櫻桃谷鴨OASL基因全長(zhǎng)cDNA的克隆及其生物信息學(xué)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-03-14 13:40
為了獲得櫻桃谷鴨寡腺苷酸合成酶樣蛋白質(zhì)基因(OASL)全長(zhǎng)cDNA,并且初步了解其生物學(xué)特性,采用RT-PCR和RACE方法從鴨脾臟組織總RNA中擴(kuò)增OASL基因cDNA片段,應(yīng)用生物信息學(xué)方法,系統(tǒng)分析鴨OASL的遺傳進(jìn)化以及蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)、二級(jí)結(jié)構(gòu)和亞細(xì)胞定位。結(jié)果表明,櫻桃谷鴨OASL基因(Gen Bank登錄號(hào):KX255654)全長(zhǎng)1 630 bp,其中包含19 bp的5’UTR(Untranslated region,UTR)、99 bp的3’UTR(Untranslated region,UTR)和PolyA尾巴、1 512 bp的編碼區(qū)(Coding region,CDS),翻譯編碼504個(gè)氨基酸多肽。鴨OASL蛋白具有寡腺苷酸合成酶(OAS)蛋白家族的典型特征,即N端為寡腺苷酸合成酶樣結(jié)構(gòu)域(OAS-like domain,OLD),C端為2個(gè)串聯(lián)的泛素化樣結(jié)構(gòu)域(Ubiquitin-like domains,Ub LDs),不具有信號(hào)肽和跨膜區(qū)。序列比對(duì)和系統(tǒng)進(jìn)化分析結(jié)果表明,OASL氨基酸序列在同種之間比較保守,與已報(bào)道的鴨OASL的同源性高達(dá)100%,與鵝同源...
【文章來源】:江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2017,33(02)北大核心
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【部分圖文】:
鴨和其他物種OASL氨基酸序列的系統(tǒng)進(jìn)化樹
鴨OASL蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)
鴨OASL蛋白質(zhì)相互作用模型
本文編號(hào):3082288
【文章來源】:江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2017,33(02)北大核心
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【部分圖文】:
鴨和其他物種OASL氨基酸序列的系統(tǒng)進(jìn)化樹
鴨OASL蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)
鴨OASL蛋白質(zhì)相互作用模型
本文編號(hào):3082288
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