紅樹林是處于熱帶、亞熱帶陸地與海洋過渡帶的特殊生態(tài)系統(tǒng)。紅樹物種“秋茄（Kandelia obovata）”在我國自然分布緯度的最北端位于福建省福鼎市,是我國最耐寒的紅樹物種。研究低溫脅迫對秋茄的影響為紅樹植物品種向北種植和紅樹植物抗寒性研究具有十分重要的意義。目前的研究關(guān)于秋茄低溫脅迫及抗寒研究較多集中在生理生態(tài)水平,較少從轉(zhuǎn)錄組、分子水平上研究低溫脅迫對秋茄影響分子機制。本文將實驗室培養(yǎng)1年生的秋茄進行25℃常溫培養(yǎng)和5℃低溫脅迫培養(yǎng)4 d。利用轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)以及生物學(xué)信息方法分析秋茄應(yīng)對低溫脅迫的分子機制。本研究取得的主要結(jié)果和結(jié)論如下:1.利用Illumina高通量測序平臺進行雙端測序。對秋茄常溫條件和低溫脅迫下的六組轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進行原始數(shù)據(jù)過濾得到161,275,740條clean reads。對轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果進行參考基因組比對,比對率均高于94%。通過基因差異表達分析,結(jié)果得到474個顯著上調(diào)表達基因和892個顯著下調(diào)表達基因。2.通過比對秋茄長時間低溫脅迫與常溫條件的基因表達分析發(fā)現(xiàn),差異表達基因主要富集在植物晝夜節(jié)律、植物激素傳導(dǎo)通路和植物次級代謝相關(guān)等途徑。（1）秋茄通... 

【文章來源】：廈門大學(xué)福建省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：95 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖１－１可變剪切形式??Ｆｉｇ．?１－１?Ｔｙｐｅｓ?ｏｆ?ａｌｔｅｒｎａｔｉｖｅ?ｓｐｌｉｃｉｎｇ??

圖１－２技術(shù)流程??Ｆｉｇ．?１－２?Ｔｅｃｈｆｌｏｗ??

圖２－１數(shù)據(jù)分析流程??Ｆｉｇ．?２－１?Ａｎａｌｙｓｅｓ?ｗｏｒｋｆｌｏｗ??

【參考文獻】：
期刊論文
[1]植物應(yīng)答非生物脅迫信號傳導(dǎo)研究進展[J]. 劉鈴,武小龍,諸葛強.  分子植物育種. 2018(02)
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[3]紅樹林耐寒性和向海性生態(tài)系列對氣候變化響應(yīng)的研究進展[J]. 陳鷺真,鄭文教,楊盛昌,王文卿,張宜輝.  廈門大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2017(03)
[4]植保素及其在增強作物抗性中的作用[J]. 陳東菊,安敏敏,李麗蘭,方繼朝,劉永鋒,羅玉明,楊立明.  分子植物育種. 2017(02)
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[7]2008年南方低溫對我國紅樹植物的破壞作用[J]. 陳鷺真,王文卿,張宜輝,黃麗,趙春磊,楊盛昌,楊志偉,陳粵超,徐華林,鐘才榮,蘇博,方柏州,陳乃明,曾傳志,林光輝.  植物生態(tài)學(xué)報. 2010(02)
[8]Effect of soil salinity on cold tolerance of mangrove Kandelia candel[J]. 楊盛昌,李云波,林鵬.  Chinese Journal of Oceanology and Limnology. 2005(01)
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博士論文
[1]玉米苗期鹽脅迫響應(yīng)轉(zhuǎn)錄本表達譜構(gòu)建[D]. 丁冬.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008

碩士論文
[1]甘藍型油菜響應(yīng)低硼脅迫差異剪接基因的研究[D]. 谷金.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016



本文編號：3079770