紅樹林是處于熱帶、亞熱帶陸地與海洋過渡帶的特殊生態(tài)系統(tǒng)。紅樹物種“秋茄（Kandelia obovata）”在我國自然分布緯度的最北端位于福建省福鼎市,是我國最耐寒的紅樹物種。研究低溫脅迫對秋茄的影響為紅樹植物品種向北種植和紅樹植物抗寒性研究具有十分重要的意義。目前的研究關(guān)于秋茄低溫脅迫及抗寒研究較多集中在生理生態(tài)水平,較少從轉(zhuǎn)錄組、分子水平上研究低溫脅迫對秋茄影響分子機(jī)制。本文將實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)1年生的秋茄進(jìn)行25℃常溫培養(yǎng)和5℃低溫脅迫培養(yǎng)4 d。利用轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)以及生物學(xué)信息方法分析秋茄應(yīng)對低溫脅迫的分子機(jī)制。本研究取得的主要結(jié)果和結(jié)論如下:1.利用Illumina高通量測序平臺(tái)進(jìn)行雙端測序。對秋茄常溫條件和低溫脅迫下的六組轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行原始數(shù)據(jù)過濾得到161,275,740條clean reads。對轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果進(jìn)行參考基因組比對,比對率均高于94%。通過基因差異表達(dá)分析,結(jié)果得到474個(gè)顯著上調(diào)表達(dá)基因和892個(gè)顯著下調(diào)表達(dá)基因。2.通過比對秋茄長時(shí)間低溫脅迫與常溫條件的基因表達(dá)分析發(fā)現(xiàn),差異表達(dá)基因主要富集在植物晝夜節(jié)律、植物激素傳導(dǎo)通路和植物次級代謝相關(guān)等途徑。（1）秋茄通... 

【文章來源】：廈門大學(xué)福建省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：95 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖１－１可變剪切形式??Ｆｉｇ．?１－１?Ｔｙｐｅｓ?ｏｆ?ａｌｔｅｒｎａｔｉｖｅ?ｓｐｌｉｃｉｎｇ??

圖１－２技術(shù)流程??Ｆｉｇ．?１－２?Ｔｅｃｈｆｌｏｗ??

圖２－１數(shù)據(jù)分析流程??Ｆｉｇ．?２－１?Ａｎａｌｙｓｅｓ?ｗｏｒｋｆｌｏｗ??

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]植物應(yīng)答非生物脅迫信號傳導(dǎo)研究進(jìn)展[J]. 劉鈴,武小龍,諸葛強(qiáng).  分子植物育種. 2018(02)
[2]植物次生代謝產(chǎn)物-酚類化合物的研究進(jìn)展[J]. 華曉雨,陶爽,孫盛楠,郭娜,閻秀峰,藺吉祥.  生物技術(shù)通報(bào). 2017(12)
[3]紅樹林耐寒性和向海性生態(tài)系列對氣候變化響應(yīng)的研究進(jìn)展[J]. 陳鷺真,鄭文教,楊盛昌,王文卿,張宜輝.  廈門大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2017(03)
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[5]植物內(nèi)源激素研究進(jìn)展[J]. 段娜,賈玉奎,徐軍,陳海玲,孫鵬.  中國農(nóng)學(xué)通報(bào). 2015(02)
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[8]Effect of soil salinity on cold tolerance of mangrove Kandelia candel[J]. 楊盛昌,李云波,林鵬.  Chinese Journal of Oceanology and Limnology. 2005(01)
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博士論文
[1]玉米苗期鹽脅迫響應(yīng)轉(zhuǎn)錄本表達(dá)譜構(gòu)建[D]. 丁冬.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008

碩士論文
[1]甘藍(lán)型油菜響應(yīng)低硼脅迫差異剪接基因的研究[D]. 谷金.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016



本文編號：3079770