應用CRISPR/Cas9基因編輯技術建立差異甲基化區(qū)CGI-2敲除小鼠
發(fā)布時間:2021-03-27 19:57
Dlk1-Dio3印記區(qū)是小鼠基因組中一個重要的印記基因簇,存在多個蛋白編碼基因、長非編碼RNA基因,以及為數(shù)眾多的micro RNA和sno RNA基因。此印記區(qū)間基因的印記表達對于胚胎發(fā)育十分重要。深入研究此印記區(qū)基因的表達調(diào)控及作用機制,對于揭示印記基因在胚胎發(fā)育中的作用及獲取高質量i PS細胞具有重要意義。而目前的研究僅限于三個已知的父本甲基化的差異甲基化區(qū)(IG-DMR,Gtl2-DMR和Dlk1-DMR)對該印記區(qū)的基因表達調(diào)控。因此,尋找和鑒定新的差異甲基化區(qū)對進一步解析此印記區(qū)的基因調(diào)控機制及分子機理具有重要意義。結合本實驗室前期研究發(fā)現(xiàn)的一個新的差異甲基化區(qū)CGI-2,本課題利用新一代基因編輯技術CRISPR/Cas9,建立差異甲基化區(qū)CGI-2敲除小鼠。我們首先設計并制備了用于sg RNA體外轉錄的模板和Cas9體外轉錄模板,然后通過顯微注射方式注射到小鼠受精卵中,并將其培養(yǎng)至囊胚,然后移植到假孕母鼠子宮內(nèi),成功獲得了一只Founder(首建小鼠)。最終移植了64枚囊胚,獲得5只新生小鼠,經(jīng)鑒定,有1只CGI-2單等位敲除的小鼠,總陽性率為20%。我們將Founde...
【文章來源】:哈爾濱工業(yè)大學黑龍江省 211工程院校 985工程院校
【文章頁數(shù)】:67 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
小鼠Dlk1-Dio3印記區(qū)域結構示意圖
圖 1-2 CGI-2 差異甲基化區(qū)的位置CRISPR/Cas9 是最近發(fā)現(xiàn)的一種新型基因組定點編輯技術。CRISPR 是一規(guī)則和短隔行重復序列。它是在大腸桿菌編碼的堿性磷酸酶基因的研究中[10]。它最初存在于含有多個短重復序列的細菌和古細菌的基因組中。它己提供特定的免疫保護機制。入侵外來的元素,如病毒和質粒[11]。CRISP要依靠 crRNA(CRISPR RNA)和 tracrRNA(反式激活嵌合 RNA)組合Cas 蛋白進行外源 DNA 序列特異性降解[12]。在此基礎上,可以在基因組的進行基因打靶,基因插入和基因修復的基因操作。這種新的基因組定點比類轉錄激活因子效應物核酸酶(TALEN)和鋅指核酸酶(ZFN)技術具有構單快捷、突變效率高、成本低廉、適用范圍廣等許多優(yōu)點,已成為一種因組編輯工具。該技術已成功應用于細菌、人類細胞、斑馬魚、小鼠、猴以及多種植物的基因組精確修飾,是最具有臨床與應用前景的基因治一。所以本課題擬通過利用新一代基因編輯技術 CRISPR/Cas9,建立差區(qū) CGI-2 敲除小鼠并對相關基因印記表達的影響,本研究結果對進一步
圖 1-3 CRISPR/Cas9 原理示意圖CRISPR/Cas 系統(tǒng)的功能可以分為三個階段。第一階段是獲得一個新的間隔二階段是 CRISPR 基因座的表達,包括轉錄和轉錄后處理,第三階段是干擾源基因物質的 CRISPR/Cas 系統(tǒng)。在開始下一段之前,我們首先解釋兩個名原始間隔序列(原型間隔區(qū)),它是一個間隔序列或質粒序列,與間隔序列。PAM 是原型間隔區(qū) 5'或 3'末端的保守序列,其長度一般為 2-5bp,接近原區(qū)[57]。在不同的菌株或不同類型的 CRISPR/Cas 系統(tǒng)中,PAM 序列和位置的。