xué)江蘇省
【文章頁數(shù)】:46 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
例PSC患者所有的突變情況
圖 2 32 例 PSC 患者突變頻率較高的基因 (A-B) ;每個 PSC 患者 TMB 數(shù)目 (C)其中 EGFR、KRAS 和 MET 突變頻率最高的三種分子驅(qū)動基因 (圖 2.A)。具體突變情況可見附錄。我們在 9 例 PSC 患者,共發(fā)現(xiàn) 11 個 EGFR 點突變,1 個 EGFR外顯子 19 缺失。11 個點突變,其中 1 個位于外顯子 12(G485S)、1 個位于外顯子13(G544D)、1 個位于外顯子 18(G724S)、2 個位于外顯子 19(A750P、K757R)、1 個位于外顯子 20(T790M)、4 個位于外顯子 21(V845M、L858R、L858R、L861Q)、1 個位于外顯子 25(D1014G)。其中 4 例位于外顯子 21 的點突變中僅有 2 例為 L858R突變。有 1 例 PSC 患者同時存在 L858R 和 T790M 突變。EGFR-TKI 敏感突變占 25%。EGFR 罕見突變?yōu)?75%。7 例患者(22%)檢測出 KRAS 錯義突變,且均為激活突變,包括 6 例為外顯2( G12C/V 突變),1 例為外顯子 3 (Q61K 突變)。5 例患者(16%)出現(xiàn) MET 突變。包括 3 例外顯子 14 (D1028N),1 例內(nèi)含子 13(c.2942-28_2942-13 缺失突變),另外 1 例外顯子 12 H904N 是一種首次發(fā)現(xiàn)的突變類
圖 3.TMB 和不同基因突變的關(guān)系析訪結(jié)束,共有 11 例患者存活,其中 1 例 T2aN0M0 PSCs 患者無進(jìn)展生存期長達(dá) 10.6 個月。32 例患者生存時間為 1.5 個月至為 7.9 個月,1 年生存率達(dá)到 50%。 例 PSC 患者的生存進(jìn)行多因素 Cox 回歸分析,對總生存期的多
本文編號:3120818
【文章來源】:蘇州大學(xué)江蘇省
【文章頁數(shù)】:46 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
例PSC患者所有的突變情況
圖 2 32 例 PSC 患者突變頻率較高的基因 (A-B) ;每個 PSC 患者 TMB 數(shù)目 (C)其中 EGFR、KRAS 和 MET 突變頻率最高的三種分子驅(qū)動基因 (圖 2.A)。具體突變情況可見附錄。我們在 9 例 PSC 患者,共發(fā)現(xiàn) 11 個 EGFR 點突變,1 個 EGFR外顯子 19 缺失。11 個點突變,其中 1 個位于外顯子 12(G485S)、1 個位于外顯子13(G544D)、1 個位于外顯子 18(G724S)、2 個位于外顯子 19(A750P、K757R)、1 個位于外顯子 20(T790M)、4 個位于外顯子 21(V845M、L858R、L858R、L861Q)、1 個位于外顯子 25(D1014G)。其中 4 例位于外顯子 21 的點突變中僅有 2 例為 L858R突變。有 1 例 PSC 患者同時存在 L858R 和 T790M 突變。EGFR-TKI 敏感突變占 25%。EGFR 罕見突變?yōu)?75%。7 例患者(22%)檢測出 KRAS 錯義突變,且均為激活突變,包括 6 例為外顯2( G12C/V 突變),1 例為外顯子 3 (Q61K 突變)。5 例患者(16%)出現(xiàn) MET 突變。包括 3 例外顯子 14 (D1028N),1 例內(nèi)含子 13(c.2942-28_2942-13 缺失突變),另外 1 例外顯子 12 H904N 是一種首次發(fā)現(xiàn)的突變類
圖 3.TMB 和不同基因突變的關(guān)系析訪結(jié)束,共有 11 例患者存活,其中 1 例 T2aN0M0 PSCs 患者無進(jìn)展生存期長達(dá) 10.6 個月。32 例患者生存時間為 1.5 個月至為 7.9 個月,1 年生存率達(dá)到 50%。 例 PSC 患者的生存進(jìn)行多因素 Cox 回歸分析,對總生存期的多
本文編號:3120818
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