楊屬,作為具有重要經(jīng)濟(jì)和生態(tài)價值的落葉喬木樹種,其分布覆蓋整個北半球樹木分布的臨界范圍。不同楊屬樹種基因組全序列的測定,為通過比較關(guān)鍵等位基因的變異來研究不同楊屬樹種對不同環(huán)境的適應(yīng)機(jī)制提供了基礎(chǔ)。本研究以毛果楊基因組為參照序列共設(shè)計64對特異性引物,對楊屬29個樹種Na⁺/H⁺逆向轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因家族（10個基因）進(jìn)行全長PCR擴(kuò)增,運(yùn)用CodonCode Aligner軟件對序列數(shù)據(jù)進(jìn)行校對;通過PAML計算來檢測目的基因是否在不同樹種間發(fā)生了結(jié)構(gòu)變異和適應(yīng)性進(jìn)化;用DnaSP、MEGA和ARLEQUIN等軟件進(jìn)行DNA多態(tài)性分析,計算每個種的單倍型遺傳多樣性,并通過HKA和MKPRF等軟件對數(shù)據(jù)進(jìn)行計算和中性檢驗(yàn),揭示Na⁺/H⁺逆向轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因家族在楊屬種間的分子進(jìn)化機(jī)制。結(jié)果表明:白楊組的NHX5基因和胡楊組的NHX6、SOS1基因能夠檢測到正選擇信號;Na⁺/H⁺逆向轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白家族基因在胡楊和灰楊野生群體中普遍經(jīng)歷了適應(yīng)性進(jìn)化。同時,研究發(fā)現(xiàn)胡楊組的... 

【文章來源】：蘭州大學(xué)甘肅省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

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【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
中文摘要
Abstract
前言
    1.1 楊屬樹種的系統(tǒng)發(fā)育
    1.2 正選擇
    1.3 基因重復(fù)
+/H⁺ 逆向轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因家族">    1.4 Na⁺/H⁺ 逆向轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因家族
    1.5 本研究的意義
+/H⁺逆向轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白在楊屬種間的進(jìn)化">第二章 Na⁺/H⁺逆向轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白在楊屬種間的進(jìn)化
    2.1 材料與方法
        2.1.1 材料
        2.1.2 引物設(shè)計
        2.1.3 楊屬基因組DNA提取及凝膠電泳
        2.1.4 基因片段的擴(kuò)增
    2.2 數(shù)據(jù)整理與分析
        2.2.1 序列校對
        2.2.2 數(shù)據(jù)分析
    2.3 結(jié)果
        2.3.1 位點(diǎn)模型檢驗(yàn)
        2.3.2 分枝模型檢驗(yàn)
        2.3.3 分枝位點(diǎn)模型檢驗(yàn)
    2.4 討論
+/H⁺逆向轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白在胡楊、灰楊中的自然選擇">第三章 Na⁺/H⁺逆向轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白在胡楊、灰楊中的自然選擇
    3.1 實(shí)驗(yàn)材料與方法
        3.1.1 材料收集以及樣品數(shù)量的確定
        3.1.2 引物設(shè)計與篩選
    3.2 數(shù)據(jù)處理與分析
        3.2.1 數(shù)據(jù)處理
        3.2.2 數(shù)據(jù)分析
    3.3 結(jié)果
        3.3.1 核苷酸多態(tài)性
        3.3.2 多態(tài)性與差異性
    3.4 討論
        3.4.1 遺傳多樣性與種群分化
        3.4.2 自然選擇
第四章 胡楊SOS1基因重復(fù)與功能互補(bǔ)
    4.1 實(shí)驗(yàn)材料及儀器
        4.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        4.1.2 試劑
        4.1.3 酶與試劑盒
        4.1.4 質(zhì)粒與菌株
        4.1.5 實(shí)驗(yàn)儀器
    4.2 實(shí)驗(yàn)方法
        4.2.1 胡楊RNA的提取
        4.2.2 反轉(zhuǎn)錄
        4.2.3 胡楊SOS1b的擴(kuò)增及膠回收
        4.2.4 胡楊SOS1b的連接、轉(zhuǎn)化、測序及鑒定
        4.2.5 表達(dá)載體的構(gòu)建
        4.2.6 胡楊SOS1b功能互補(bǔ)分析
    4.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
        4.3.1 胡楊總RNA的提取
        4.3.2 PeSOS1b基因克隆與篩選
        4.3.3 表達(dá)載體的構(gòu)建與鑒定
        4.3.4 生長曲線的測定
    4.4 討論
第五章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
碩士期間發(fā)表論文
致謝


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]植物進(jìn)化中的正選擇作用[J]. 高遠(yuǎn),田李,秦松.  植物學(xué)通報. 2008(04)
[2]用ITS序列研究楊屬各組之間的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系[J]. 史全良,諸葛強(qiáng),黃敏仁,王明庥.  植物學(xué)報. 2001(03)
[3]大青楊及其近緣種的遺傳變異和系統(tǒng)關(guān)系研究[J]. 蘇曉華,張綺紋,張望東,卞祖嫻.  林業(yè)科學(xué). 1996(02)
[4]世界楊柳科植物的起源、分化和地理分布[J]. 丁托婭.  云南植物研究. 1995(03)

博士論文
[1]川西青楊組（Section Tacamahaca Spach）不同種的親緣關(guān)系分析[D]. 陳珂.中國科學(xué)院研究生院（成都生物研究所） 2007
[2]楊屬AFLP遺傳多樣性研究和楊樹品種分子指紋圖譜構(gòu)建[D]. 宋紅竹.中國林業(yè)科學(xué)研究院 2006



本文編號：3075687