皮膚黑色素瘤放療耐藥基因的篩選及初步鑒定
發(fā)布時(shí)間:2021-03-29 16:36
目的篩選出皮膚惡性黑色素瘤放療敏感性基因,并在生物信息學(xué)和細(xì)胞水平驗(yàn)證篩選出的候選基因?qū)ζつw惡性黑色素瘤發(fā)生、發(fā)展的作用。方法通過全轉(zhuǎn)錄組測序及表達(dá)譜分析比較野生型人皮膚黑色素瘤細(xì)胞SK-MEL-1與輻射耐受型SK-MEL-1的差異基因,以表達(dá)量差異最大的基因作為候選基因。TCGA數(shù)據(jù)庫挖掘該候選基因在皮膚惡性黑色素瘤中的表達(dá)特征及其對(duì)預(yù)后的影響。進(jìn)一步通過構(gòu)建該基因的敲低、過表達(dá)SK-MEL-1細(xì)胞株,比較敲低、過表達(dá)該基因的細(xì)胞對(duì)SK-MEL-1細(xì)胞增殖、輻射敏感性的影響。結(jié)果通過比較野生型SK-MEL-1與輻射耐受型SK-MEL-1的表達(dá)譜,篩選出CDCA8基因?yàn)椴町惐磉_(dá)量最大的基因。該基因在輻射耐受型SK-MEL-1中表達(dá)上調(diào);赥CGA數(shù)據(jù)庫的生物信息學(xué)分析提示,該基因在皮膚惡性黑色素瘤中高表達(dá),且表達(dá)量與臨床分期相關(guān),臨床分期高的樣本表達(dá)量高于低臨床分期的樣本。此外,高表達(dá)組的總生存率和無病生存率均低于低表達(dá)組。細(xì)胞學(xué)水平實(shí)驗(yàn)證明,敲低CDCA8基因能明顯抑制SK-MEL-1的增殖和提高SK-MEL-1對(duì)輻射的敏感性;相反,過表達(dá)CDCA8基因能促進(jìn)SK-MEL-1的增殖...
【文章來源】:西南國防醫(yī)藥. 2020,30(09)
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
SK-MEL-1細(xì)胞與RR-SK-MEL-1細(xì)胞差異表達(dá)火山
為進(jìn)一步驗(yàn)證上述篩選出的CDCA8基因?qū)ζつw黑色素瘤的影響。本研究通過構(gòu)建CDCA8敲低、過表達(dá)SK-MEL-1細(xì)胞株,進(jìn)一步探究CDCA8表達(dá)對(duì)SK-MEL-1細(xì)胞株生物學(xué)功能的影響。Western blot試驗(yàn)檢測WT-SK-MEL-1、KD-SK-MEL-1和OE-SK-MEL-1細(xì)胞的CDCA8蛋白表達(dá)水平。結(jié)果見圖3A,與WT-SK-MEL-1對(duì)比,KD-SK-MEL-1組的CDCA8蛋白表達(dá)量明顯降低,而OE-SK-MEL-1組的CDCA8蛋白表達(dá)量則明顯上升。以GAPDH蛋白為對(duì)照,對(duì)3次獨(dú)立試驗(yàn)的結(jié)果做半定量分析。KD-SK-MEL-1組(0.12±0.01)和OE-SK-MEL-1組(8.43±0.90)與WT-SK-MEL-1組(1.23±0.32)間CDCA8蛋白表達(dá)量差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.01)。結(jié)果提示,CDCA8敲低、過表達(dá)的SK-MEL-1細(xì)胞系構(gòu)建成功。圖3 CDCA8敲低、過表達(dá)SK-MEL-1細(xì)胞株CDCA8蛋白表達(dá)量檢測
CDCA8敲低、過表達(dá)SK-MEL-1細(xì)胞株CDCA8蛋白表達(dá)量檢測
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]皮膚黑色素瘤流行病學(xué)及防治研究進(jìn)展[J]. 林千里,張文俊,汪匯,江華. 中國醫(yī)藥導(dǎo)報(bào). 2019(03)
[2]蓬亂蛋白2干擾和過表達(dá)慢病毒載體的構(gòu)建及其在hUVECs中的表達(dá)[J]. 生欣,王俊華,劉月華,郜雙林,謝夏丹,范芳. 中國現(xiàn)代醫(yī)學(xué)雜志. 2019(01)
