基于meta分析確定基因單核苷酸多態(tài)性與吸煙在消化道癌癥中的交互作用及vimentin在結(jié)直腸癌發(fā)生與預后中的作用
發(fā)布時間:2021-03-24 22:15
研究背景癌癥是21世紀人類疾病死亡的第二大死因。部分患者死于消化道癌癥,其中以結(jié)直腸癌(colorectal cancer,CRC),胃癌(gastric cancer,GC),肝癌(liver cancer,LC)和食管癌(oesophageal cancer,OC)為主。癌癥的發(fā)展涉及遺傳因素和環(huán)境因素的共同參與。吸煙作為一種癌癥相關的環(huán)境因素,可能與基因的單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphisms,SNP)之間存在交互作用。目前關于二者交互作用在消化道腫瘤發(fā)生中的研究為少量的單項研究,缺乏統(tǒng)計學效能,并且研究結(jié)果之間不一致。由于meta分析能夠?qū)ν徽n題的多項研究結(jié)果作出系統(tǒng)性的評價和總結(jié),提高統(tǒng)計學效能。因此,本研究首先通過meta分析研究基因單核苷酸多態(tài)性與吸煙在以上四種消化道癌癥發(fā)生中的關系。由于CRC具有高發(fā)病率、高死亡率和預后差的特點,因此,其預后也是研究的重點。Vimentin是腫瘤發(fā)生中上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)的最好標志之一,但是尚不確定vimentin是否可以作...
【文章來源】:西北大學陜西省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:130 頁
【學位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
縮略語對照表
第一章 緒論
1.1 消化道腫瘤概述
1.2 CRC概述
1.2.1 CRC的流行病學
1.2.1.1 CRC的地域分布差異
1.2.1.2 CRC的人群分布差異
1.2.2 CRC的相關危險因素
1.2.2.1 遺傳因素
1.2.2.2 環(huán)境和飲食因素
1.2.2.3 生活方式因素、疾病因素和其他
1.3 吸煙與基因單核苷酸多態(tài)性的交互作用對CRC易感性的影響
1.3.1 代謝基因與吸煙的交互作用對CRC易感性的影響
1.3.1.1 谷胱甘肽轉(zhuǎn)移酶(GSTs)家族基因與吸煙的交互作用研究
1.3.1.2 細胞色素P450(CYP450)家族基因與吸煙的交互作用研究
1.3.1.3 N-乙;D(zhuǎn)移酶(NATs)家族基因與吸煙的交互作用研究
1.3.1.4 亞甲基四氫葉酸還原酶(MTHFR)基因與吸煙的交互作用研究
1.3.2 DNA修復基因與吸煙的交互作用對CRC易感性的影響
1.3.3 腫瘤抑制基因與吸煙的交互作用對CRC易感性的影響
1.4 CRC預后預測研究
1.4.1 組織源性的預后標志物
1.4.1.1 分子預后標志物
1.4.1.2 具有預后意義的DNA變異
1.4.1.3 具有預后意義的miRNA
1.4.2 血液源性的預后標志物
1.4.2.1 術前和術后的血清癌胚抗原(carcinoembryonicantigen,CEA)水平
1.4.2.2 癌癥抗原19-9(CA19-9)水平
1.4.2.3 循環(huán)腫瘤細胞(circulatingtumorcells,CTCs)
第二章 基因單核苷酸多態(tài)性與吸煙的交互作用對四種消化道癌癥易感性影響的META分析
2.1 引言
2.2 材料與方法
2.2.1 文獻檢索策略
2.2.2 納入與剔除標準
2.2.3 數(shù)據(jù)提取
2.2.4 質(zhì)量評價
2.2.5 統(tǒng)計學方法
2.3 結(jié)果
2.3.1 文獻檢索結(jié)果
2.3.2 納入研究的特征
2.3.3 質(zhì)量評價結(jié)果
2.3.4 煙草代謝相關基因與吸煙的交互作用
2.3.4.1 GSTM1
2.3.4.2 GSTT1
2.3.4.3 GSTP1
2.3.4.4 CYP1A1
2.3.4.5 SULT1A1
2.3.4.6 NAT2
2.3.5 DNA修復基因與吸煙的交互作用
2.3.5.1hOGG1
2.3.5.2XRCC1
2.3.6 腫瘤抑制基因與吸煙的交互作用
2.4 討論
第三章 基于META分析和TCGA數(shù)據(jù)庫確定VIMENTIN參與結(jié)直腸癌的發(fā)生與預后
3.1 引言
3.2 材料和方法
3.2.1 Meta分析
3.2.1.1 檢索策略
3.2.1.2 文獻選擇標準
3.2.1.3 數(shù)據(jù)提取
3.2.1.4 質(zhì)量評價
3.2.1.5 統(tǒng)計學分析
3.2.2 TCGA數(shù)據(jù)庫的分析
3.3 結(jié)果
3.3.1 文獻檢索
3.3.2 研究特征和質(zhì)量評價
3.3.3 Vimentin表達與總生存率之間的關系
3.3.4 Vimentin表達與無疾病生存率(diseasefreesurvival,DFS)之間的關系
3.3.5 Vimentin表達與臨床病理學特征之間的關系
