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玉米大斑病菌幾丁質(zhì)合成酶基因StCHS6的結(jié)構(gòu)分析及功能研究

發(fā)布時(shí)間:2021-03-29 06:22
  本課題組前期通過(guò)生物信息學(xué)分析從玉米大斑病菌基因組中鑒定出8個(gè)幾丁質(zhì)合成酶基因(StCHS1-StCHS8),但對(duì)各個(gè)基因在病菌生長(zhǎng)發(fā)育及侵染過(guò)程中的表達(dá)規(guī)律及功能尚不清楚。在此基礎(chǔ)上,本研究利用RNA-Seq技術(shù)分析了病菌中幾丁質(zhì)合成酶家族基因在菌絲、分生孢子、芽管、附著胞和侵入釘5個(gè)發(fā)育時(shí)期的表達(dá)情況,并創(chuàng)制了高表達(dá)基因StCHS6的敲除突變體,以闡明該基因在病菌生長(zhǎng)發(fā)育及致病過(guò)程中所發(fā)揮的作用。主要研究結(jié)果如下:1.玉米大斑病菌菌絲、分生孢子、芽管、附著胞和侵入釘5個(gè)發(fā)育時(shí)期的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)顯示,StCHS1、StCHS2、StCHS5、StCHS6在5個(gè)時(shí)期均有較高的表達(dá)量,StCHS3、StCHS4、StCHS7、StCHS8表達(dá)量較低(FPKM<1)或者不表達(dá)。值得注意的是,StCHS6在5個(gè)時(shí)期的表達(dá)量均為最高,預(yù)示StCHS6在病菌的生長(zhǎng)發(fā)育及致病過(guò)程中可能發(fā)揮重要作用。2.StCHS6位于玉米大斑病菌基因組scaffold1:2066293-2069876(-)的位置,基因全長(zhǎng)為3584 bp,CDS序列大小為2703 bp。該基因含有4個(gè)內(nèi)含... 

【文章來(lái)源】:河北農(nóng)業(yè)大學(xué)河北省

【文章頁(yè)數(shù)】:53 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

玉米大斑病菌幾丁質(zhì)合成酶基因StCHS6的結(jié)構(gòu)分析及功能研究


真菌細(xì)胞壁的組成

真菌幾丁質(zhì),合成酶,系統(tǒng)發(fā)育樹


圖 2 真菌幾丁質(zhì)合成酶的系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.2 Phylogenetic tree of fungal chitin synthases(Zunyong Liu. et al. 2016)s2、FgChs3a、 FgChs3b、FgChs4、 FgChs5、 FgChs6 、 FgChs7 來(lái)自于禾谷鐮孢;AnChAnChsG、AnCsmA 、AnCsmB 來(lái)自于構(gòu)巢曲霉;BcChs1、BcChs2、BcChs3A、BcChs3B、BcC萄孢;NcChs1、 NcChs2、NcChs3、NcChs4、NcChs5、NcChs6、NcChs7 來(lái)自于粗糙脈孢菌MoChs5、MoChs6、MoChs7 來(lái)自于稻瘟病菌; ScChs1、ScChs2、ScChs3 來(lái)自于釀酒酵母幾丁質(zhì)合成酶包含 ScChs1、NcChs3、MoChs3、FgChs1ScChs1 在出芽過(guò)程中作為一種修復(fù)酶,修補(bǔ)釀酒酵母子細(xì)[38];在粗糙脈孢菌中,表達(dá) NcChs3-GFP 蛋白的轉(zhuǎn)化子菌絲尖端,表明 NcChs3 可能參與真菌的極性生長(zhǎng)過(guò)程[3

植物病原真菌,系統(tǒng)發(fā)育樹


6圖 3 植物病原真菌中幾丁質(zhì)合成酶系統(tǒng)發(fā)育樹(本實(shí)驗(yàn)室繪制)Fig.3 The phylogeny tree of chitin synthase gene family from plant pathogenic fungus


本文編號(hào):3107072

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