Alternaria altrenata誘導(dǎo)下紅棗抗黑斑病基因的轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-03-09 14:50
南疆紅棗黑斑病的發(fā)生,嚴(yán)重影響了當(dāng)?shù)剞r(nóng)民增收致富,阻礙了棗產(chǎn)業(yè)的可持續(xù)健康發(fā)展。當(dāng)前,眾多學(xué)者對(duì)該病害的防治主要從病原菌的形態(tài)結(jié)構(gòu)及生理生化性質(zhì)方面展開,從分子水平方面鮮有報(bào)道。因此,本文嘗試探究并分析紅棗在鏈格孢菌(Alternaria altrenata)誘導(dǎo)后轉(zhuǎn)錄組水平下的差異變化,挖掘與紅棗黑斑病抗性相關(guān)的功能基因,從分子角度探究紅棗果實(shí)中關(guān)鍵基因的調(diào)控,為該病害的防治奠定分子理論基礎(chǔ)。1.通過探究導(dǎo)致南疆紅棗黑斑病的主要病原菌,為后續(xù)抗病基因的精準(zhǔn)篩選和靶標(biāo)防治奠定基礎(chǔ)。本文以灰棗和駿棗果實(shí)為試驗(yàn)材料,采用高通量測(cè)序技術(shù)和傳統(tǒng)分離鑒定相結(jié)合的方法,以喀什、和田和阿克蘇3個(gè)地區(qū)患病果實(shí)進(jìn)行發(fā)病率調(diào)查統(tǒng)計(jì)分析、組織分離、形態(tài)學(xué)觀察、分子生物學(xué)分析和病理學(xué)接種試驗(yàn)為結(jié)果依據(jù),明確導(dǎo)致南疆紅棗黑斑病的主要病原菌是鏈格孢菌(A.alternata);駿棗田間患病率比灰棗高出9.4倍,灰棗比駿棗抗病性強(qiáng)。2.為從分子水平研究紅棗果實(shí)在鏈格孢菌誘導(dǎo)下的應(yīng)答機(jī)制,篩選出抗病基因。以轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)為基礎(chǔ)對(duì)A.alternata侵染0-4 d的灰棗和駿棗果實(shí)進(jìn)行測(cè)定,分析其差異基因表達(dá)及相關(guān)代謝...
【文章來源】:塔里木大學(xué)新疆維吾爾自治區(qū)
【文章頁(yè)數(shù)】:72 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
不同紅棗品種患病率統(tǒng)計(jì)
DNA提取檢測(cè)圖
塔里木大學(xué)碩士學(xué)位論文第2章紅棗黑斑病病原菌的分離與鑒定15為進(jìn)一步探究病原菌的種水平情況,將相對(duì)豐度排名前10的菌屬放入真菌數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì),進(jìn)行種水平OTUs數(shù)量的統(tǒng)計(jì),結(jié)果顯示unclassifiedAlternaria的相對(duì)豐度占98%以上(如表2-6),推測(cè)數(shù)據(jù)庫(kù)中數(shù)據(jù)信息有限,無法準(zhǔn)確鑒定至種水平,需通過分子生物學(xué)技術(shù)進(jìn)行種水平的探究。圖2-3各水平分類單元統(tǒng)計(jì)圖Figure2-3Statisticsoftaxaatvariouslevels注:J1:喀什地區(qū),J2:和田地區(qū),J3:阿克蘇地區(qū);下同Note:J1:Kashiarea,J2:Hetianarea,J3:Aksuarea;thesamebelow表2-5phylum水平的OTU數(shù)Table2-5NumberofOTUsatphylumlevelPhylumTaxonJ1J2J3OTUsRelativeabundance(%)OTUsRelativeabundance(%)OTUsRelativeabundance(%)Ascomycota7187199.98%7116898.15%7186599.92%Basidiomycota00%240.03%5(6.95E-5)%Mortierellomycota3(4.17E-5)%00%00%unclassified_Fungi00%4(4.56E-5)%00%unidentified00%6780.94%4(4.17E-5)%
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]蕓薹根腫菌侵染早期甘藍(lán)型油菜轉(zhuǎn)錄組分析[J]. 羅延青,王云月,俎峰,符明聯(lián),趙凱琴,張?jiān)圃?王敬喬,田正書,陳葦,李勁峰,原小燕,李根澤. 中國(guó)油料作物學(xué)報(bào). 2019(03)
[2]棗黑斑病防治措施的探究[J]. 王鵬程,王蘭,董力暢. 新疆農(nóng)墾科技. 2019(01)
[3]基于新一代高通量測(cè)序技術(shù)分析拮抗酵母Cryptoccocus laurentii誘導(dǎo)處理櫻桃番茄果實(shí)后轉(zhuǎn)錄組學(xué)的變化[J]. 唐瓊,鄭曉冬. 食品科學(xué). 2019(18)
[4]轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)篩選安徽烏菜與普通白菜的差異表達(dá)基因[J]. 王明霞,田紅梅,江海坤,賈利,王艷,方凌. 中國(guó)蔬菜. 2018(12)
[5]應(yīng)用高通量測(cè)序技術(shù)研究新疆產(chǎn)區(qū)葡萄果實(shí)、葉片及果園土壤微生物多樣性[J]. 魏玉潔,鄒彎,馬文瑞,閆寅卓,武運(yùn),薛潔. 食品科學(xué). 2018(06)
[6]阿拉爾墾區(qū)紅棗黑斑病影響因素調(diào)查及綠色防控建議[J]. 陳存紅,王蘭. 新疆農(nóng)墾科技. 2017(06)
[7]南疆駿棗黑斑病癥狀表現(xiàn)及病原菌鑒定[J]. 董寧,馮宏祖,王蘭,紀(jì)顯洪,于絲絲. 植物保護(hù)學(xué)報(bào). 2016(06)
