志賀菌ipaH基因PCR檢測(cè)方法的建立及應(yīng)用
發(fā)布時(shí)間:2021-03-17 20:37
為了掌握青海省4種食源性動(dòng)物體內(nèi)志賀菌的分布情況,針對(duì)志賀菌屬侵襲性質(zhì)粒抗原H基因(invasive plasmid,ipaH)設(shè)計(jì)1對(duì)特異性引物,建立志賀菌的PCR檢測(cè)方法,優(yōu)化反應(yīng)體系,檢測(cè)該方法的敏感性和特異性,并將該方法應(yīng)用于臨床樣本檢測(cè)。結(jié)果表明,建立的PCR方法能特異性擴(kuò)增志賀菌ipaH基因,而沙門氏菌、大腸桿菌、葡萄球菌、枯草桿菌、變形桿菌等均未擴(kuò)增出條帶;最低檢測(cè)限值為1.8 pg/μL。在臨床樣本檢測(cè)中,100株疑似菌株的陽性率為62.00%,其中牦牛源75.00%(3/4),雞源35.29%(12/34),羊源44.44%(8/18),豬源88.64%(39/44);新鮮雞糞和羊糞的陽性率分別為91.67%(11/12)和90.91%(10/11)。這說明試驗(yàn)所建立的PCR方法具有良好的敏感性和特異性,可應(yīng)用于志賀菌的實(shí)驗(yàn)室診斷;4種動(dòng)物體內(nèi)均不同程度帶菌,在臨床診斷和治療時(shí)不可忽視該菌的致病作用。
【文章來源】:安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,48(21)
【文章頁數(shù)】:4 頁
【部分圖文】:
特異性試驗(yàn)結(jié)果
用核酸測(cè)定儀測(cè)得DNA模板濃度為180 ng/μL,對(duì)不同稀釋度的模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,當(dāng)模板濃度達(dá)到1.8 pg/μL時(shí)可擴(kuò)增出相應(yīng)條帶,由此可見該P(yáng)CR檢測(cè)方法最低可檢出1.8 pg/μL的志賀菌DNA(圖4)。2.4 臨床樣本檢測(cè)
運(yùn)用建立的PCR方法對(duì)100株疑似菌株進(jìn)行檢測(cè),結(jié)果發(fā)現(xiàn)62株菌擴(kuò)增出目的條帶,檢出率為62.00%。不同動(dòng)物的檢出率各不相同,牦牛源為75.00%(3/4),雞源為35.29%(12/34),羊源為44.44%(8/18),豬源為88.64%(39/44),且豬源帶菌率明顯高于其他3種動(dòng)物。對(duì)擴(kuò)增陽性菌株進(jìn)行測(cè)序,測(cè)序結(jié)果與鮑氏志賀菌(登錄號(hào)CP026865.1)同源性達(dá)到96.81%、與痢疾志賀菌(登錄號(hào)CP02678.1)同源性達(dá)到97.35%、與宋內(nèi)氏志賀菌(登錄號(hào)CP037997.1)同源性達(dá)到95.22%、與福氏志賀菌(登錄號(hào)CP037996.1)同源性達(dá)到95.22%,證實(shí)該試驗(yàn)檢出的陽性菌株為志賀菌(圖 5~8)。2.4.2 糞樣樣本中志賀菌的PCR檢測(cè)。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]貴州地區(qū)紫云花豬腹瀉病原菌的分離鑒定及耐藥性分析[J]. 馬明,方福平,朱喜玲,周中艷. 畜牧與獸醫(yī). 2019(07)
[2]四川部分地區(qū)山羊腹瀉病主要病原菌的分離鑒定及耐藥性檢測(cè)[J]. 張興民,張煥容,毛從劍,彭純良. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2019(04)
[3]不同動(dòng)物源志賀菌的分離鑒定及耐藥性檢測(cè)[J]. 文英. 畜牧與獸醫(yī). 2018(08)
[4]牦牛源鮑氏志賀菌的鑒定及對(duì)BALB/c小鼠的致病性[J]. 冉丹丹,于學(xué)輝,湯承,李鍵,宋定州. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2013(01)
[5]河南省部分地區(qū)雞志賀氏菌病病原分離鑒定及藥敏試驗(yàn)[J]. 楊永珍,許蘭菊,張丹鶴,鄧久虎,苗銀萍,蔣大偉. 河南農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(03)
[6]PCR檢測(cè)糞便中志賀菌[J]. 楊小蓉,趙晉,張?jiān)?薛晴,徐耀方,潘明,何樹森. 預(yù)防醫(yī)學(xué)情報(bào)雜志. 2008(11)
[7]某豬場(chǎng)斷奶腹瀉仔豬致病菌的調(diào)查[J]. 楊雪,郭定宗,祝海寶,吳慶儒,李文波,千國勝. 中國畜牧獸醫(yī). 2007(08)