例如在釀膿鏈球菌中,PAM 序列是 NGG,N 可以是任何核苷酸,沒有差位于原型間隔子的 3'末端[58,59],而在嗜熱鏈球菌(嗜熱鏈球菌)中,I 型 PA是 AGAAA/ T,其位于 3 '原型間隔的末端[60,61],II 型的 PAM 序列是 GGNG在原型間隔的 3'末端,在 5'末端。在硫化葉菌中 PAM 序列是 TCC[62]。值得是部分 III 型 CRISPR/Cas 系統(tǒng)的原型間隔器中沒有 PAM 序列。.3.2 CRISPR/Cas9 的國內(nèi)外研究現(xiàn)狀
【參考文獻】:
期刊論文
[1]CRISPR/Cas9技術研究進展[J]. 李和剛,楊峰,張寶珣,李培培,王建華,包漢勛,苗剛,江科,柳楠. 中國畜牧雜志. 2015(21)
[2]CRISPR/Cas技術研究進展[J]. 常振儀,嚴維,劉東風,陳竹鋒,謝剛,盧嘉威,吳建新,唐曉艷. 農(nóng)業(yè)生物技術學報. 2015(09)
[3]CRISPR/Cas:新一代基因編輯技術[J]. 黃妤,王世春. 生命的化學. 2015(01)
[4]CRISPR/Cas9系統(tǒng)介導基因組編輯的研究進展[J]. 劉志國. 畜牧獸醫(yī)學報. 2014(10)
[5]外源基因在轉基因動物中遺傳和表達的穩(wěn)定性[J]. 孔慶然,劉忠華. 遺傳. 2011(05)
[6]DNA甲基化研究進展[J]. 王琦,胡鳳成,李春明. 科技情報開發(fā)與經(jīng)濟. 2009(29)
[7]轉基因技術在動物遺傳改良上的應用進展[J]. 劉中華,王華巖,喬憲鳳,鄭新民. 湖北農(nóng)業(yè)科學. 2009(02)
[8]哺乳動物轉基因技術研究概況[J]. 孫劍鋒,岳文斌. 山西農(nóng)業(yè)科學. 2008(01)
[9]轉基因技術改良家畜的現(xiàn)狀與趨勢[J]. 童佳,李寧. 中國農(nóng)業(yè)科技導報. 2007(04)
[10]胚胎顯微操作技術進展及存在問題[J]. 譚景和,秦鵬春. 東北農(nóng)學院學報. 1992(03)
博士論文
[1]小鼠Dlk1-Dio3印記區(qū)域內(nèi)一個新的差異甲基化區(qū)的表觀遺傳學分析[D]. 曾鐵波.哈爾濱工業(yè)大學 2015
碩士論文
[1]Dlk1-Dio3印記區(qū)域內(nèi)CGI-2調(diào)控基因表達的研究[D]. 張棲桐.哈爾濱工業(yè)大學 2016
本文編號:3104121
【文章來源】:哈爾濱工業(yè)大學黑龍江省 211工程院校 985工程院校
【文章頁數(shù)】:67 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
小鼠Dlk1-Dio3印記區(qū)域結構示意圖
圖 1-2 CGI-2 差異甲基化區(qū)的位置CRISPR/Cas9 是最近發(fā)現(xiàn)的一種新型基因組定點編輯技術。CRISPR 是一規(guī)則和短隔行重復序列。它是在大腸桿菌編碼的堿性磷酸酶基因的研究中[10]。它最初存在于含有多個短重復序列的細菌和古細菌的基因組中。它己提供特定的免疫保護機制。入侵外來的元素,如病毒和質粒[11]。CRISP要依靠 crRNA(CRISPR RNA)和 tracrRNA(反式激活嵌合 RNA)組合Cas 蛋白進行外源 DNA 序列特異性降解[12]。在此基礎上,可以在基因組的進行基因打靶,基因插入和基因修復的基因操作。這種新的基因組定點比類轉錄激活因子效應物核酸酶(TALEN)和鋅指核酸酶(ZFN)技術具有構單快捷、突變效率高、成本低廉、適用范圍廣等許多優(yōu)點,已成為一種因組編輯工具。該技術已成功應用于細菌、人類細胞、斑馬魚、小鼠、猴以及多種植物的基因組精確修飾,是最具有臨床與應用前景的基因治一。所以本課題擬通過利用新一代基因編輯技術 CRISPR/Cas9,建立差區(qū) CGI-2 敲除小鼠并對相關基因印記表達的影響,本研究結果對進一步
