利用隨機矩陣理論分析乳腺癌基因微陣列數(shù)據(jù),得到乳腺癌基因共表達網(wǎng)絡(luò),找出乳腺癌基因共表達網(wǎng)絡(luò)中重要的增殖模塊和免疫模塊,并預(yù)測基因PMSCL1與乳腺癌細胞的增殖、侵襲及遷移有關(guān),基因CCAN2與乳腺癌細胞的有絲分裂有關(guān),基因SCYA5與乳腺癌細胞的免疫應(yīng)答有關(guān),基因PRC1、RAB31、INHBA可作為乳腺癌的靶向基因. 

【文章來源】：江西師范大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2020,44(05)北大核心

【文章頁數(shù)】：6 頁

【部分圖文】：

Poisson分布曲線

設(shè)定去噪步長Δq=0.01,將去噪因子q由0逐步增加到1,計算每個去噪因子q值對應(yīng)特征值的最近鄰間隔分布.發(fā)現(xiàn)隨著q值的增加,乳腺癌關(guān)聯(lián)矩陣特征值的最近鄰間隔分布函數(shù)P(s)的分布曲線發(fā)生尖銳轉(zhuǎn)變,由Wigner-Dyson分布銳變到Poisson分布,如圖3所示.這說明通過增加q值,隨機噪聲引入的模塊間弱相互作用逐漸被去除掉,體系保留下來的是基因間真實的強相互作用,代表乳腺癌基因網(wǎng)絡(luò)從無規(guī)全局網(wǎng)絡(luò)過渡到真實信息的生物網(wǎng)絡(luò).通過計算乳腺癌關(guān)聯(lián)矩陣特征值NNSDs對高斯分布的標準誤差與對泊松分布的標準誤差來確定乳腺癌基因共表達網(wǎng)絡(luò)模塊的分割閾值,標準誤差的計算公式為

通過作乳腺癌關(guān)聯(lián)矩陣特征值NNSDs對高斯分布的標準誤差與對泊松分布的標準誤差的比值曲線圖(見圖4)可見,當(dāng)q=0.78時標準誤差的比值最大.此時系統(tǒng)完全過渡到泊松系統(tǒng),基因模塊間由噪聲引入的弱相互作用被充分去掉,乳腺癌基因網(wǎng)絡(luò)呈現(xiàn)基因間本質(zhì)網(wǎng)絡(luò)模塊.因此,選取q=0.78為3 044×77的乳腺癌基因共表達網(wǎng)絡(luò)模塊的分割閾值.2.2 獲取乳腺癌共表達網(wǎng)絡(luò)模塊

【參考文獻】：
期刊論文
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