[8]幼犬志賀氏菌感染的微生物學(xué)診斷[J]. 高鳳山,胡桂學(xué). 安徽農(nóng)學(xué)通報(bào). 2007(03)
[9]集約化兔場(chǎng)高致病性痢疾志賀菌的分離與鑒定[J]. 蔣建軍,王鵬雁,剡根強(qiáng),康立超. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2006(08)
[10]PCR方法檢測(cè)志賀氏菌的研究[J]. 許龍巖,李志勇,王志強(qiáng),翁文川,謝鈞憲. 檢驗(yàn)檢疫科學(xué). 2003(05)
博士論文
[1]牛腸道菌群攜帶耐藥基因分析與志賀菌分離、分型及耐藥性研究[D]. 朱陣.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2018
碩士論文
[1]河南省雞腹瀉重要病原菌的分離鑒定與耐藥性及PCR檢測(cè)方法的研究[D]. 宋海霞.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
本文編號(hào):3087683
【文章來源】:安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,48(21)
【文章頁數(shù)】:4 頁
【部分圖文】:
特異性試驗(yàn)結(jié)果
用核酸測(cè)定儀測(cè)得DNA模板濃度為180 ng/μL,對(duì)不同稀釋度的模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,當(dāng)模板濃度達(dá)到1.8 pg/μL時(shí)可擴(kuò)增出相應(yīng)條帶,由此可見該P(yáng)CR檢測(cè)方法最低可檢出1.8 pg/μL的志賀菌DNA(圖4)。2.4 臨床樣本檢測(cè)
運(yùn)用建立的PCR方法對(duì)100株疑似菌株進(jìn)行檢測(cè),結(jié)果發(fā)現(xiàn)62株菌擴(kuò)增出目的條帶,檢出率為62.00%。不同動(dòng)物的檢出率各不相同,牦牛源為75.00%(3/4),雞源為35.29%(12/34),羊源為44.44%(8/18),豬源為88.64%(39/44),且豬源帶菌率明顯高于其他3種動(dòng)物。對(duì)擴(kuò)增陽性菌株進(jìn)行測(cè)序,測(cè)序結(jié)果與鮑氏志賀菌(登錄號(hào)CP026865.1)同源性達(dá)到96.81%、與痢疾志賀菌(登錄號(hào)CP02678.1)同源性達(dá)到97.35%、與宋內(nèi)氏志賀菌(登錄號(hào)CP037997.1)同源性達(dá)到95.22%、與福氏志賀菌(登錄號(hào)CP037996.1)同源性達(dá)到95.22%,證實(shí)該試驗(yàn)檢出的陽性菌株為志賀菌(圖 5~8)。2.4.2 糞樣樣本中志賀菌的PCR檢測(cè)。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[5]河南省部分地區(qū)雞志賀氏菌病病原分離鑒定及藥敏試驗(yàn)[J]. 楊永珍,許蘭菊,張丹鶴,鄧久虎,苗銀萍,蔣大偉. 河南農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(03)
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[7]某豬場(chǎng)斷奶腹瀉仔豬致病菌的調(diào)查[J]. 楊雪,郭定宗,祝海寶,吳慶儒,李文波,千國勝. 中國畜牧獸醫(yī). 2007(08)
[8]幼犬志賀氏菌感染的微生物學(xué)診斷[J]. 高鳳山,胡桂學(xué). 安徽農(nóng)學(xué)通報(bào). 2007(03)
[9]集約化兔場(chǎng)高致病性痢疾志賀菌的分離與鑒定[J]. 蔣建軍,王鵬雁,剡根強(qiáng),康立超. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2006(08)
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博士論文
[1]牛腸道菌群攜帶耐藥基因分析與志賀菌分離、分型及耐藥性研究[D]. 朱陣.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2018
碩士論文
[1]河南省雞腹瀉重要病原菌的分離鑒定與耐藥性及PCR檢測(cè)方法的研究[D]. 宋海霞.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
本文編號(hào):3087683
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