目的:通過對維吾爾族飼鴿者肺全基因組DNA的篩選,得到異常甲基化基因,從而為飼鴿者肺的發(fā)生機(jī)制研究提供依據(jù)。方法:根據(jù)納入及排除標(biāo)準(zhǔn)收集病例資料及血樣標(biāo)本（總納入12例,其中患病組A組4例,陰性對照組B組4例,正常對照組C組4例）,對所取全血標(biāo)本進(jìn)行DNA提取,在Illumina Human Methylation 450K甲基化芯片技術(shù)的支持下對提取DNA進(jìn)行甲基化檢測,篩選DNA異常甲基化基因。結(jié)果:（1）A vs B:共計(jì)226個(gè)CpG位點(diǎn)在甲基化水平上存在差異,有138個(gè)差異甲基化基因數(shù)目。GO分析列出21個(gè)差異的基因功能類別條目。KEGG通路的功能注解與分析后得到9個(gè)差異甲基化基因通路。（2）B vs C:共計(jì)260個(gè)CpG位點(diǎn)在甲基化水平上存在差異,有140個(gè)差異甲基化基因數(shù)目。GO分析僅列出1個(gè)差異的基因功能類別條目。KEGG通路的功能注解與分析后得到1個(gè)差異甲基化基因通路。（3）B vs C:共計(jì)243個(gè)CpG位點(diǎn)在甲基化水平上存在差異,有109個(gè)差異甲基化基因數(shù)目。GO分析列出3個(gè)差異的基因功能類別條目。KEGG通路的功能注解與分析后沒有得到差異甲基化基因通路。（4）... 

【文章來源】：新疆醫(yī)科大學(xué)新疆維吾爾自治區(qū)

【文章頁數(shù)】：60 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

實(shí)驗(yàn)流程Fig.1Experimentalprocess

醫(yī)院確診的 4 例飼鴿者肺患者為病例組（A 組照組（B 組）4 例，為維吾爾族飼養(yǎng)鴿子時(shí)間在現(xiàn)的維吾爾族人；正常對照組（C 組）為 4 例其中對照組 4 例，年齡、性別、籍貫等均病例）、陰性對照組(B 組)及健康對照組(C析分析，在 Illumina 甲基化 HM450K BeadChip 礎(chǔ)之上實(shí)現(xiàn)背景數(shù)值校正預(yù)處理，之后對探針在對原始甲基化數(shù)據(jù)進(jìn)行基礎(chǔ)處理之后，用各關(guān)系數(shù)(Pearson Correlation Coefficiency, PCC)，基化譜相關(guān)性進(jìn)行分析，對 A、B、C 三組兩兩都有較高的相關(guān)性，這在一定程度上表明樣本。除此之外，對三組的探針進(jìn)行統(tǒng)計(jì)，得到平照組之間的聯(lián)系進(jìn)行明確，最終的結(jié)果證明患關(guān)性檢驗(yàn) P=2.2e-16），見圖 4，圖 5，圖 6。

圖 5 病例組與健康對照組甲基化程度全基因相關(guān)性ip between the case group and the healthy control group wmethylation whole gene（相關(guān)性檢驗(yàn) P=2.2e-16，PCC=0.9968）

【參考文獻(xiàn)】：
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碩士論文
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本文編號：3072742