圖 1-3 CRISPR/Cas9 原理示意圖CRISPR/Cas 系統(tǒng)的功能可以分為三個階段。第一階段是獲得一個新的間隔二階段是 CRISPR 基因座的表達,包括轉錄和轉錄后處理,第三階段是干擾源基因物質的 CRISPR/Cas 系統(tǒng)。在開始下一段之前,我們首先解釋兩個名原始間隔序列(原型間隔區(qū)),它是一個間隔序列或質粒序列,與間隔序列。PAM 是原型間隔區(qū) 5'或 3'末端的保守序列,其長度一般為 2-5bp,接近原區(qū)[57]。在不同的菌株或不同類型的 CRISPR/Cas 系統(tǒng)中,PAM 序列和位置的。例如在釀膿鏈球菌中,PAM 序列是 NGG,N 可以是任何核苷酸,沒有差位于原型間隔子的 3'末端[58,59],而在嗜熱鏈球菌(嗜熱鏈球菌)中,I 型 PA是 AGAAA/ T,其位于 3 '原型間隔的末端[60,61],II 型的 PAM 序列是 GGNG在原型間隔的 3'末端,在 5'末端。在硫化葉菌中 PAM 序列是 TCC[62]。值得是部分 III 型 CRISPR/Cas 系統(tǒng)的原型間隔器中沒有 PAM 序列。.3.2 CRISPR/Cas9 的國內(nèi)外研究現(xiàn)狀
【參考文獻】:
期刊論文
[1]CRISPR/Cas9技術研究進展[J]. 李和剛,楊峰,張寶珣,李培培,王建華,包漢勛,苗剛,江科,柳楠. 中國畜牧雜志. 2015(21)
[2]CRISPR/Cas技術研究進展[J]. 常振儀,嚴維,劉東風,陳竹鋒,謝剛,盧嘉威,吳建新,唐曉艷. 農(nóng)業(yè)生物技術學報. 2015(09)
[3]CRISPR/Cas:新一代基因編輯技術[J]. 黃妤,王世春. 生命的化學. 2015(01)
[4]CRISPR/Cas9系統(tǒng)介導基因組編輯的研究進展[J]. 劉志國. 畜牧獸醫(yī)學報. 2014(10)
[5]外源基因在轉基因動物中遺傳和表達的穩(wěn)定性[J]. 孔慶然,劉忠華. 遺傳. 2011(05)
[6]DNA甲基化研究進展[J]. 王琦,胡鳳成,李春明. 科技情報開發(fā)與經(jīng)濟. 2009(29)
[7]轉基因技術在動物遺傳改良上的應用進展[J]. 劉中華,王華巖,喬憲鳳,鄭新民. 湖北農(nóng)業(yè)科學. 2009(02)
[8]哺乳動物轉基因技術研究概況[J]. 孫劍鋒,岳文斌. 山西農(nóng)業(yè)科學. 2008(01)
[9]轉基因技術改良家畜的現(xiàn)狀與趨勢[J]. 童佳,李寧. 中國農(nóng)業(yè)科技導報. 2007(04)
[10]胚胎顯微操作技術進展及存在問題[J]. 譚景和,秦鵬春. 東北農(nóng)學院學報. 1992(03)
博士論文
[1]小鼠Dlk1-Dio3印記區(qū)域內(nèi)一個新的差異甲基化區(qū)的表觀遺傳學分析[D]. 曾鐵波.哈爾濱工業(yè)大學 2015
碩士論文
[1]Dlk1-Dio3印記區(qū)域內(nèi)CGI-2調(diào)控基因表達的研究[D]. 張棲桐.哈爾濱工業(yè)大學 2016
本文編號:3104121
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