[3]泛素羧基末端水解酶L5對(duì)乳腺癌細(xì)胞增殖和凋亡的影響[J]. 丁芳,馬建林,吳曉巍,劉芝華. 中華腫瘤雜志. 2018 (12)
[4]黑色素瘤治療新進(jìn)展[J]. 戰(zhàn)雪林,張瑜娟,閔衛(wèi)平. 南昌大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2018(05)
[5]進(jìn)展期皮膚惡性黑色素瘤治療現(xiàn)狀[J]. 金谷,李濤. 現(xiàn)代醫(yī)藥衛(wèi)生. 2018(04)
[6]輻射誘導(dǎo)輻射耐受鱗癌細(xì)胞株的建立及其生物學(xué)特性[J]. 駱志國,周福祥,周云峰,代靜,謝叢華,劉詩權(quán). 中華放射腫瘤學(xué)雜志. 2005(03)
本文編號(hào):3107841
【文章來源】:西南國防醫(yī)藥. 2020,30(09)
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
SK-MEL-1細(xì)胞與RR-SK-MEL-1細(xì)胞差異表達(dá)火山
為進(jìn)一步驗(yàn)證上述篩選出的CDCA8基因?qū)ζつw黑色素瘤的影響。本研究通過構(gòu)建CDCA8敲低、過表達(dá)SK-MEL-1細(xì)胞株,進(jìn)一步探究CDCA8表達(dá)對(duì)SK-MEL-1細(xì)胞株生物學(xué)功能的影響。Western blot試驗(yàn)檢測WT-SK-MEL-1、KD-SK-MEL-1和OE-SK-MEL-1細(xì)胞的CDCA8蛋白表達(dá)水平。結(jié)果見圖3A,與WT-SK-MEL-1對(duì)比,KD-SK-MEL-1組的CDCA8蛋白表達(dá)量明顯降低,而OE-SK-MEL-1組的CDCA8蛋白表達(dá)量則明顯上升。以GAPDH蛋白為對(duì)照,對(duì)3次獨(dú)立試驗(yàn)的結(jié)果做半定量分析。KD-SK-MEL-1組(0.12±0.01)和OE-SK-MEL-1組(8.43±0.90)與WT-SK-MEL-1組(1.23±0.32)間CDCA8蛋白表達(dá)量差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.01)。結(jié)果提示,CDCA8敲低、過表達(dá)的SK-MEL-1細(xì)胞系構(gòu)建成功。圖3 CDCA8敲低、過表達(dá)SK-MEL-1細(xì)胞株CDCA8蛋白表達(dá)量檢測
CDCA8敲低、過表達(dá)SK-MEL-1細(xì)胞株CDCA8蛋白表達(dá)量檢測
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]皮膚黑色素瘤流行病學(xué)及防治研究進(jìn)展[J]. 林千里,張文俊,汪匯,江華. 中國醫(yī)藥導(dǎo)報(bào). 2019(03)
[2]蓬亂蛋白2干擾和過表達(dá)慢病毒載體的構(gòu)建及其在hUVECs中的表達(dá)[J]. 生欣,王俊華,劉月華,郜雙林,謝夏丹,范芳. 中國現(xiàn)代醫(yī)學(xué)雜志. 2019(01)
[3]泛素羧基末端水解酶L5對(duì)乳腺癌細(xì)胞增殖和凋亡的影響[J]. 丁芳,馬建林,吳曉巍,劉芝華. 中華腫瘤雜志. 2018 (12)
[4]黑色素瘤治療新進(jìn)展[J]. 戰(zhàn)雪林,張瑜娟,閔衛(wèi)平. 南昌大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2018(05)
[5]進(jìn)展期皮膚惡性黑色素瘤治療現(xiàn)狀[J]. 金谷,李濤. 現(xiàn)代醫(yī)藥衛(wèi)生. 2018(04)
[6]輻射誘導(dǎo)輻射耐受鱗癌細(xì)胞株的建立及其生物學(xué)特性[J]. 駱志國,周福祥,周云峰,代靜,謝叢華,劉詩權(quán). 中華放射腫瘤學(xué)雜志. 2005(03)
本文編號(hào):3107841
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