BvCPD基因編碼細(xì)胞色素P450類固醇側(cè)鏈羥化酶（CYP90）,調(diào)控油菜素甾醇（BRs）的生物合成。為探索BvCPD基因在甜菜生長發(fā)育中的功能,通過HMM和BLAST在甜菜基因組數(shù)據(jù)中檢索P450保守結(jié)構(gòu)域序列,并對其家族成員進(jìn)行分析。結(jié)果表明:共檢測到76個BvCPD家族成員,聚為10個亞組,其中,第Ⅱ亞組的BvCPD家族成員最多（16個）;染色體定位結(jié)果顯示,甜菜9條染色體上均有BvCPD基因分布,其中第7條染色體上分布最多,但仍有10個家族成員尚未明確定位;BvCPD蛋白共有10個保守性模體,模體2和模體7存在于所有BvCPD家族成員中。進(jìn)一步對BvCPD家族成員中的Bv2_qyup進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),該基因編碼473個氨基酸,相對分子量為54.11 kDa,等電點(diǎn)為8.85,其編碼的蛋白二級結(jié)構(gòu)以α-螺旋和無規(guī)則卷曲為主,可能定位于細(xì)胞質(zhì)中,是一種含信號肽的親水跨膜蛋白,存在44個磷酸化位點(diǎn);同源多重比對發(fā)現(xiàn),Bv2_qyup與藜麥、菠菜、毛果楊、黃瓜和擬南芥CPD的同源性較高。研究結(jié)果將為BvCPD基因克隆和功能鑒定提供理論依據(jù)。 

【文章來源】：中國糖料. 2020,42(04)

【文章頁數(shù)】：9 頁

【部分圖文】：

CPD基因家族系統(tǒng)進(jìn)化樹分析

CPD家族蛋白保守性模體分布

BvCPD家族成員的染色體分布

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]大豆GmGRF5基因的組織表達(dá)模式與生物信息學(xué)分析[J]. 徐思遠(yuǎn),劉志雄,張曉玫.  分子植物育種. 2020(05)
[2]玉米油菜素甾醇生物合成關(guān)鍵酶基因ZmCYP90B1的克隆及其對逆境脅迫的響應(yīng)[J]. 段方猛,羅秋蘭,魯雪莉,齊娜偉,劉憲舜,宋雯雯.  作物學(xué)報. 2018(03)
[3]IL-6基因結(jié)構(gòu)和功能生物信息學(xué)預(yù)測[J]. 于欣,楊震,楚元奎,張怡清,于美玲.  國際檢驗醫(yī)學(xué)雜志. 2016(21)
[4]楊樹細(xì)胞色素P450類固醇單加氧酶（CYP90）基因的克隆與分析（英文）[J]. 王新宇,王崇英,Olof Olsson.  遺傳學(xué)報. 2005(04)

博士論文
[1]甜菜（Beta vulgaris L.）塊根發(fā)育的轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析及BvDof基因的克隆與功能研究[D]. 張永豐.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]馬鈴薯油菜素內(nèi)酯合成限速酶基因StCPD和StDWF4對干旱和鹽脅迫的響應(yīng)[D]. 周香艷.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[3]GmBRI1和GmCPD基因的克隆及在大豆開花過程中的功能研究[D]. 王妙.吉林大學(xué) 2015

碩士論文
[1]中國櫻桃花芽油菜素內(nèi)酯合成相關(guān)基因克隆與功能分析[D]. 劉偉娜.浙江師范大學(xué) 2016
[2]胡楊BR生物合成酶基因PeCPD功能的研究[D]. 徐多榮.蘭州大學(xué) 2014
[3]棉花油菜素內(nèi)酯合成酶基因GaCPD的克隆及功能分析[D]. 魯麗麗.河南工業(yè)大學(xué) 2014
[4]利用RNAi研究胡楊油菜素內(nèi)酯合成酶基因CPD的功能[D]. 陳劍峰.蘭州大學(xué) 2012



本文編號：3080824