基于RNA-seq的紅肉番木瓜果實成熟相關基因的挖掘
發(fā)布時間:2021-03-24 18:50
番木瓜(Carica papaya L.)是番木瓜科(Caricaceae)番木瓜屬多年生草本植物,是熱帶、亞熱帶地區(qū)重要果樹之一。番木瓜屬于呼吸躍變型果實,在采后果實從外觀到內部發(fā)生了一系列變化,如乙烯生成、細胞壁和果膠物質降解、呼吸速率、色澤及揮發(fā)性物質的改變等。RNA-Seq技術是植物功能基因組學研究的重要手段,可以快速獲得高通量的轉錄本序列信息及表達量數據。本文以番木瓜果實為試材,進行了不同成熟期番木瓜果實轉錄組分析,以及果實成熟相關差異表達基因的篩選。主要研究結果如下:1.測定分析了不同成熟期番木瓜果實的果肉硬度、乙烯產量、葉綠素和類胡蘿卜素含量,以及香氣物質成分和含量。番木瓜果實在后熟過程中,果皮顏色由綠變黃,果肉顏色由白變?yōu)槌燃t色;果皮中的葉綠素含量逐漸下降,在果肉中幾乎檢測不到葉綠素;類胡蘿卜素的含量在果皮和果肉中都呈上升趨勢,并且果皮中的類胡蘿素含量始終高于果肉。隨著果實成熟,番木瓜果肉硬度在破色期開始迅速下降;乙烯產量逐漸上升,在半黃期達到最大值。采用頂空-固相微萃取結合GC-MS法分析了3個番木瓜品種的香氣物質,共檢測到68種化合物,分別是2種酸類、11種酮類、5...
【文章來源】:福建農林大學福建省
【文章頁數】:102 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
葉綠素降解代謝途徑[43]
基于 RNA-seq 的紅肉番木瓜果實成熟相關基因的挖掘胡蘿卜素的生物合成的主要途徑[44]。目前,通過生理生的研究,已逐步闡明了類胡蘿卜素的合成代謝過程。茄紅素合成酶)催化兩分子 GGPP(牻牛兒基牻牛兒基類胡蘿卜素—八氫番茄紅素。然后,八氫番茄紅素在氫酶)和 ZDS 酶(ζ-胡蘿卜素脫氫酶)催化下形成番化是類胡蘿卜素生物合成途徑的一個重要分支點,由化酶)和 LCYE(番茄紅素ε-環(huán)化酶)共同催化[45, 46]。LCYE催化下生成δ-胡蘿卜素,繼而在LCYB催化下生卜素在 CHYB 酶(β-胡蘿卜素羥化)和 LUT 酶(ε-環(huán)素[47]。在β分支中,番茄紅素在 LCYB 的作用下先轉化胡蘿卜素;然后在β-胡蘿卜素羥化酶的作用下生成β-隱[48],見圖 1-2。
第一章 前言4 果實香氣物質的代謝及其相關酶酸類、酯類、酮類、醛類、酸類、內酯類、萜類化合物及含硫化合物是番木瓜果實中的主要揮發(fā)性物質。這些化合物均屬于果實的次生產物,一般是以脂肪酸、氨基酸和碳水化合物等作為前體物質,見圖 1-3。揮發(fā)性物質的生物合成過程與脂肪酸、氨基酸等前體物質的數量和組成極為相關[50]。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]獼猴桃PG基因在果實貯藏過程中的表達及其與硬度的關系[J]. 羅靜,郭琳琳,黃玉南,王超,喬成奎,謝漢忠,方金豹. 園藝學報. 2018(05)
[2]中華獼猴桃(Actinidiachinensis Planch)果實香氣成分及相關基因表達[J]. 董婧,劉永勝,唐維. 應用與環(huán)境生物學報. 2018(02)
[3]柑橘果實萜烯類揮發(fā)性物質研究進展[J]. 馮桂蓉,謝姣,鄧麗莉,曾凱芳,姚世響. 食品與機械. 2017(10)
[4]水楊酸處理對采后臺農芒果品質和活性氧代謝的影響[J]. 何俊瑜,任艷芳,劉屹萱,肖子璋,劉進平,吳勝艷. 食品工業(yè)科技. 2016(15)
[5]擴展蛋白在果實成熟過程中的作用研究進展[J]. 趙美榮,李永春,黃文婕. 赤峰學院學報(自然科學版). 2016(11)
[6]園藝作物基因組測序研究進展[J]. 倪曉鵬,高志紅. 江蘇農業(yè)科學. 2016(02)
[7]柿采后丙烯和1–甲基環(huán)丙烯處理對兩個擴展蛋白基因表達的影響[J]. 孫振營,韓葉,李秀芳,馬秋詩,饒景萍. 園藝學報. 2014(06)
[8]RNA-Seq在果樹學研究中的應用[J]. 馮超,朱長青,徐昌杰,陳昆松. 果樹學報. 2014(01)
[9]果實香氣物質的研究進展[J]. 黎源,董濤. 熱帶生物學報. 2013(03)
