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志賀菌ipaH基因PCR檢測方法的建立及應(yīng)用

發(fā)布時間:2021-03-17 20:37
  為了掌握青海省4種食源性動物體內(nèi)志賀菌的分布情況,針對志賀菌屬侵襲性質(zhì)?乖璈基因(invasive plasmid,ipaH)設(shè)計1對特異性引物,建立志賀菌的PCR檢測方法,優(yōu)化反應(yīng)體系,檢測該方法的敏感性和特異性,并將該方法應(yīng)用于臨床樣本檢測。結(jié)果表明,建立的PCR方法能特異性擴增志賀菌ipaH基因,而沙門氏菌、大腸桿菌、葡萄球菌、枯草桿菌、變形桿菌等均未擴增出條帶;最低檢測限值為1.8 pg/μL。在臨床樣本檢測中,100株疑似菌株的陽性率為62.00%,其中牦牛源75.00%(3/4),雞源35.29%(12/34),羊源44.44%(8/18),豬源88.64%(39/44);新鮮雞糞和羊糞的陽性率分別為91.67%(11/12)和90.91%(10/11)。這說明試驗所建立的PCR方法具有良好的敏感性和特異性,可應(yīng)用于志賀菌的實驗室診斷;4種動物體內(nèi)均不同程度帶菌,在臨床診斷和治療時不可忽視該菌的致病作用。 

【文章來源】:安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,48(21)

【文章頁數(shù)】:4 頁

【部分圖文】:

志賀菌ipaH基因PCR檢測方法的建立及應(yīng)用


特異性試驗結(jié)果

敏感性,模板,測定儀,濃度


用核酸測定儀測得DNA模板濃度為180 ng/μL,對不同稀釋度的模板進行PCR擴增,當模板濃度達到1.8 pg/μL時可擴增出相應(yīng)條帶,由此可見該PCR檢測方法最低可檢出1.8 pg/μL的志賀菌DNA(圖4)。2.4 臨床樣本檢測

樣本,同源性,菌株,檢出率


運用建立的PCR方法對100株疑似菌株進行檢測,結(jié)果發(fā)現(xiàn)62株菌擴增出目的條帶,檢出率為62.00%。不同動物的檢出率各不相同,牦牛源為75.00%(3/4),雞源為35.29%(12/34),羊源為44.44%(8/18),豬源為88.64%(39/44),且豬源帶菌率明顯高于其他3種動物。對擴增陽性菌株進行測序,測序結(jié)果與鮑氏志賀菌(登錄號CP026865.1)同源性達到96.81%、與痢疾志賀菌(登錄號CP02678.1)同源性達到97.35%、與宋內(nèi)氏志賀菌(登錄號CP037997.1)同源性達到95.22%、與福氏志賀菌(登錄號CP037996.1)同源性達到95.22%,證實該試驗檢出的陽性菌株為志賀菌(圖 5~8)。2.4.2 糞樣樣本中志賀菌的PCR檢測。

【參考文獻】:
期刊論文
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博士論文
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碩士論文
[1]河南省雞腹瀉重要病原菌的分離鑒定與耐藥性及PCR檢測方法的研究[D]. 宋海霞.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010



本文編號:3087683

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