3.3.6 TCGA數(shù)據(jù)庫的分析
3.4 討論
結(jié)論
參考文獻
攻讀博士學位期間取得的科研成果
致謝
作者簡介
【參考文獻】:
期刊論文
[1]中國居民2015年惡性腫瘤死亡率流行病學特征分析[J]. 蘭藍,趙飛,蔡玥,武瑞仙,孟群. 中華流行病學雜志. 2018 (01)
[2]Dietary factors can protect against liver cancer development[J]. Lemonica Koumbi. World Journal of Hepatology. 2017(03)
[3]CYP1A1, CYP2E1 and EPHX1 polymorphisms in sporadic colorectal neoplasms[J]. Glaucia Maria M Fernandes,Anelise Russo,Marcela Alcantara Proen?a,Nathalia Fernanda Gazola,Gabriela Helena Rodrigues,Patrícia Matos Biselli-Chicote,Ana Elizabete Silva,Jo?o Gomes Netinho,érika Cristina Pavarino,Eny Maria Goloni-Bertollo. World Journal of Gastroenterology. 2016(45)
[4]波形蛋白在結(jié)直腸腺癌中的表達及其臨床意義[J]. 譚景浪,陳瓊,喬莎莎,覃勤英,鄧娟榮,李美良,陸厚良. 廣西醫(yī)科大學學報. 2016(05)
[5]從腫瘤登記數(shù)據(jù)看中國惡性腫瘤的發(fā)病特點和趨勢[J]. 陳萬青. 中華健康管理學雜志. 2016 (04)
[6]Systematic review of the old and new concepts in the epithelial-mesenchymal transition of colorectal cancer[J]. Simona Gurzu,Camelia Silveanu,Annamaria Fetyko,Vlad Butiurca,Zsolt Kovacs,Ioan Jung. World Journal of Gastroenterology. 2016(30)
[7]RhoGDI2與EMT相關蛋白在結(jié)直腸癌組織中表達的臨床意義及相關性[J]. 陳穎,姜昊聲,馬俐君,柳思琪,金珍婧,徐慶. 中國實驗診斷學. 2015(09)
[8]結(jié)直腸癌病人Vimentin表達的臨床意義[J]. 高照華,張皓,石剛. 實用腫瘤學雜志. 2015 (04)
[9]結(jié)直腸癌流行病學趨勢[J]. 李道娟,李倩,賀宇彤. 腫瘤防治研究. 2015(03)
[10]結(jié)直腸癌基因組流行病學研究進展[J]. 陳爾飛,徐曉娜,楊進. 基因組學與應用生物學. 2014(05)
碩士論文
[1]E-cadherin和Vimentin在新疆維吾爾族、漢族結(jié)腸癌中的表達及其臨床意義[D]. 李龍龍.新疆醫(yī)科大學 2015
[2]環(huán)境暴露、代謝酶基因多態(tài)性與結(jié)直腸癌的病例對照研究[D]. 蔣沁婷.浙江大學 2003
本文編號:3098490
【文章來源】:西北大學陜西省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:130 頁
【學位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
縮略語對照表
第一章 緒論
1.1 消化道腫瘤概述
1.2 CRC概述
1.2.1 CRC的流行病學
1.2.1.1 CRC的地域分布差異
1.2.1.2 CRC的人群分布差異
1.2.2 CRC的相關危險因素
1.2.2.1 遺傳因素
1.2.2.2 環(huán)境和飲食因素
1.2.2.3 生活方式因素、疾病因素和其他
1.3 吸煙與基因單核苷酸多態(tài)性的交互作用對CRC易感性的影響
1.3.1 代謝基因與吸煙的交互作用對CRC易感性的影響
1.3.1.1 谷胱甘肽轉(zhuǎn)移酶(GSTs)家族基因與吸煙的交互作用研究
1.3.1.2 細胞色素P450(CYP450)家族基因與吸煙的交互作用研究
1.3.1.3 N-乙;D(zhuǎn)移酶(NATs)家族基因與吸煙的交互作用研究
1.3.1.4 亞甲基四氫葉酸還原酶(MTHFR)基因與吸煙的交互作用研究
1.3.2 DNA修復基因與吸煙的交互作用對CRC易感性的影響
1.3.3 腫瘤抑制基因與吸煙的交互作用對CRC易感性的影響
1.4 CRC預后預測研究
1.4.1 組織源性的預后標志物
1.4.1.1 分子預后標志物
1.4.1.2 具有預后意義的DNA變異
1.4.1.3 具有預后意義的miRNA
1.4.2 血液源性的預后標志物
1.4.2.1 術前和術后的血清癌胚抗原(carcinoembryonicantigen,CEA)水平
1.4.2.2 癌癥抗原19-9(CA19-9)水平
1.4.2.3 循環(huán)腫瘤細胞(circulatingtumorcells,CTCs)
