基于RNA-seq的紅肉番木瓜果實(shí)成熟相關(guān)基因的挖掘
發(fā)布時(shí)間:2021-03-24 18:50
番木瓜(Carica papaya L.)是番木瓜科(Caricaceae)番木瓜屬多年生草本植物,是熱帶、亞熱帶地區(qū)重要果樹(shù)之一。番木瓜屬于呼吸躍變型果實(shí),在采后果實(shí)從外觀到內(nèi)部發(fā)生了一系列變化,如乙烯生成、細(xì)胞壁和果膠物質(zhì)降解、呼吸速率、色澤及揮發(fā)性物質(zhì)的改變等。RNA-Seq技術(shù)是植物功能基因組學(xué)研究的重要手段,可以快速獲得高通量的轉(zhuǎn)錄本序列信息及表達(dá)量數(shù)據(jù)。本文以番木瓜果實(shí)為試材,進(jìn)行了不同成熟期番木瓜果實(shí)轉(zhuǎn)錄組分析,以及果實(shí)成熟相關(guān)差異表達(dá)基因的篩選。主要研究結(jié)果如下:1.測(cè)定分析了不同成熟期番木瓜果實(shí)的果肉硬度、乙烯產(chǎn)量、葉綠素和類(lèi)胡蘿卜素含量,以及香氣物質(zhì)成分和含量。番木瓜果實(shí)在后熟過(guò)程中,果皮顏色由綠變黃,果肉顏色由白變?yōu)槌燃t色;果皮中的葉綠素含量逐漸下降,在果肉中幾乎檢測(cè)不到葉綠素;類(lèi)胡蘿卜素的含量在果皮和果肉中都呈上升趨勢(shì),并且果皮中的類(lèi)胡蘿素含量始終高于果肉。隨著果實(shí)成熟,番木瓜果肉硬度在破色期開(kāi)始迅速下降;乙烯產(chǎn)量逐漸上升,在半黃期達(dá)到最大值。采用頂空-固相微萃取結(jié)合GC-MS法分析了3個(gè)番木瓜品種的香氣物質(zhì),共檢測(cè)到68種化合物,分別是2種酸類(lèi)、11種酮類(lèi)、5...
【文章來(lái)源】:福建農(nóng)林大學(xué)福建省
【文章頁(yè)數(shù)】:102 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
葉綠素降解代謝途徑[43]
基于 RNA-seq 的紅肉番木瓜果實(shí)成熟相關(guān)基因的挖掘胡蘿卜素的生物合成的主要途徑[44]。目前,通過(guò)生理生的研究,已逐步闡明了類(lèi)胡蘿卜素的合成代謝過(guò)程。茄紅素合成酶)催化兩分子 GGPP(牻牛兒基牻牛兒基類(lèi)胡蘿卜素—八氫番茄紅素。然后,八氫番茄紅素在氫酶)和 ZDS 酶(ζ-胡蘿卜素脫氫酶)催化下形成番化是類(lèi)胡蘿卜素生物合成途徑的一個(gè)重要分支點(diǎn),由化酶)和 LCYE(番茄紅素ε-環(huán)化酶)共同催化[45, 46]。LCYE催化下生成δ-胡蘿卜素,繼而在LCYB催化下生卜素在 CHYB 酶(β-胡蘿卜素羥化)和 LUT 酶(ε-環(huán)素[47]。在β分支中,番茄紅素在 LCYB 的作用下先轉(zhuǎn)化胡蘿卜素;然后在β-胡蘿卜素羥化酶的作用下生成β-隱[48],見(jiàn)圖 1-2。
第一章 前言4 果實(shí)香氣物質(zhì)的代謝及其相關(guān)酶酸類(lèi)、酯類(lèi)、酮類(lèi)、醛類(lèi)、酸類(lèi)、內(nèi)酯類(lèi)、萜類(lèi)化合物及含硫化合物是番木瓜果實(shí)中的主要揮發(fā)性物質(zhì)。這些化合物均屬于果實(shí)的次生產(chǎn)物,一般是以脂肪酸、氨基酸和碳水化合物等作為前體物質(zhì),見(jiàn)圖 1-3。揮發(fā)性物質(zhì)的生物合成過(guò)程與脂肪酸、氨基酸等前體物質(zhì)的數(shù)量和組成極為相關(guān)[50]。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]獼猴桃PG基因在果實(shí)貯藏過(guò)程中的表達(dá)及其與硬度的關(guān)系[J]. 羅靜,郭琳琳,黃玉南,王超,喬成奎,謝漢忠,方金豹. 園藝學(xué)報(bào). 2018(05)
