多胺廣泛參與植物生長(zhǎng)、發(fā)育等生理生化進(jìn)程和植物逆境應(yīng)答反應(yīng),精氨酸脫羧酶（ADC）是植物多胺生物合成途徑中的關(guān)鍵酶.為研究桃樹ADC基因的結(jié)構(gòu)和逆境脅迫轉(zhuǎn)錄表達(dá)情況,試驗(yàn)利用同源序列法克隆桃樹PpADC基因,對(duì)基因序列、編碼蛋白結(jié)構(gòu)等進(jìn)行生物信息學(xué)分析,應(yīng)用qRT-PCR檢測(cè)基因PpADC在不同逆境脅迫過程中的轉(zhuǎn)錄表達(dá)量.結(jié)果表明,桃樹PpADC基因含有一個(gè)2 178 bp的開放閱讀框,編碼725個(gè)氨基酸,基因序列中不含有內(nèi)含子結(jié)構(gòu);該基因編碼蛋白與白梨精氨酸脫羧酶相似值高達(dá)90.14%,系統(tǒng)進(jìn)化樹分析表明PpADC基因與白梨、蘋果和湖北海棠等薔薇科果樹ADC基因親緣關(guān)系較近;低溫、脫水、鹽和乙烯處理能不同程度上調(diào)PpADC基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá)水平,表明該基因在桃樹應(yīng)答逆境脅迫過程中發(fā)揮重要作用. 

【文章來(lái)源】：西南師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2020,45(07)北大核心

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【部分圖文】：

桃樹PpADC基因編碼蛋白質(zhì)的功能結(jié)構(gòu)域

桃樹PpADC基因編碼蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)

圖3 桃樹PpADC基因編碼蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)利用NCBI數(shù)據(jù)庫(kù), 將PpADC基因編碼的氨基酸序列與其他物種ADC基因編碼氨基酸進(jìn)行比對(duì), 發(fā)現(xiàn)它們具有較高的相似性, 其中與白梨PbADC基因編碼氨基酸相似值為90.14%, 與蘋果MdADC基因編碼氨基酸的相似值為89.84%, 與湖北海棠MhADC基因編碼氨基酸相似值為89.56%, 與葡萄VvADC基因編碼氨基酸的相似值為78.55%, 與杧果MiADC基因編碼氨基酸的相似值為74.49%, 與枳PtADC基因編碼氨基酸的相似值為73.58%, 與擬南芥AtADC1和AtADC2基因編碼氨基酸的相似值分別為74.28%和72.12%(圖5).


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