為揭示HD-ZIP蛋白家族成員在甘藍(lán)型油菜全基因組中的分布及相關(guān)特征,通過生物信息學(xué)方法共鑒定出74個(gè)HD-ZIP轉(zhuǎn)錄因子,分別被定位到甘藍(lán)型油菜的19條染色體和8條隨機(jī)序列;這74個(gè)HD-ZIP蛋白都含有高度保守的HD-ZIP結(jié)構(gòu)域;系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹將該家族成員聚為4大類;共線性分析發(fā)現(xiàn)大部分基因不僅在A和C染色體組間存在共線性,而且在各自染色體組內(nèi)也存在串聯(lián)重復(fù)事件;基因表達(dá)分析發(fā)現(xiàn),大部分HD-ZIP家族基因在根和葉中均有表達(dá),并且在根中表達(dá)的基因多于葉片,受到鹽脅迫處理時(shí),大部分基因表達(dá)量會(huì)增加。初步明確了甘藍(lán)型油菜HD-ZIP家族成員結(jié)構(gòu)特點(diǎn)和相關(guān)功能,為進(jìn)一步研究甘藍(lán)型油菜HD-ZIP蛋白家族基因的生物學(xué)功能奠定了基礎(chǔ),為油菜抗性育種工作提供科學(xué)依據(jù)。 

【文章來源】：西北農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2020,29(09)北大核心

【文章頁數(shù)】：13 頁

【部分圖文】：

甘藍(lán)型油菜HD-ZIP轉(zhuǎn)錄因子的系統(tǒng)進(jìn)化發(fā)生樹

甘藍(lán)型油菜HD-ZIP家族基因結(jié)構(gòu)

甘藍(lán)型油菜HD-ZIP轉(zhuǎn)錄因子進(jìn)化樹和保守基序

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]葡萄全基因組DELLA蛋白基因家族鑒定及其應(yīng)答外源赤霉素調(diào)控葡萄果實(shí)發(fā)育的特征[J]. 張文穎,王晨,朱旭東,馬超,王文然,冷翔鵬,鄭婷,房經(jīng)貴.  中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(16)
[2]甘藍(lán)型油菜HMG基因家族的生物信息學(xué)分析[J]. 李春金,郭媛媛,楊啟航,王彤,王秋梅,馮書燕,胡靜靜,裴巧英,李野默,丁洪玲,宋小明.  中國油料作物學(xué)報(bào). 2018(03)
[3]油菜miR156基因家族及其靶基因生物信息學(xué)分析及鑒定[J]. 李曉康,劉紅芳,劉婧琳,鄭明,華瑋.  中國油料作物學(xué)報(bào). 2018(02)



本文編號(hào)：3086403