[10]植物衰老葉片與成熟果實中葉綠素的降解[J]. 李棟棟,羅自生. 園藝學報. 2013(10)
博士論文
[1]番茄果膠裂解酶及S-腺苷高半胱氨酸水解酶基因在果實成熟中的功能研究[D]. 楊璐.重慶大學 2017
[2]LOB1等轉錄因子對番茄果實軟化的調控[D]. 石艷娜.浙江大學 2017
碩士論文
[1]不同質構甜瓜果實成熟軟化的轉錄組分析及XTH基因研究[D]. 李三培.天津大學 2017
[2]基于轉錄組學杏果實風味、色澤品質形成相關基因挖掘及轉錄調控網絡解析[D]. 張秋云.西南大學 2017
本文編號:3098211
【文章來源】:福建農林大學福建省
【文章頁數】:102 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
葉綠素降解代謝途徑[43]
基于 RNA-seq 的紅肉番木瓜果實成熟相關基因的挖掘胡蘿卜素的生物合成的主要途徑[44]。目前,通過生理生的研究,已逐步闡明了類胡蘿卜素的合成代謝過程。茄紅素合成酶)催化兩分子 GGPP(牻牛兒基牻牛兒基類胡蘿卜素—八氫番茄紅素。然后,八氫番茄紅素在氫酶)和 ZDS 酶(ζ-胡蘿卜素脫氫酶)催化下形成番化是類胡蘿卜素生物合成途徑的一個重要分支點,由化酶)和 LCYE(番茄紅素ε-環(huán)化酶)共同催化[45, 46]。LCYE催化下生成δ-胡蘿卜素,繼而在LCYB催化下生卜素在 CHYB 酶(β-胡蘿卜素羥化)和 LUT 酶(ε-環(huán)素[47]。在β分支中,番茄紅素在 LCYB 的作用下先轉化胡蘿卜素;然后在β-胡蘿卜素羥化酶的作用下生成β-隱[48],見圖 1-2。
第一章 前言4 果實香氣物質的代謝及其相關酶酸類、酯類、酮類、醛類、酸類、內酯類、萜類化合物及含硫化合物是番木瓜果實中的主要揮發(fā)性物質。這些化合物均屬于果實的次生產物,一般是以脂肪酸、氨基酸和碳水化合物等作為前體物質,見圖 1-3。揮發(fā)性物質的生物合成過程與脂肪酸、氨基酸等前體物質的數量和組成極為相關[50]。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]獼猴桃PG基因在果實貯藏過程中的表達及其與硬度的關系[J]. 羅靜,郭琳琳,黃玉南,王超,喬成奎,謝漢忠,方金豹. 園藝學報. 2018(05)
[2]中華獼猴桃(Actinidiachinensis Planch)果實香氣成分及相關基因表達[J]. 董婧,劉永勝,唐維. 應用與環(huán)境生物學報. 2018(02)
[3]柑橘果實萜烯類揮發(fā)性物質研究進展[J]. 馮桂蓉,謝姣,鄧麗莉,曾凱芳,姚世響. 食品與機械. 2017(10)
[4]水楊酸處理對采后臺農芒果品質和活性氧代謝的影響[J]. 何俊瑜,任艷芳,劉屹萱,肖子璋,劉進平,吳勝艷. 食品工業(yè)科技. 2016(15)
[5]擴展蛋白在果實成熟過程中的作用研究進展[J]. 趙美榮,李永春,黃文婕. 赤峰學院學報(自然科學版). 2016(11)
[6]園藝作物基因組測序研究進展[J]. 倪曉鵬,高志紅. 江蘇農業(yè)科學. 2016(02)
[7]柿采后丙烯和1–甲基環(huán)丙烯處理對兩個擴展蛋白基因表達的影響[J]. 孫振營,韓葉,李秀芳,馬秋詩,饒景萍. 園藝學報. 2014(06)
[8]RNA-Seq在果樹學研究中的應用[J]. 馮超,朱長青,徐昌杰,陳昆松. 果樹學報. 2014(01)
[9]果實香氣物質的研究進展[J]. 黎源,董濤. 熱帶生物學報. 2013(03)
[10]植物衰老葉片與成熟果實中葉綠素的降解[J]. 李棟棟,羅自生. 園藝學報. 2013(10)
博士論文
[1]番茄果膠裂解酶及S-腺苷高半胱氨酸水解酶基因在果實成熟中的功能研究[D]. 楊璐.重慶大學 2017
[2]LOB1等轉錄因子對番茄果實軟化的調控[D]. 石艷娜.浙江大學 2017
碩士論文
[1]不同質構甜瓜果實成熟軟化的轉錄組分析及XTH基因研究[D]. 李三培.天津大學 2017
[2]基于轉錄組學杏果實風味、色澤品質形成相關基因挖掘及轉錄調控網絡解析[D]. 張秋云.西南大學 2017
本文編號:3098211
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