淀粉酶（BAM）介導(dǎo)的淀粉降解廣泛參與植物生長(zhǎng)發(fā)育和非生物脅迫響應(yīng)等生物學(xué)過程。從前期蘋果低溫誘導(dǎo)轉(zhuǎn)錄組研究中分離到1個(gè)參與淀粉代謝的差異表達(dá)基因片段,克隆其cDNA全長(zhǎng)并進(jìn)行序列分析。結(jié)果表明該基因與擬南芥AtBAM3同源,命名為MdBAM3 （GenBank登錄號(hào):KX276144.1）。該基因開放閱讀框長(zhǎng)度1 641 bp,編碼546個(gè)氨基酸。該蛋白含有完整的葡萄糖基水解酶結(jié)構(gòu)域,保守的葡萄糖基水解酶結(jié)構(gòu)域外環(huán)和內(nèi)環(huán)結(jié)構(gòu),以及2個(gè)谷氨酸催化殘基,該蛋白包含40個(gè)氨基酸殘基的cTP （Chloroplast transport peptides）,表明MdBAM3蛋白是定位于葉綠體的β-淀粉酶。利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)分析模擬低溫（4℃）和自然低溫條件下MdBAM3的表達(dá)響應(yīng)及組織表達(dá)模式,該基因受4℃模擬低溫誘導(dǎo)快速表達(dá);自然低溫下該基因在葉芽、花芽、韌皮部中的表達(dá)均顯著上調(diào),在葉芽中表達(dá)量最高,具有組織特異性,且隨植株休眠的進(jìn)行呈先升后降的趨勢(shì),推測(cè)MdBAM3在蘋果低溫脅迫響應(yīng)中具有重要功能。 

【文章來源】：分子植物育種. 2020,18(13)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：8 頁(yè)

【部分圖文】：

MdBAM3編碼區(qū)PCR產(chǎn)物的電泳分析

圖1 MdBAM3編碼區(qū)PCR產(chǎn)物的電泳分析ProtParam軟件分析表明，MdBAM3蛋白分子式為C2695H4187N767O803S32，分子量61.21 kD，其等電點(diǎn)8.34，不穩(wěn)定系數(shù)36.93，為穩(wěn)定蛋白，親水性平均數(shù)-0.473，表明該蛋白為親水性蛋白。利用ProtScale軟件分析也表明，MdBAM3肽鏈沒有典型的疏水性區(qū)域，推測(cè)該蛋白為親水性蛋白，與ProtParam預(yù)測(cè)結(jié)果一致。利用TargetP 1.1軟件對(duì)MdBAM3進(jìn)行亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)，發(fā)現(xiàn)該蛋白包含c TP(Chloroplast transport peptides)，分值為0.570，可靠性級(jí)別(Reliability class)為5，表明該蛋白定位于葉綠體，并預(yù)測(cè)c TP長(zhǎng)度為40個(gè)氨基酸殘基。

不同植物BAM3的系統(tǒng)進(jìn)化分析結(jié)果表明，蘋果MdBAM3與白梨PbrBAM3親緣關(guān)系最近，與甜櫻桃、梅、桃、森林草莓、薔薇、月季等薔薇科植物的BAM3聚為一類(圖4)。對(duì)于9個(gè)擬南芥AtBAM蛋白，可明顯聚為4類：AtBAM1和AtBAM3,At BAM5和At BAM6,AtBAM2、AtBAM7和AtBAM8,At BA-M4和AtBAM9，而蘋果MdBAM3與At BAM1、AtBAM3聚為一類，與AtBAM3最近(圖4)。1.3 MdBAM3響應(yīng)低溫的表達(dá)模式分析

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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