揚州地區(qū)乙型肝炎病毒不同基因型C基因區(qū)特征及突變分析
發(fā)布時間:2021-03-24 06:23
目的:研究揚州地區(qū)乙型肝炎病毒(hepatitis B virus, HBV)C基因區(qū)的基因特征,分析不同基因型間突變差異,為臨床提供參考。方法:擴(kuò)增HBV核酸C基因區(qū)并測序,Clustal W比對構(gòu)建距離矩陣,MegAlign比對突變位點,分析不同基因型間核苷酸同源性和相似度;比較不同基因型間突變比例和突變頻率間的差異,分析引起血清轉(zhuǎn)換的突變。結(jié)果:測序成功31條序列,基因B型20例,C型11例,總突變率為77.4%,同源相似度分別為:96.1%~99.7%和98.1%~100.0%;基因B型有2例核苷酸G1896A和G1899A聯(lián)合突變;氨基酸替換頻率分別為:8.7/序列、3.3/序列;不同基因型突變比例和氨基酸替換頻率的差異有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=5.10, P=0.023, 95%CI:1.14~49.26;χ2=21.65, P<0.001, 95%CI:1.816~4.650)。結(jié)論:揚州地區(qū)HBV C基因區(qū)同源相似度高,遺傳距離小;HBV突變率高,存在產(chǎn)生血清學(xué)轉(zhuǎn)換的核苷酸聯(lián)合突變株,對病毒免疫學(xué)檢驗產(chǎn)生影響。
【文章來源】:南通大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版). 2020,40(05)
【文章頁數(shù)】:4 頁
【部分圖文】:
基因C區(qū)PCR產(chǎn)物凝膠電泳
研究樣本和參考序列的系統(tǒng)發(fā)生樹
本文編號:3097234
【文章來源】:南通大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版). 2020,40(05)
【文章頁數(shù)】:4 頁
【部分圖文】:
基因C區(qū)PCR產(chǎn)物凝膠電泳
研究樣本和參考序列的系統(tǒng)發(fā)生樹
本文編號:3097234
本文鏈接:http://sikaile.net/kejilunwen/jiyingongcheng/3097234.html
最近更新
教材專著