為揭示HD-ZIP蛋白家族成員在甘藍型油菜全基因組中的分布及相關(guān)特征,通過生物信息學方法共鑒定出74個HD-ZIP轉(zhuǎn)錄因子,分別被定位到甘藍型油菜的19條染色體和8條隨機序列;這74個HD-ZIP蛋白都含有高度保守的HD-ZIP結(jié)構(gòu)域;系統(tǒng)發(fā)育進化樹將該家族成員聚為4大類;共線性分析發(fā)現(xiàn)大部分基因不僅在A和C染色體組間存在共線性,而且在各自染色體組內(nèi)也存在串聯(lián)重復事件;基因表達分析發(fā)現(xiàn),大部分HD-ZIP家族基因在根和葉中均有表達,并且在根中表達的基因多于葉片,受到鹽脅迫處理時,大部分基因表達量會增加。初步明確了甘藍型油菜HD-ZIP家族成員結(jié)構(gòu)特點和相關(guān)功能,為進一步研究甘藍型油菜HD-ZIP蛋白家族基因的生物學功能奠定了基礎(chǔ),為油菜抗性育種工作提供科學依據(jù)。 

【文章來源】：西北農(nóng)業(yè)學報. 2020,29(09)北大核心

【文章頁數(shù)】：13 頁

【部分圖文】：

甘藍型油菜HD-ZIP轉(zhuǎn)錄因子的系統(tǒng)進化發(fā)生樹

甘藍型油菜HD-ZIP家族基因結(jié)構(gòu)

甘藍型油菜HD-ZIP轉(zhuǎn)錄因子進化樹和保守基序

【參考文獻】：
期刊論文
[1]葡萄全基因組DELLA蛋白基因家族鑒定及其應答外源赤霉素調(diào)控葡萄果實發(fā)育的特征[J]. 張文穎,王晨,朱旭東,馬超,王文然,冷翔鵬,鄭婷,房經(jīng)貴.  中國農(nóng)業(yè)科學. 2018(16)
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本文編號：3086403