[2]中華獼猴桃(Actinidiachinensis Planch)果實(shí)香氣成分及相關(guān)基因表達(dá)[J]. 董婧,劉永勝,唐維. 應(yīng)用與環(huán)境生物學(xué)報(bào). 2018(02)
[3]柑橘果實(shí)萜烯類(lèi)揮發(fā)性物質(zhì)研究進(jìn)展[J]. 馮桂蓉,謝姣,鄧麗莉,曾凱芳,姚世響. 食品與機(jī)械. 2017(10)
[4]水楊酸處理對(duì)采后臺(tái)農(nóng)芒果品質(zhì)和活性氧代謝的影響[J]. 何俊瑜,任艷芳,劉屹萱,肖子璋,劉進(jìn)平,吳勝艷. 食品工業(yè)科技. 2016(15)
[5]擴(kuò)展蛋白在果實(shí)成熟過(guò)程中的作用研究進(jìn)展[J]. 趙美榮,李永春,黃文婕. 赤峰學(xué)院學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2016(11)
[6]園藝作物基因組測(cè)序研究進(jìn)展[J]. 倪曉鵬,高志紅. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(02)
[7]柿采后丙烯和1–甲基環(huán)丙烯處理對(duì)兩個(gè)擴(kuò)展蛋白基因表達(dá)的影響[J]. 孫振營(yíng),韓葉,李秀芳,馬秋詩(shī),饒景萍. 園藝學(xué)報(bào). 2014(06)
[8]RNA-Seq在果樹(shù)學(xué)研究中的應(yīng)用[J]. 馮超,朱長(zhǎng)青,徐昌杰,陳昆松. 果樹(shù)學(xué)報(bào). 2014(01)
[9]果實(shí)香氣物質(zhì)的研究進(jìn)展[J]. 黎源,董濤. 熱帶生物學(xué)報(bào). 2013(03)
[10]植物衰老葉片與成熟果實(shí)中葉綠素的降解[J]. 李棟棟,羅自生. 園藝學(xué)報(bào). 2013(10)
博士論文
[1]番茄果膠裂解酶及S-腺苷高半胱氨酸水解酶基因在果實(shí)成熟中的功能研究[D]. 楊璐.重慶大學(xué) 2017
[2]LOB1等轉(zhuǎn)錄因子對(duì)番茄果實(shí)軟化的調(diào)控[D]. 石艷娜.浙江大學(xué) 2017
碩士論文
[1]不同質(zhì)構(gòu)甜瓜果實(shí)成熟軟化的轉(zhuǎn)錄組分析及XTH基因研究[D]. 李三培.天津大學(xué) 2017
[2]基于轉(zhuǎn)錄組學(xué)杏果實(shí)風(fēng)味、色澤品質(zhì)形成相關(guān)基因挖掘及轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)解析[D]. 張秋云.西南大學(xué) 2017
本文編號(hào):3098211
【文章來(lái)源】:福建農(nóng)林大學(xué)福建省
【文章頁(yè)數(shù)】:102 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
葉綠素降解代謝途徑[43]
基于 RNA-seq 的紅肉番木瓜果實(shí)成熟相關(guān)基因的挖掘胡蘿卜素的生物合成的主要途徑[44]。目前,通過(guò)生理生的研究,已逐步闡明了類(lèi)胡蘿卜素的合成代謝過(guò)程。茄紅素合成酶)催化兩分子 GGPP(牻牛兒基牻牛兒基類(lèi)胡蘿卜素—八氫番茄紅素。然后,八氫番茄紅素在氫酶)和 ZDS 酶(ζ-胡蘿卜素脫氫酶)催化下形成番化是類(lèi)胡蘿卜素生物合成途徑的一個(gè)重要分支點(diǎn),由化酶)和 LCYE(番茄紅素ε-環(huán)化酶)共同催化[45, 46]。LCYE催化下生成δ-胡蘿卜素,繼而在LCYB催化下生卜素在 CHYB 酶(β-胡蘿卜素羥化)和 LUT 酶(ε-環(huán)素[47]。在β分支中,番茄紅素在 LCYB 的作用下先轉(zhuǎn)化胡蘿卜素;然后在β-胡蘿卜素羥化酶的作用下生成β-隱[48],見(jiàn)圖 1-2。