[8]新疆紅棗黑斑病病原菌鑒定及拮抗細(xì)菌篩選[J]. 包慧芳,王寧,侯敏. 新疆農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(09)
[9]大巖桐花萼和幼葉轉(zhuǎn)錄組研究[J]. 費(fèi)元,韓雪,余紅,龐基良. 園藝學(xué)報(bào). 2015(12)
[10]南疆駿棗黑斑病病原菌的分離、鑒定及控制研究[J]. 郭東起,蔣卉,牛寧寧,楊保求. 中國(guó)植保導(dǎo)刊. 2015(12)
碩士論文
[1]黃瓜產(chǎn)量雜種優(yōu)勢(shì)的轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析[D]. 趙陽.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
本文編號(hào):3073026
【文章來源】:塔里木大學(xué)新疆維吾爾自治區(qū)
【文章頁(yè)數(shù)】:72 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
不同紅棗品種患病率統(tǒng)計(jì)
DNA提取檢測(cè)圖
塔里木大學(xué)碩士學(xué)位論文第2章紅棗黑斑病病原菌的分離與鑒定15為進(jìn)一步探究病原菌的種水平情況,將相對(duì)豐度排名前10的菌屬放入真菌數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì),進(jìn)行種水平OTUs數(shù)量的統(tǒng)計(jì),結(jié)果顯示unclassifiedAlternaria的相對(duì)豐度占98%以上(如表2-6),推測(cè)數(shù)據(jù)庫(kù)中數(shù)據(jù)信息有限,無法準(zhǔn)確鑒定至種水平,需通過分子生物學(xué)技術(shù)進(jìn)行種水平的探究。圖2-3各水平分類單元統(tǒng)計(jì)圖Figure2-3Statisticsoftaxaatvariouslevels注:J1:喀什地區(qū),J2:和田地區(qū),J3:阿克蘇地區(qū);下同Note:J1:Kashiarea,J2:Hetianarea,J3:Aksuarea;thesamebelow表2-5phylum水平的OTU數(shù)Table2-5NumberofOTUsatphylumlevelPhylumTaxonJ1J2J3OTUsRelativeabundance(%)OTUsRelativeabundance(%)OTUsRelativeabundance(%)Ascomycota7187199.98%7116898.15%7186599.92%Basidiomycota00%240.03%5(6.95E-5)%Mortierellomycota3(4.17E-5)%00%00%unclassified_Fungi00%4(4.56E-5)%00%unidentified00%6780.94%4(4.17E-5)%
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]蕓薹根腫菌侵染早期甘藍(lán)型油菜轉(zhuǎn)錄組分析[J]. 羅延青,王云月,俎峰,符明聯(lián),趙凱琴,張?jiān)圃?王敬喬,田正書,陳葦,李勁峰,原小燕,李根澤. 中國(guó)油料作物學(xué)報(bào). 2019(03)
[2]棗黑斑病防治措施的探究[J]. 王鵬程,王蘭,董力暢. 新疆農(nóng)墾科技. 2019(01)
[3]基于新一代高通量測(cè)序技術(shù)分析拮抗酵母Cryptoccocus laurentii誘導(dǎo)處理櫻桃番茄果實(shí)后轉(zhuǎn)錄組學(xué)的變化[J]. 唐瓊,鄭曉冬. 食品科學(xué). 2019(18)
[4]轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)篩選安徽烏菜與普通白菜的差異表達(dá)基因[J]. 王明霞,田紅梅,江海坤,賈利,王艷,方凌. 中國(guó)蔬菜. 2018(12)
[5]應(yīng)用高通量測(cè)序技術(shù)研究新疆產(chǎn)區(qū)葡萄果實(shí)、葉片及果園土壤微生物多樣性[J]. 魏玉潔,鄒彎,馬文瑞,閆寅卓,武運(yùn),薛潔. 食品科學(xué). 2018(06)
[6]阿拉爾墾區(qū)紅棗黑斑病影響因素調(diào)查及綠色防控建議[J]. 陳存紅,王蘭. 新疆農(nóng)墾科技. 2017(06)
[7]南疆駿棗黑斑病癥狀表現(xiàn)及病原菌鑒定[J]. 董寧,馮宏祖,王蘭,紀(jì)顯洪,于絲絲. 植物保護(hù)學(xué)報(bào). 2016(06)
[8]新疆紅棗黑斑病病原菌鑒定及拮抗細(xì)菌篩選[J]. 包慧芳,王寧,侯敏. 新疆農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(09)
[9]大巖桐花萼和幼葉轉(zhuǎn)錄組研究[J]. 費(fèi)元,韓雪,余紅,龐基良. 園藝學(xué)報(bào). 2015(12)
[10]南疆駿棗黑斑病病原菌的分離、鑒定及控制研究[J]. 郭東起,蔣卉,牛寧寧,楊保求. 中國(guó)植保導(dǎo)刊. 2015(12)
碩士論文
[1]黃瓜產(chǎn)量雜種優(yōu)勢(shì)的轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析[D]. 趙陽.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
本文編號(hào):3073026
本文鏈接:http://sikaile.net/kejilunwen/jiyingongcheng/3073026.html
最近更新
教材專著