第二章 基因單核苷酸多態(tài)性與吸煙的交互作用對四種消化道癌癥易感性影響的META分析
2.1 引言
2.2 材料與方法
2.2.1 文獻檢索策略
2.2.2 納入與剔除標準
2.2.3 數(shù)據(jù)提取
2.2.4 質(zhì)量評價
2.2.5 統(tǒng)計學方法
2.3 結(jié)果
2.3.1 文獻檢索結(jié)果
2.3.2 納入研究的特征
2.3.3 質(zhì)量評價結(jié)果
2.3.4 煙草代謝相關基因與吸煙的交互作用
2.3.4.1 GSTM1
2.3.4.2 GSTT1
2.3.4.3 GSTP1
2.3.4.4 CYP1A1
2.3.4.5 SULT1A1
2.3.4.6 NAT2
2.3.5 DNA修復基因與吸煙的交互作用
2.3.5.1hOGG1
2.3.5.2XRCC1
2.3.6 腫瘤抑制基因與吸煙的交互作用
2.4 討論
第三章 基于META分析和TCGA數(shù)據(jù)庫確定VIMENTIN參與結(jié)直腸癌的發(fā)生與預后
3.1 引言
3.2 材料和方法
3.2.1 Meta分析
3.2.1.1 檢索策略
3.2.1.2 文獻選擇標準
3.2.1.3 數(shù)據(jù)提取
3.2.1.4 質(zhì)量評價
3.2.1.5 統(tǒng)計學分析
3.2.2 TCGA數(shù)據(jù)庫的分析
3.3 結(jié)果
3.3.1 文獻檢索
3.3.2 研究特征和質(zhì)量評價
3.3.3 Vimentin表達與總生存率之間的關系
3.3.4 Vimentin表達與無疾病生存率(diseasefreesurvival,DFS)之間的關系
3.3.5 Vimentin表達與臨床病理學特征之間的關系
3.3.6 TCGA數(shù)據(jù)庫的分析
3.4 討論
結(jié)論
參考文獻
攻讀博士學位期間取得的科研成果
致謝
作者簡介
【參考文獻】:
期刊論文
[1]中國居民2015年惡性腫瘤死亡率流行病學特征分析[J]. 蘭藍,趙飛,蔡玥,武瑞仙,孟群. 中華流行病學雜志. 2018 (01)
[2]Dietary factors can protect against liver cancer development[J]. Lemonica Koumbi. World Journal of Hepatology. 2017(03)
[3]CYP1A1, CYP2E1 and EPHX1 polymorphisms in sporadic colorectal neoplasms[J]. Glaucia Maria M Fernandes,Anelise Russo,Marcela Alcantara Proen?a,Nathalia Fernanda Gazola,Gabriela Helena Rodrigues,Patrícia Matos Biselli-Chicote,Ana Elizabete Silva,Jo?o Gomes Netinho,érika Cristina Pavarino,Eny Maria Goloni-Bertollo. World Journal of Gastroenterology. 2016(45)
[4]波形蛋白在結(jié)直腸腺癌中的表達及其臨床意義[J]. 譚景浪,陳瓊,喬莎莎,覃勤英,鄧娟榮,李美良,陸厚良. 廣西醫(yī)科大學學報. 2016(05)
[5]從腫瘤登記數(shù)據(jù)看中國惡性腫瘤的發(fā)病特點和趨勢[J]. 陳萬青. 中華健康管理學雜志. 2016 (04)
[6]Systematic review of the old and new concepts in the epithelial-mesenchymal transition of colorectal cancer[J]. Simona Gurzu,Camelia Silveanu,Annamaria Fetyko,Vlad Butiurca,Zsolt Kovacs,Ioan Jung. World Journal of Gastroenterology. 2016(30)
[7]RhoGDI2與EMT相關蛋白在結(jié)直腸癌組織中表達的臨床意義及相關性[J]. 陳穎,姜昊聲,馬俐君,柳思琪,金珍婧,徐慶. 中國實驗診斷學. 2015(09)
[8]結(jié)直腸癌病人Vimentin表達的臨床意義[J]. 高照華,張皓,石剛. 實用腫瘤學雜志. 2015 (04)
[9]結(jié)直腸癌流行病學趨勢[J]. 李道娟,李倩,賀宇彤. 腫瘤防治研究. 2015(03)
[10]結(jié)直腸癌基因組流行病學研究進展[J]. 陳爾飛,徐曉娜,楊進. 基因組學與應用生物學. 2014(05)
碩士論文
[1]E-cadherin和Vimentin在新疆維吾爾族、漢族結(jié)腸癌中的表達及其臨床意義[D]. 李龍龍.新疆醫(yī)科大學 2015
[2]環(huán)境暴露、代謝酶基因多態(tài)性與結(jié)直腸癌的病例對照研究[D]. 蔣沁婷.浙江大學 2003
本文編號:3098490
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