第一章 前言4 果實(shí)香氣物質(zhì)的代謝及其相關(guān)酶酸類(lèi)、酯類(lèi)、酮類(lèi)、醛類(lèi)、酸類(lèi)、內(nèi)酯類(lèi)、萜類(lèi)化合物及含硫化合物是番木瓜果實(shí)中的主要揮發(fā)性物質(zhì)。這些化合物均屬于果實(shí)的次生產(chǎn)物,一般是以脂肪酸、氨基酸和碳水化合物等作為前體物質(zhì),見(jiàn)圖 1-3。揮發(fā)性物質(zhì)的生物合成過(guò)程與脂肪酸、氨基酸等前體物質(zhì)的數(shù)量和組成極為相關(guān)[50]。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]獼猴桃PG基因在果實(shí)貯藏過(guò)程中的表達(dá)及其與硬度的關(guān)系[J]. 羅靜,郭琳琳,黃玉南,王超,喬成奎,謝漢忠,方金豹. 園藝學(xué)報(bào). 2018(05)
[2]中華獼猴桃(Actinidiachinensis Planch)果實(shí)香氣成分及相關(guān)基因表達(dá)[J]. 董婧,劉永勝,唐維. 應(yīng)用與環(huán)境生物學(xué)報(bào). 2018(02)
[3]柑橘果實(shí)萜烯類(lèi)揮發(fā)性物質(zhì)研究進(jìn)展[J]. 馮桂蓉,謝姣,鄧麗莉,曾凱芳,姚世響. 食品與機(jī)械. 2017(10)
[4]水楊酸處理對(duì)采后臺(tái)農(nóng)芒果品質(zhì)和活性氧代謝的影響[J]. 何俊瑜,任艷芳,劉屹萱,肖子璋,劉進(jìn)平,吳勝艷. 食品工業(yè)科技. 2016(15)
[5]擴(kuò)展蛋白在果實(shí)成熟過(guò)程中的作用研究進(jìn)展[J]. 趙美榮,李永春,黃文婕. 赤峰學(xué)院學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2016(11)
[6]園藝作物基因組測(cè)序研究進(jìn)展[J]. 倪曉鵬,高志紅. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(02)
[7]柿采后丙烯和1–甲基環(huán)丙烯處理對(duì)兩個(gè)擴(kuò)展蛋白基因表達(dá)的影響[J]. 孫振營(yíng),韓葉,李秀芳,馬秋詩(shī),饒景萍. 園藝學(xué)報(bào). 2014(06)
[8]RNA-Seq在果樹(shù)學(xué)研究中的應(yīng)用[J]. 馮超,朱長(zhǎng)青,徐昌杰,陳昆松. 果樹(shù)學(xué)報(bào). 2014(01)
[9]果實(shí)香氣物質(zhì)的研究進(jìn)展[J]. 黎源,董濤. 熱帶生物學(xué)報(bào). 2013(03)
[10]植物衰老葉片與成熟果實(shí)中葉綠素的降解[J]. 李棟棟,羅自生. 園藝學(xué)報(bào). 2013(10)
博士論文
[1]番茄果膠裂解酶及S-腺苷高半胱氨酸水解酶基因在果實(shí)成熟中的功能研究[D]. 楊璐.重慶大學(xué) 2017
[2]LOB1等轉(zhuǎn)錄因子對(duì)番茄果實(shí)軟化的調(diào)控[D]. 石艷娜.浙江大學(xué) 2017
碩士論文
[1]不同質(zhì)構(gòu)甜瓜果實(shí)成熟軟化的轉(zhuǎn)錄組分析及XTH基因研究[D]. 李三培.天津大學(xué) 2017
[2]基于轉(zhuǎn)錄組學(xué)杏果實(shí)風(fēng)味、色澤品質(zhì)形成相關(guān)基因挖掘及轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)解析[D]. 張秋云.西南大學(xué) 2017
本文編號(hào):3098211
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